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            技術(shù)文章

            phenol/chloroform 進(jìn)行DNA 萃取

            閱讀:676          發(fā)布時間:2010-12-18
             
            儀器用具:微量離心機(jī)
             
            藥品試劑:
            Plasmid DNA 酵解產(chǎn)物: #1 (pBlueGus/HindIII), #2 (pBlueGus/BamHI);Phenol/chloroform/isoamyl alcohol (25:24:1) 以下簡稱為PCI;Chloroform/isoamyl alcohol (24:1) 以下簡稱為CI;3 M NaOAc (醋酸鈉pH 5.2);純酒精及70%酒精
             
            方法步驟:
            ◆ 注意!進(jìn)行這一部份實驗的前,請先確定pBlueGus/HindIII 與pBlueGus/BamHI 兩者的酵解反應(yīng)都已經(jīng)*。
            1) 于酵解反應(yīng) #1 與 #2 的微量離心管分別加入182 μL 去離子水。
            2) 以200 μL PCI 萃取一次,亦即加入PCI 后,以Vortex 震蕩混合,并在室溫離心3 min。
            3) 以微量移液器P200 將上層液移至新的微量離心管。
            4) 加入等體積的CI,以Vortex 充分震蕩混合,并在室溫離心3 min。
            5) 以微量移液器P200 將上層液移至新的微量離心管。
            6) 加入0.1 倍體積的3 M NaOAc (pH 5.2) 及2.5 倍體積酒精。
            7) 置于 -20℃過夜,或于 -80℃放置30 min,以便沉淀DNA。
            隔天:
            1) 自冷凍柜取出微量離心管,以14,000 rpm 離心10 min。
            ?? 注意: 請利用這一段時間參照『基本操作技術(shù)』所描述的步驟準(zhǔn)備一片1.2%洋菜膠體。 Ethidium bromide 是一種強(qiáng)力致癌物質(zhì),嚴(yán)禁戴著手套到處亂摸!
            2) 小心地倒出上清液。
            3) 徐徐加入0.5 mL的70%酒精 (預(yù)先放在 -20℃預(yù)冷)。小心不要動到DNA沈淀。
            4) 以14,000 rpm 低溫離心5 min 的后,倒去上清液,并將微量離心管倒置于一張干凈的衛(wèi)生紙上30 min,以便風(fēng)干DNA。也可以用SpeedVac 干燥DNA,但應(yīng)小心處理,以免DNA 沉淀不見了。
            5) 以10 μL dH2O/DEPC溶解DNA。
            6) 依照下表,自pBlueGus/BamHI 與pBlueGus/HindIII 各取1 μL DNA 以洋菜膠體電泳進(jìn)行分析,并估算其濃度。
            ?? DNA 濃度的估算請以 ??DNA/HindIII 量為參考值。

            質(zhì)體DNA 酵解反應(yīng)與洋菜膠體電泳分析 Southern 轉(zhuǎn)印分析
            大腸桿菌抽取RNA 重組質(zhì)體的限制酶分析
            Random priming 胞外轉(zhuǎn)錄反應(yīng) (in vitro transcription)
            以DIG 標(biāo)定核酸探針 以phenol/chloroform 進(jìn)DNA 萃取

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