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高通量測序技術的發(fā)展趨勢
閱讀：2000 發(fā)布時間：2011-9-8| 摘要： 生物通報道 在本期的《Genetic Engineering & Biotechnology News》雜志上，Harry Glorikian 和Brian Clancy盤點了他們認為值得關注的測序趨勢，包括測序活動的兩極化、流程價值的轉(zhuǎn)變，以及臨床和商業(yè)應用。 |
生物通報道 在本期的《Genetic Engineering & Biotechnology News》雜志上，Harry Glorikian 和Brian Clancy盤點了他們認為值得關注的測序趨勢，包括測序活動的兩極化、流程價值的轉(zhuǎn)變，以及臨床和商業(yè)應用。 首先，他們談到了測序活動的兩極化，即zui大和zui小實驗室所開展的高通量測序活動的份額正在逐步增加，這是由一系列同時存在的集中和分散力量驅(qū)動的。zui重要的集中力量是研究協(xié)作組的出現(xiàn)，他們試圖對大量人及其他物種的基因組進行測序和分析，目標是發(fā)現(xiàn)新的變異體，并探索它們對于人類健康的意義。他們認為，出現(xiàn)這種趨勢的原因是分析大量基因組的經(jīng)濟性。隨著樣品的增多，樣品制備、測序本身以及后續(xù)分析的成本有下降的趨勢。 歡迎索取GS Junior系統(tǒng)的更多資料！
而作者認為，分散測序行為的力量則更多更復雜。討論zui多的力量是臺式高通量測序儀的出現(xiàn)（即生物通近日報道的個人型測序儀），它們的價格與儀器要低得多。這種新興儀器的擴展性好，且有著更快的周轉(zhuǎn)時間，因此有望在某些應用中取代毛細管電泳技術。 Glorikian和Clancy認為，第二個重大趨勢是流程的價值轉(zhuǎn)變，即高通量測序流程中使用了更多除測序儀和消耗品之外的去商品化（decommoditization）和商品化資源。這種趨勢的主要推動力是技術本身，并與第二代測序技術的成熟和更新一代測序儀的出現(xiàn)有關。 作者談到，大型基因組中心在2005年大約花費65%在工具（儀器和消耗品）上，但到了2010年，工具花費則降低至~40-50%。預計今后還會繼續(xù)降低，因為計算機設施和樣品物流設施的投資增加，而且還需要雇傭更多的人員，如生物信息學家和病理學家。 作者認為未來幾年的增長點將是樣品制備儀器及消耗品，DNA剪切和大小選擇儀器及消耗品，亞硫酸氫鹽測序試劑盒、染色質(zhì)免疫沉淀試劑盒、序列富集儀器及消耗品，以及生物信息學工具。 zui后，也是生命科學界zui感興趣的一個趨勢，是測序技術擴散到臨床和商業(yè)應用中。這個趨勢主要是由兩種力量推動的，即不斷增長的高性能需求和快速擴展的技術性能范圍。 盡管大部分的測序討論集中在技術的性能改善上，但作者認為，客戶需求的變化更為重要，也非?？?。從分析的角度來看，愿望是降低假陽性和假陰性，而從臨床的角度來看，則是提高陽性和陰性預測值。 他們將測序中zui長期和zui重要的趨勢稱為測序技術的*。高通量測序技術將逐步擴散到基因組學之外，進入其他分析物的分析，包括小分子、蛋白和肽段，以及科研、臨床和商業(yè)應用中的細胞現(xiàn)象。 作者總結(jié)道，考慮到整個分析儀器市場的規(guī)模（大約400億美元）以及商業(yè)化體外診斷市場的規(guī)模（約410億美元），現(xiàn)有市場參與者和客戶的影響將是可觀的。如果幾臺測序儀能夠取代整個臨床實驗室，那么行業(yè)*zui終有可能處境危險。（生物通 薄荷） |