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            DNA提取的方法

            閱讀:1905          發(fā)布時(shí)間:2011-4-18
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            石蠟包埋組織DNA提取的基本方法
            從石蠟包埋組織中提取DNA的基本步驟,是在常規(guī)DNA提取方法的基礎(chǔ)上改良和演變而業(yè)。Goelz等(1985)zui先提出的石蠟包埋組織DNA提取技術(shù),是用機(jī)械的方法破碎組織,切除多余的石蠟,進(jìn)入含SDS和高濃度蛋白酶K(1mg/ml)的提取緩沖液加溫孵育,然后進(jìn)行苯酚和氯仿抽提。 所得DNA雖不完整,但可被限制性內(nèi)切酶切割,因而適于點(diǎn)雜交,印跡雜交等多種分了生物學(xué)實(shí)驗(yàn)。Dubeau等(1986)在上述方法上作了改進(jìn)。 首先通過組織切片和二甲苯和脫蠟,保證了組織的*破碎,使細(xì)胞與消化液充分接觸,使DNA釋放和蛋白去除更加*;其次通過兩步消化的方法,將不適于做分子雜交的降解的DNA小段去除,僅保留那些可螺旋化的完整的DNA分子,從而提DNA質(zhì)量,適于做Sorthern印跡雜交分析。Moerkerk等(1990)對(duì)上述兩種方法進(jìn)行了比較,發(fā)現(xiàn)兩種方法所提行DNA之點(diǎn)雜交結(jié)果一致,非螺旋化DNA亦不影響雜交分析。
            Goelz氏DNA提取方法的主要步驟
            .切除多余石錯(cuò),暴露組織
            .將組織切碎(zui大徑<0.5mm),稱重;
            3.溶于TE9提取液(組織<50mg/5ml.50-500mg/10ml),高速混懸2-3min,于48℃放置24h
            TE9提取液的制備
            500mmol/L Tris
            20mmol/L EDTA
            10mmol/L NaCl
            1% SDS
            500 μg/ml 蛋白酶K
            pH8.0
            4.再次混懸組織,加入蛋白酶K至終濃度1mg/ml,SDS至2%,孵育40h;
            5.用等體積酚-氯仿溶液抽提3次;
            6.2.5倍體積乙醇沉淀DNA
            7.-70℃放置2-4h
            8.9 000xg離心1h
            9.沉淀物用70%乙醇洗1次
            0.干燥,TE(pH7.2)溶解。
              不同類型的基因分析所要求的DNA質(zhì)量和數(shù)量不同。Southern 印跡雜交分析需要10-15μg大片段DNA(>20kb),因?yàn)殡s交前要進(jìn)行相誚的限制性內(nèi)切酶消化和凝膠分離不同片段長(zhǎng)度的DNA。故DNA提取要求高,小片段DNA存在會(huì)直接影響雜交信號(hào)。與之相反,多聚酶鏈反應(yīng)(PCR)則可在相對(duì)粗制的小片段DNA存在會(huì)直接影響雜交信號(hào)。與之相反,多聚酶鏈反應(yīng)(PCR)則可在相對(duì)粗制的小片段DNA樣本上進(jìn)行,分析所需的DNA很少,0.5μg甚至更少即可。PCR的模板DNA制備方法很多,除上述兩種方法外,還有更簡(jiǎn)便的直接水煮法(Slebos,et al,1990;Smit, et al, 1988 )、 蛋白酶消化法(Impraimet al.1987;Brice,et al.1989)。
            這些方法不經(jīng)過酚-氯仿-異戊醇抽提、DNA純化等步驟,直接將組織放在去離子水中煮沸10min 或在蛋白酶K緩沖液中消化4h,DNA即可釋放出來(lái)。此提取物可直接用作模板,進(jìn)行PCR擴(kuò)增, 但是,我們發(fā)現(xiàn)直接水煮法和蛋白酶消化法提取的DNA,擴(kuò)增率較低,且征對(duì)性不好。這可能是由于DNA附著的蛋白質(zhì)去除不凈而影響DNA變性和與引物的結(jié)合,亦可能是由于標(biāo)本中殘留的固定劑等成分對(duì)Taq DNA多聚酶的抑制所致。

              上海恒遠(yuǎn)生物先后與河南中醫(yī)學(xué)院、復(fù)旦大學(xué)、同濟(jì)大學(xué)、上海交通大學(xué)、華東師范大學(xué)、第二軍醫(yī)大學(xué)、仁濟(jì)醫(yī)院、曙光醫(yī)院、華山醫(yī)院、瑞金醫(yī)院、上海有機(jī)研究所、中科院上海分院等多家單位建立了良好的合作關(guān)系。本公司可為您提供科研ELISA試劑盒,種屬標(biāo)本齊全,有專門針對(duì)人血清、血漿、全血、分泌物、尿液、細(xì)胞培養(yǎng)上清液、組織勻漿、組織液等標(biāo)本的試劑盒;另有針對(duì)各種動(dòng)物(鼠、兔、牛、馬、雞、豬、狗、山羊、猴、魚)的科研試劑。

             

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