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            Cell:復(fù)雜基因調(diào)控,或是“無心插柳”之作

            2013-11-8  閱讀(425)

            相比于低等細菌人類無疑是優(yōu)雅、高等、復(fù)雜的生物,這一點或許看起來顯而易見,但就基因而論,一位加州大學(xué)舊金山分校的科學(xué)家卻想要轉(zhuǎn)變對于人類和細菌進化的傳統(tǒng)看法。

            加州大學(xué)舊金山分校的生物化學(xué)和生物物理學(xué)教授Hiten Madhani認為,引導(dǎo)我們基因活性的分子并非是一群井然有序、協(xié)調(diào)運作的運動選手,而是像一群酸腐的官僚阻礙工作,造成了不必要的效率低下。與之相比,細菌能夠有效率地執(zhí)行這些過程,較少挫折表達自身的基因。

            Madhani在發(fā)表于11月7日《細胞》(Cell)雜志上,一篇題為“The Frustrated Gene: Origins of Eukaryotic Gene Expression”的文章中,陳述了自己的觀點。

            盡管Madhani的想法是受到他自身的研究發(fā)現(xiàn)的刺激所產(chǎn)生,但他卻將他的Cell論文描述為是一個“如此”( just so)的故事。這一向傳統(tǒng)觀點提出挑戰(zhàn)的猜測,到目前為止還缺乏支持它的數(shù)據(jù)。他表示這一妙想源自于的科學(xué)家、諾貝爾獲得者Sydney Brenner。“生物學(xué)淹沒在了數(shù)據(jù)的海洋中,但它需要新的理論,”Madhani說。

            Madhani說,大多數(shù)的科學(xué)家們都認為,在人類細胞中引導(dǎo)基因表達和蛋白質(zhì)生成的分子機制必須非常復(fù)雜,才能使得驅(qū)動多層面生物進化和維持的反應(yīng)靈活多變。

            但他認為,遺傳調(diào)控機器的這種復(fù)雜性zui初進化并非是“有心特意”為了實現(xiàn)整個人類的發(fā)展。相反,早期真核生物首先進化出基因表達的復(fù)雜性,或許是為了阻礙反轉(zhuǎn)錄病毒等“寄生DNA”的感染,否則它們進入到細胞核中會破壞正常的基因。

            與人類相反,沒有采用引導(dǎo)人類基因表達的那些復(fù)雜機制,細菌適應(yīng)性地以無數(shù)種的方式進化,控制它們的基因。事實上,包含數(shù)萬億細胞的人類,以及不過一個細胞的致病細菌,在很長的時間內(nèi)都一直在共同戰(zhàn)斗和進化,多藥耐藥細菌或許就是在這億史詩般的斗爭中出現(xiàn)的一類的惡棍。

            盡管簡單但細菌一直存在著。它們只有一條負載基因的染色體,缺乏細胞核。細菌的染色體沒有稱之為染色質(zhì)的可修飾保護鞘。人類和細菌細胞的基因表達有許多的其他細節(jié)存在差異。細菌是“原核生物”,顧名思義它們是在細胞進化擁有細胞核之前出現(xiàn)的——根據(jù)來自化石的某些推測,時間是在30多億年前。人類細胞擁有一個細胞核,以及許多被視之為是“真核生物”的其他特征。

            Madhani說,盡管人類是在幾百萬年前由猿類進化而來,真核生物或許是在15億年前單細胞酵母祖先出現(xiàn)之時就已存在——具有相同的復(fù)雜特征。

            “認為人類基因表達的復(fù)雜屬性的發(fā)展推動了復(fù)雜、多細胞生物的進化,這一觀點或許是吸引人的。但真核基因表達的核心元件是在現(xiàn)代真核生物的遠古單細胞祖先中建立。換句話說,早期真核細胞已經(jīng)在適應(yīng)防止寄生DNA,”Madhani說。

            Madhani說他的想法來自今年早些時候他發(fā)布的一項研究。他的研究小組發(fā)現(xiàn),一種稱作SCANR的真核細胞機器在阻止寄生DNA破壞基因組中發(fā)揮了一種從前未知的作用。

            SCANR保護對抗了很早以前侵入人類基因組的跳躍基因(轉(zhuǎn)座子)。轉(zhuǎn)座子可多次復(fù)制,將自身插入到基因組DNA中的隨機位點。當(dāng)轉(zhuǎn)座子將自身插入到一個重要基因之中時,它或許會導(dǎo)致功能失常、疾病或先天缺陷。

            Madhani開始思考細胞中有可能同樣阻礙某些病毒的其他機制,不同于細菌病原體,病毒是依賴于人類宿主的遺傳機器進行復(fù)制。

            “但轉(zhuǎn)座子元件攻擊來自基因組內(nèi)部,而病毒攻擊來自外部,”Madhani說。

            除了限制接近DNA的染色質(zhì),真核細胞還可能有一些RNA修飾和在蛋白質(zhì)生成之前檢測這些真核生物修飾的分子檢測者。細胞核自身受到門控,使得只有一些分子能夠進入細胞核。許多其他的真核細胞現(xiàn)象zui早進化或許都是為了抵抗病毒和轉(zhuǎn)座子元件。



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