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上海源葉生物科技有限公司
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Science重要成果:重寫(xiě)全基因組
2013-10-18 閱讀(242)
在發(fā)表于一期《科學(xué)》(Science)雜志上的兩項(xiàng)平行研究中,研究人員在大腸桿菌中構(gòu)建出了新的基因組,由此測(cè)試了遺傳編程的極限,并為提高生物技術(shù)的靈活性、產(chǎn)率和安全性開(kāi)辟了新的可能性。
在*項(xiàng)研究中,研究者們采用同義的UAA密碼子,替換了大腸桿菌整個(gè)基因組中的所有321個(gè)特異的UAG密碼子,這使得釋放因子1(RF1)被敲除,并重新定義了UAG的翻譯功能。由此使得細(xì)菌生成了自然界通常不存在的蛋白質(zhì),提高了對(duì)病毒的抵抗力。
在第二項(xiàng)研究中,研究人員移除了42個(gè)大腸桿菌基因的13種不同的密碼子,每個(gè)基因采用一種不同的大腸桿菌,并用其他具有相同功能的密碼子取代了它們。當(dāng)研究人員這樣做時(shí),42個(gè)靶基因的24%的DNA發(fā)生了改變,而這些基因生成了與原始基因生成的相同的蛋白質(zhì)。
哈佛醫(yī)學(xué)院George Church實(shí)驗(yàn)室研究生Marc Lajoie說(shuō):“*篇論文是說(shuō),我們可以*從基因組中移除一種密碼子,然后成功地重新它的功能。在第二項(xiàng)研究中,我們提出了這樣的問(wèn)題‘好吧,我們已經(jīng)改變了這一密碼子,我們還能夠改變多少其他的密碼子?該研究所選擇的13種密碼子,全部都能夠被改變。”
“這為我們揭開(kāi)了一種可能性:我們有可能能夠替換整個(gè)基因組所有這13種密碼子或是其中任何一個(gè),”Lajoie說(shuō)。
朝著更安全,更多產(chǎn),更靈活的生物技術(shù)
重新編碼的基因組可以為大腸桿菌提供保護(hù)對(duì)抗病毒,并幫助防止將潛在危險(xiǎn)的遺傳改造性狀傳播給野生型生物。
*篇論文的共同資深作者、耶魯大學(xué)醫(yī)學(xué)院分子、細(xì)胞和發(fā)育生物學(xué)助理教授Farren Isaacs說(shuō):“這些結(jié)果有可能為生物技術(shù)生成打開(kāi)了一個(gè)全新的化學(xué)工具箱。例如,添加持久聚合物到一種治療分子中,有可能使得它能夠在人類血流中更長(zhǎng)時(shí)間發(fā)揮功能。但要獲得這樣的影響,需要一次改變大片的基因組。”
Church說(shuō):“如果我們做出少許的改變,使得微生物略微更具抗病毒能力,病毒將會(huì)抵消這一效應(yīng)。它變成了一個(gè)來(lái)回反復(fù)的斗爭(zhēng)。但如果我們能夠讓微生物脫機(jī),生成大量的改變,當(dāng)我們將它帶回展示于病毒面前時(shí),病毒將會(huì)說(shuō)‘我投降’。任何的天然病毒群產(chǎn)生再多的多樣性,也不足以抵消這一極其全新的基因組。”
在*項(xiàng)研究中,僅移除了一個(gè)密碼子,就提高了基因組重編碼生物體的抗病毒感染力。Church說(shuō),相同潛力的“全新基因組”不可能操控基因轉(zhuǎn)而進(jìn)入到野生種群,因?yàn)樗鼈兣c自然基因組不相容。這對(duì)于遺傳改造耐藥或抗殺蟲(chóng)劑的菌株具有極大的益處。并且,整合的罕見(jiàn)、非標(biāo)準(zhǔn)氨基酸確保了菌株只能在實(shí)驗(yàn)室環(huán)境中存活。