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磷酸化蛋白11點(diǎn)經(jīng)驗(yàn)之談
閱讀:1173 發(fā)布時(shí)間:2014-2-24實(shí)驗(yàn)中磷酸化蛋白有哪些經(jīng)驗(yàn)之談,以下為小編總結(jié)
1. 一定要在lysis buffer中加入蛋白酶抑制劑,還要加入一定量的磷酸酶抑制劑,否則即使band壓出來也會(huì)很淺,結(jié)果也不可信。
2. 加一抗后4℃過一夜,保證抗體有充分的結(jié)合時(shí)間。因?yàn)榱姿峄牡鞍字徽伎偟牡鞍琢康臉O少部分。4℃也可使一抗重復(fù)使用多次。畢竟磷酸化的抗體都挺貴的。二抗則室溫1小時(shí)即可。
3. 磷酸化抗體的好壞是一個(gè)關(guān)鍵因素,所以要選擇好的廠商。
4. 根據(jù)廠商的protocol來操作實(shí)驗(yàn),這是實(shí)驗(yàn)成功的保證。
5. 抗體的稀釋倍數(shù)也要適當(dāng),不同廠商也會(huì)有不同要求。
6. 研究完某一蛋白的磷酸化情況后也要研究一下該蛋白總的表達(dá)量。如壓完phospho-p38抗體后,把相同的membrane做strip后再壓p38,然后再strip一次,再壓內(nèi)標(biāo)actin。
7. 做磷酸化蛋白WB時(shí),除了目標(biāo)蛋白的band以外,往往會(huì)出現(xiàn)非特異性的band。磷酸化抗體不好的話,甚至?xí)撼龇翘禺愋缘腷and,而沒有你想要的band,所以壓片以后,你一定要根據(jù)markers比對(duì)一下,你壓出的band分子量是否正確。
8. 磷酸化蛋白WB時(shí)backgroud也往往較深,所以壓片時(shí)間要適當(dāng),不能太長或過短,太長則backgroud太深蓋住想要的那條band,時(shí)間過短則可能沒有band或者band太淺。
9. 磷酸化蛋白WB時(shí),用TBST洗時(shí)也要注意一下,搖床的轉(zhuǎn)速不要太快,洗的時(shí)間不要太長,孵育一抗和二抗之后分別洗5 min 3次即可,寧愿background深一些,總比做不出來強(qiáng)得多。另外,洗的時(shí)候,不要把幾張membrane疊在一起洗。
10. 研究完某一蛋白的磷酸化情況后也要研究一下該蛋白總的表達(dá)量。這有兩種方法,一是:相同的sample在不同的well中上樣兩次(可在相同的 gel上,也可在不同的gel),其一壓磷酸化蛋白,另一壓該蛋白總的表達(dá)量(包括磷酸化和未磷酸化的該蛋白),甚至還可跑另一個(gè)gel,壓內(nèi)標(biāo)。但是不 建議如此做,因?yàn)檫@樣比較時(shí)誤差還是較大的。
11. Strip時(shí)一定要注意:membrane一定要*泡在strip solution中(可用較硬的塑料膜封好),然后要*浸入水中,使受熱均勻。這一點(diǎn)很重要,要不然,隨后壓出來的總蛋白也好,內(nèi)標(biāo)也好就會(huì)不均一,無法進(jìn)行比較。
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