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            上海北諾生物科技有限公司

            中級(jí)會(huì)員·14年

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            質(zhì)粒DNA質(zhì)量如何評(píng)估才可靠?

            2015-1-13  閱讀(2401)

            分享:

            質(zhì)粒抽提過程中有很多步驟會(huì)影響zui后的產(chǎn)量和質(zhì)量,那么如何評(píng)估質(zhì)粒DNA的產(chǎn)量和質(zhì)量呢?

                   目前使用分光光度法定量質(zhì)粒DNA和通過瓊脂糖凝膠電泳進(jìn)行質(zhì)粒DNA產(chǎn)率和質(zhì)量的分析是兩種zui常用的方法。

                   溶液中的核酸濃度可通過260 nm的吸光度方便地進(jìn)行計(jì)算。A260的數(shù)值處于0.1至1.0之間時(shí)測(cè)量結(jié)果具有良好的重復(fù)性,但當(dāng)A260數(shù)值小于0.1或大于1.0的時(shí)候,結(jié)果的可重復(fù)性將顯著下降。而且,3.0以上的讀值是無法使用的,它可能會(huì)潛在導(dǎo)致對(duì)DNA質(zhì)量的低估。因此,為了獲得可靠的DNA分光光度定量結(jié)果,A260的讀值需要處于0.1至1.0之間。當(dāng)檢測(cè)小量DNA時(shí),使用瓊脂糖凝膠電泳進(jìn)行的定量分析可能更為可靠。

                   造成較低的產(chǎn)率和質(zhì)量的可能因素有很多。為了確定存在問題的環(huán)節(jié),可于每一純化步驟都保留一小部分樣品,并通過瓊脂糖凝膠電泳進(jìn)行分析。

            制備樣本

            如各個(gè)實(shí)驗(yàn)方案和下列表格中所示,從澄清裂解液(樣本1)、流出液(樣本2)、QC洗滌緩沖液的混合組分(樣本3)和QF/QN緩沖液洗脫產(chǎn)物(樣本4)中各取出部分樣品。使用1倍體積的異丙醇沉淀核酸,并使用70%的乙醇洗滌該沉淀,充分蒸干后重懸于10 μl pH8.0的TE緩沖液中。

            表一 瓊脂糖凝膠分析所需樣本體積

            樣本

            實(shí)驗(yàn)方案步驟

            Midi

            Maxi

            Mega

            Giga

            (極低拷貝數(shù)質(zhì)粒/科斯質(zhì)粒) 
            QIAGEN-tip 100

            (極低拷貝數(shù)質(zhì)粒/科斯質(zhì)粒)QIAGEN-tip 500

            1


            240 μl

            120 μl

            120 μl

            75 μl

            600 μl

            750 μl

            2


            240 μl

            120 μl

            120 μl

            75 μl

            50 μl

            24 μl

            3


            400 μl

            240 μl

            160 μl

            120 μl

            200 μl

            120 μl

            4


            100 μl

            60 μl

            22 μl

            20 μl

            50 μl

            30 μl

            (制備產(chǎn)物占樣本量的百分比)

            2%

            0.40%

            0.08%

            0.02%

            1%

            0.20%

            瓊脂糖凝膠分析

            在1%的瓊脂糖凝膠*中,對(duì)于各個(gè)質(zhì)粒純化步驟中的對(duì)應(yīng)樣品各加入2 μl進(jìn)行電泳。

            以上信息來源于:

            http://www.qiagen。。com/cn/resources/technologies/plasmid-resource-center/reliability%20of%20dna%20quantification%20by%20spectrophotometry/ 

            http://www.qiagen。。com/cn/resources/technologies/plasmid-resource-center/agarose%20gel%20analysis%20of%20the%20purification%20procedure/ 

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