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            Nature | NINJ1細(xì)胞死亡研究領(lǐng)域新進(jìn)展

            閱讀:565        發(fā)布時(shí)間:2024-3-28

             

            使用NINJ1抗體抑制膜撕裂限制組織損傷

             

             

            背景部分介紹:

            NINJ1是一種16 kDa的細(xì)胞表面蛋白,預(yù)計(jì)具有兩個(gè)跨膜區(qū)域,并且在細(xì)胞外部具有N和C端。雖然對(duì)細(xì)胞死亡的誘導(dǎo)是非必要的,但NINJ1控制著細(xì)胞凋亡或焦亡的一個(gè)重要后果,介導(dǎo)PMR (plasma membrane rupture),非選擇性地從死亡細(xì)胞中釋放促炎細(xì)胞質(zhì)內(nèi)容物。NINJ1依賴性PMR是否會(huì)加重疾病中的組織損傷尚不清楚,但據(jù)報(bào)道,在小鼠模型中,Ninj1缺乏可減輕肺纖維化和多發(fā)性硬化癥。鑒于NINJ1的一個(gè)保守的細(xì)胞外區(qū)域?qū)ζ涔丫刍蚉MR至關(guān)重要,作者假設(shè)細(xì)胞外抗NINJ1抗體可以用來(lái)抑制體內(nèi)依賴NINJ的PMR。

            在介紹本文內(nèi)容前,推薦兩篇相關(guān)的文獻(xiàn),希望為大家提供更好的背景方面的了解。

            第一篇如下,NINJ1 mediates plasma membrane rupture during lytic cell death, 是由同一作者于2021年發(fā)表于nature的文章,初步描述了NINJ1在細(xì)胞焦亡過(guò)程中對(duì)質(zhì)膜撕裂的作用。

             

            第二篇,structural basis of NINJ1-mediated plasma membrane rupture in cell death, 巧合的是這篇文章與我們要解析的文章同一天發(fā)表在nature上,但作者不同。這篇文章詳細(xì)解析了NINJ1的空間構(gòu)象。

             

            在NINJ1出現(xiàn)之前,大家普遍認(rèn)為細(xì)胞焦亡過(guò)程中,細(xì)胞腫脹后引起的質(zhì)膜撕裂是被動(dòng)的,隨著關(guān)于NINJ1在nature的三篇文章出現(xiàn),相信大家對(duì)該基因的重要性有了共同認(rèn)識(shí),那么接下來(lái)NINJ1是否會(huì)成為細(xì)胞死亡領(lǐng)域里的研究新寵呢?

             

            主要結(jié)果部分:

            1.NINJ1阻斷抗體克隆D1的鑒定

             

            為了產(chǎn)生Ninj1阻斷抗體,作者用表達(dá)全長(zhǎng)小鼠NINJ1的細(xì)胞外囊泡免疫Ninj1?/?小鼠a。通過(guò)流式細(xì)胞術(shù)分析分離了大約15000個(gè)結(jié)合NINJ1的IgM?B細(xì)胞,并鑒定了單細(xì)胞上清與表達(dá)NINJ1的細(xì)胞的結(jié)合。217個(gè)重組抗小鼠NINJ1 IgG2a單克隆抗體的功能篩選鑒定克隆D1 (NINJ1- 575)為NINJ1依賴性PMR抑制劑b。另外驗(yàn)證了D1只結(jié)合鼠NINJ1 C??寺1識(shí)別NINJ1的C端表位,而對(duì)照克隆25識(shí)別N端表位d。

             

            2. D1可有效抑制NINJ1依賴性PMR

             

             

            為了擴(kuò)展對(duì)BMDMs的分析,我們通過(guò)延時(shí)活細(xì)胞成像來(lái)監(jiān)測(cè)NINJ1依賴性PMR。用異硫氰酸熒光素(FITC)偶聯(lián)的150 kDa葡聚糖(DD-150)裝載Pam3CSK4-primed BMDMs,并使用尼日利亞菌素刺激后的染料釋放量作為PMR的指標(biāo),發(fā)現(xiàn)克隆25和D1均表現(xiàn)出PMR阻斷活性,但后者更有效a。雖然二者都能阻斷PMR,但不能抑制膨脹泡的形成c。

             

            3. 克隆D1減弱了NINJ1的寡聚化

             

             

            假設(shè)克隆D1通過(guò)阻止NINJ1的寡聚化來(lái)阻斷BMDMs中的PMR。為了與這種機(jī)制保持一致,尼日利亞菌素在野生型bmdm中誘導(dǎo)了NINJ1的斑點(diǎn)狀組裝,但這些在D1 Fab克隆存在時(shí)不那么普遍a, b。還檢測(cè)了克隆D1對(duì)瞬時(shí)轉(zhuǎn)染人Expi293F細(xì)胞純化的n端flag標(biāo)記小鼠NINJ1的影響。通過(guò)隔離層析(SEC),純化后的Flag-NINJ1作為高分子量的物種遷移(在8.5 ml保留體積時(shí)達(dá)到峰值),相比之下,當(dāng)Flag-NINJ1與克隆D1 Fab共表達(dá)時(shí),純化的NINJ1-Fab復(fù)合物以低分子量的物種遷移(在15ml保留體積時(shí)達(dá)到峰值)。c。另陰性染色電鏡顯示,F(xiàn)lag-NINJ1形成了形狀各異的低聚結(jié)構(gòu),包括環(huán)狀、長(zhǎng)絲、團(tuán)簇和圓弧,其尺寸可達(dá)200 nm,與D1 Fab共存在時(shí)無(wú)高階低聚物結(jié)構(gòu)形成d。

             

            4. 克隆D1限制了NINJ1依賴性PMR和DAMP的釋放

             

             

            該實(shí)驗(yàn)采用了小鼠模型NINJ1fl/flRosa26-creERT2 mice: 該小鼠品系能夠在成年鼠中引起他莫昔芬誘導(dǎo)的系統(tǒng)性NINJ1缺失。

            a-d探討了NINJ1在細(xì)胞凋亡相關(guān)PMR中的作用:

            在他莫昔芬治療后,NINJ1fl /flRosa26-creERT2小鼠和Rosa26-creERT2對(duì)照小鼠給予TNF和轉(zhuǎn)錄抑制劑D-半乳糖胺(D-Gal)誘導(dǎo)肝細(xì)胞凋亡,TNF +D-Gal引起Rosa26-creERT2小鼠的暴發(fā)性肝細(xì)胞PMR,血清中ALT、AST和LDH升高,而TNF + D-Gal處理的NINJ1缺陷小鼠血清中ALT、AST和LDH含量顯著較低a。對(duì)照肝臟的組織學(xué)分析顯示,TNF + d-Gal引起以收縮性肝細(xì)胞死亡伴出血為特征的大面積病變,NINJ1缺陷肝細(xì)胞表現(xiàn)出與PMR功能障礙相關(guān)的腫脹形態(tài)b, c。免疫標(biāo)記顯示,這些病變中裂解的caspase-3(細(xì)胞凋亡的標(biāo)志)呈陽(yáng)性d。這些數(shù)據(jù)表明NINJ1在體內(nèi)介導(dǎo)凋亡相關(guān)的PMR。

            接下來(lái),檢測(cè)克隆D1是否可以限制TNF + d-Gal誘導(dǎo)的肝損傷e-g:

            野生型小鼠在注射TNF + D-Gal前2小時(shí)給予同型對(duì)照抗體,血清ALT、AST和LDH水平顯著升高,表明肝細(xì)胞PMR增強(qiáng),與NINJ1缺乏癥類似,D1克隆預(yù)處理顯著減弱誘導(dǎo)的血清LDH、ALT和AST升高e。隨后發(fā)現(xiàn)TNF + D-Gal以NINJ1依賴的方式增加了血清中DAMPs IL-18和HMGB127的水平f, g

             

            模式圖推測(cè):

             

             

            最后,針對(duì)文章的研究,小優(yōu)博士在這里制作了一張推測(cè)的模式圖,供大家參考。

             

            部分產(chǎn)品推薦:

            Antibody NameCatalog #
            anti-NINJ1HPA045063-25ul
            HRP-anti-rabbit, F(ab')? fragment111-035-047
            HRP-anti-rabbit, Fc fragment111-035-046
            AC-15 anti-beta-actin HRPNB600-501H
            anti-Ninjurin clone 50610777
            F(ab')2-Goat anti-Mouse IgG (H+L) Secondary Antibody APC17-4010-82
            Mouse IgG2a Isotype Control02-6200
            PE-Cy7-conjugated rat anti-mouse IgM 552867
            anti-NINJ1 clone 80 rbIgG2b
            cleaved caspase-3 (Asp175) 9661L
            rabbit anti-mouse Ly6G 87048
            IL-18 (E3G8R) Rabbit mAb67775
            anti-gp120 mIgG2a
            Rat Anti-CD11b, Clone: M1/70553309
            Hamster Anti-Mouse CD11c,  Clone: HL3553800
            Rat Anti-Mouse CD4, Clone: GK1.5553728
            Rat Anti-Mouse CD8b.2,  53-5.8553039
            Rat Anti-Mouse CD49b, Clone: DX5553856
            Rat Anti-Mouse TER-119/Erythroid Cells553672
            Rat Anti-Mouse Ly-6G and Ly-6C, Clone: RB6-8C5553125
            eFluor™ 450-conjugated rat anti-mouse B220 48-0452-82
            anti-mouse CD95/Fas (clone Jo2)554254

             

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