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CUT和Tag: 新型蛋白質(zhì)-DNA互作研究工具
表觀遺傳學(xué)研究中，在分子層面研究蛋白質(zhì)與DNA之間的相互作用有助于我們更深入的理解特定細(xì)胞功能和疾病發(fā)病機(jī)制。CST為了幫助科研人員更快的獲得可靠的實(shí)驗(yàn)結(jié)果，進(jìn)一步擴(kuò)大了蛋白質(zhì)-DNA互作研究產(chǎn)品組合，重磅推出了完整的CUT&Tag（Cleavage Under Targets and Tagmentation）解決方案，包括CUT&Tag試劑盒（#77552）、 建庫試劑盒（#47415）、抗體和適用于細(xì)胞以及組織的實(shí)驗(yàn)步驟說明書。
CUT&Tag實(shí)驗(yàn)步驟
對于CST CUT&Tag實(shí)驗(yàn)，首先將細(xì)胞與刀豆蛋白A包被的磁珠混合。洋地黃皂苷的透化處理可以讓靶標(biāo)特異性的一抗進(jìn)入細(xì)胞并結(jié)合目的蛋白。由于需要將信號放大，因此還要添加二抗。隨后進(jìn)行預(yù)裝接頭的高活性CUT&Tag pAG-Tn5 (Loaded) （#79561）融合轉(zhuǎn)座酶的孵育，轉(zhuǎn)座酶進(jìn)入細(xì)胞后可以通過pAG結(jié)構(gòu)域與二抗結(jié)合，這樣就使轉(zhuǎn)座酶與靶標(biāo)蛋白間接聯(lián)系起來。加入Mg2+激活轉(zhuǎn)座酶活性后，目標(biāo)基因組 DNA 會被切割并就地連接接頭 DNA，最后進(jìn)行DNA純化和PCR擴(kuò)增。由于省去了體外接頭連接步驟，CUT&Tag可以節(jié)省您寶貴的時間，讓您在更短的時間內(nèi)進(jìn)行蛋白質(zhì)-DNA相互作用研究。
圖1：CUT&Tag 實(shí)驗(yàn)原理
CUT&Tag為何與眾不同？
雖然ChIP仍然是研究蛋白質(zhì)-DNA相互作用的主要方法，但隨著新的研究工具的出現(xiàn)，例如CUT&RUN以及CUT&Tag，傳統(tǒng)ChIP-Seq實(shí)驗(yàn)需要大量樣品，重復(fù)性差、高背景等問題得到了解決。CST CUT&Tag試劑盒（#77552）經(jīng)過了嚴(yán)格驗(yàn)證，適用于細(xì)胞和組織樣品中多種靶標(biāo)類型，并包含了陽性對照抗體Tri-Mmethyl-Histone H3 (Lys4) (C42D8) Rabbit mAb #9751和陰性對照抗體Normal Rabbit IgG #2729 / Normal Mouse IgG #68860，以及抗兔和抗鼠的二抗。同時，當(dāng)樣品量不足時，該試劑盒還可以幫助您更快獲得實(shí)驗(yàn)結(jié)果，節(jié)省測序成本，并使單細(xì)胞染色質(zhì)分析成為可能。
圖2：CUT&Tag優(yōu)勢
此外，CST還專門針對CUT&Tag驗(yàn)證了多種一抗，包括組蛋白靶標(biāo)和部分非組蛋白靶標(biāo)，以確保實(shí)驗(yàn)結(jié)果的可重復(fù)性和可靠性。
CUT&Tag 試劑為您提供高質(zhì)量數(shù)據(jù)
一、組蛋白修飾分析
1、使用Tri-Methyl-Histone H3 (Lys4) (C42D8) Rabbit mAb #9751對HCT 116細(xì)胞進(jìn)行CUT&Tag實(shí)驗(yàn)。
2、使用Tri-Methyl-Histone H3 (Lys4) (C42D8) Rabbit mAb #9751對低細(xì)胞數(shù)量的NCCIT細(xì)胞進(jìn)行CUT&Tag實(shí)驗(yàn)。
二、轉(zhuǎn)錄因子和輔因子分析
1、使用Nanog (D2A3) XP Rabbit mAb (Mouse Specific) #8822對F9細(xì)胞進(jìn)行CUT&Tag實(shí)驗(yàn)。
2、使用 JARID2 (D6M9X) Rabbit mAb #13594 對NCCIT細(xì)胞進(jìn)行CUT&Tag實(shí)驗(yàn)。
3、使用ATF-4 (D4B8) Rabbit mAb #11815對低細(xì)胞數(shù)量的Hep G2細(xì)胞進(jìn)行CUT&Tag實(shí)驗(yàn)。
三、組織樣品分析
1、使用Tri-Methyl-Histone H3 (Lys4) (C42D8) Rabbit mAb #9751對小鼠腦組織進(jìn)行CUT&Tag實(shí)驗(yàn)。
2、使用Tri-Methyl-Histone H3 (Lys4) (C42D8) Rabbit mAb #9751對小鼠肝組織進(jìn)行CUT&Tag實(shí)驗(yàn)。
3、使用Tri-Methyl-Histone H3 (Lys4) (C42D8) Rabbit mAb #9751對小鼠心臟組織進(jìn)行CUT&Tag實(shí)驗(yàn)。
CST經(jīng)過嚴(yán)格驗(yàn)證的一站式CUT&Tag解決方案現(xiàn)已全面上線：CUT&Tag試劑盒（#77552） + 一抗和二抗 + 建庫試劑盒（#47415）
CUT&Tag試劑盒和試劑
| 貨號 | 產(chǎn)品名稱 | 規(guī)格 |
| 77552 | CUT&Tag Assay Kit | 1 kit |
| 79561 | CUT&Tag pAG-Tn5 (Loaded) | 100ul |
| 47415 | CUT&Tag Dual Index Primers and PCR Master Mix for Illumina Systems | 1 kit |
| 63228 | CUT&Tag PCR Master Mix | 840ul |
部分CUT&Tag驗(yàn)證抗體列表
| 貨號 | 品名 |
| 8173 | Acetyl-Histone H3 (Lys27) (D5E4) Xpe Rabbit mAb |
| 9649 | Acetyl-Histone H3 (Lys9) (C5B11) Rabbit mAb |
| 52885 | Anti-mouse secondary Ab |
| 35401 | Anti-rabbit secondary Ab |
| 11815 | ATF-4 (D4B8) Rabbit mAb |
| 6964 | Bmi1 (D20B7) Xe Rabbit mAb |
| 5856 | Bmi1 (D42B3) Rabbit mAb |
| 25069 | CBX2 (EЗN6A) Rabbit mAb |
| 14696 | CBX8 (D208C) Rabbit mAb |
| 3418 | CTCF (D31H2) Xpe Rabbit mAb |
| 9725 | Di-Methyl-Histone H3 (Lys4)(C64G9) Rabbit mAb |
| 4658 | Di-Methyl-Histone H3 (Lys9) (D85B4) Xp® Rabbit mAb |
| 32578 | DNMT3A(D2H4B) Rabbit mAb |
| 57868 | DNMTЗB (E8A8A) xpe Rabbit mAb |
| 85322 | EED (E4L6E) XP® Rabbit mAb |
| 5246 | Ezh2 (D2C9) XP3 Rabbit mAb |
| 5851 | GATA-6 (D61E4) Xp® Rabbit mAb |
| 42427 | Helios (D8W4X) XP3 Rabbit mAb |
| 13594 | JARID2 (D6M9X) Rabbit mAb |
| 97800 | MITF (D3B4T)Rabbit mAb |
| 14689 | MLL1 (D2M7U) Rabbit mAb (Amino-terminal Antigen) |
| 14111 | Mono-Methyl-Histone H3 (Lys36) (D9J1D) Rabbit mAb |
| 5326 | Mono-MethylHistone H3 (Lys4) (D1A9) Xp® Rabbit mAb |
| 5232 | Nanog (D73G4} XP® Rabbit mAb (ChiP Formulated) |
| 68860 | Normal Mouse lgG |
| 13499 | Phospho-Rpb1 cTD (Ser2) (E1Z3G) Rabbit mAb |
| 13546 | Phospho-Rpb1 cTD (ser2/ser5) (D1G3K) Rabbit mAb |
| 2729 | Rabbit lgG |
| 2629 | Rpb1 CTD (4H8) Mouse mAb |
| 11956 | SMARCC1/BAF155 (D7F8S) Rabbit mAb |
| 2569 | TCF4/TCF7L2 (C48H11) Rabbit mAb |
| 9733 | Tri-Methyl-Histone H3 (Lys27) (C36B11) Rabbit mAb |
| 9751 | Tri-Methyl-Histone H3 (Lys4) (C42D8) Rabbit mAb |
| 5737 | Tri-Methyl-Histone H4 (Lys20)(D84D2) Rabbit mAb |
| 8240 | ubiquityi-Histone H2A (Lys119} (D27C4) Xpe Rabbit mAb |
部分相關(guān)產(chǎn)品
| 貨號 | 產(chǎn)品 | 應(yīng)用 |
| 56383S | SimpleChIP® Plus Sonication Chromatin IP Kit | 超聲法，磁珠，可應(yīng)用于ChIP,ChIP-seq |
| 9005S | SimpleChIP® Plus Enzymatic Chromatin IP Kit (Magnetic Beads) | 酶解法，磁珠，可應(yīng)用于ChIP,ChIP-seq |
| 9004S | SimpleChIP® Plus Enzymatic Chromatin IP Kit (Agarose Beads) | 酶解法，瓊脂糖珠，可應(yīng)用于ChIP |
| 9003S | SimpleChIP® Enzymatic Chromatin IP Kit (Magnetic Beads) | 酶解法，磁珠,可應(yīng)用于ChIP,ChIP-seq |
| 9002S | SimpleChIP® Enzymatic Chromatin IP Kit (Agarose Beads) | 酶解法，瓊脂糖珠，可應(yīng)用于ChIP |
| abs50034 | 染色質(zhì)免疫共沉淀（ChIP）試劑盒 | 蛋白 A/G 磁珠，超聲法，，可應(yīng)用于ChIP,ChIP-seq |
| 86652 | CUT&RUN Assay Kit | CUT&RUN |
| 40366 | CUT&RUN pAG-MNase and Spike-In DNA | CUT&RUN |
| 48105 | CUT&RUN 4X Stop Buffer | CUT&RUN |
| 42015 | CUT&RUN DNA Extraction Buffer | CUT&RUN |
| 15338 | Antibody Binding Buffer (CUT&RUN, CUT&Tag) | CUT&RUN, CUT&Tag |
| 31415 | 10X Wash Buffer (CUT&RUN, CUT&Tag) | CUT&RUN, CUT&Tag |
| 14209 | DNA Purification Buffers and Spin Columns (ChIP, CUT&RUN, CUT&Tag) | ChIP, CUT&RUN, CUT&Tag |
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