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免疫細(xì)胞的衰老,主因是環(huán)境 | Cell揭示根源
導(dǎo)讀 | 為什么年紀(jì)大了,免疫力會(huì)下降?為什么免疫系統(tǒng)的衰老速度會(huì)因人而異?為什么相比于遺傳,環(huán)境對(duì)于免疫系統(tǒng)的影響程度更大?近期,科學(xué)家們通過(guò)分析單個(gè)細(xì)胞內(nèi)染色質(zhì)的差異,找到了回答這些問(wèn)題的新線索。 |
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來(lái)自于斯坦福大學(xué)醫(yī)學(xué)院的科學(xué)家們完成了這一龐大的工作,分析了大量免疫細(xì)胞。他們發(fā)現(xiàn),相比于年輕人,老年人的免疫細(xì)胞攜帶更多的染色質(zhì)修飾。而且,這些修飾差異主要來(lái)源于環(huán)境。
研究團(tuán)隊(duì)的關(guān)注點(diǎn)在于組蛋白(與細(xì)胞核內(nèi)DNA緊密結(jié)合的蛋白結(jié)構(gòu))修飾,是表觀遺傳學(xué)的重要部分,后者在健康、疾病領(lǐng)域有著不容忽視的地位。相關(guān)研究成果在線發(fā)表在一期的《Cell》上。
doi.org/10.1016/j.cell.2018.03.079
表觀遺傳學(xué)的影響
蛋白質(zhì)是執(zhí)行細(xì)胞活動(dòng)的主力。一個(gè)細(xì)胞的身份、功能與其表達(dá)的蛋白質(zhì)類型、數(shù)量密切相關(guān)。事實(shí)上,體內(nèi)的每一個(gè)細(xì)胞都含有相同的DNA,但是皮膚細(xì)胞、脂肪細(xì)胞和神經(jīng)細(xì)胞表達(dá)的蛋白質(zhì)卻有著很大的差異,因此,它們各自執(zhí)行的功能不同。通過(guò)基因表達(dá)與否,DNA序列上的表觀遺傳標(biāo)記很大程度上指引、定義了細(xì)胞的整體行為。
“除去變異或者染色體末端磨損,DNA在衰老的過(guò)程中基本保持不變,但是基因的表達(dá)程度卻可能經(jīng)歷著大的變化。”文章通訊作者免疫學(xué)和風(fēng)濕病學(xué)教授Paul J. Utz表示道。
此外,伴隨著細(xì)胞的分裂、衰老等過(guò)程,表觀遺傳修飾會(huì)不斷變化。其中,免疫系統(tǒng)中大量白細(xì)胞的基因表達(dá)水平會(huì)伴隨著衰老而發(fā)生顯著的變化。
考慮到這些,研究團(tuán)隊(duì)推測(cè),免疫細(xì)胞發(fā)生與衰老相關(guān)的變化,可能源于組蛋白修飾的變化。他們想知道,不同免疫細(xì)胞類型受表觀遺傳標(biāo)記變化影響的程度,而且這種影響模式在不同人之間或者同一個(gè)個(gè)體不同細(xì)胞的差異。
衰老的免疫細(xì)胞
Paul J. Utz和生物信息學(xué)助理教授Purvesh Khatri、基礎(chǔ)生命科學(xué)研究副研究員Alex Kuo和博士后Francesco Vallania合作,利用質(zhì)譜流式細(xì)胞技術(shù)(mass cytometry)從單細(xì)胞水平分析了免疫細(xì)胞的染色質(zhì)修飾情況。他們分析了22種不同免疫細(xì)胞內(nèi)40種不同類型的表觀遺傳標(biāo)記,共積累了約217億個(gè)數(shù)據(jù)點(diǎn),并進(jìn)行了專門的數(shù)據(jù)解析。
結(jié)果發(fā)現(xiàn),許多衰老的免疫細(xì)胞比年輕的免疫細(xì)胞攜帶更多的組蛋白標(biāo)記。此外,相比于年輕人,老年人免疫細(xì)胞之間的組蛋白修飾差異性更大。
圖片來(lái)源:Cell
變化主要源于環(huán)境
為了評(píng)估環(huán)境、遺傳對(duì)于組蛋白標(biāo)記模式的影響差異,研究人員從同卵雙胞胎、異卵雙胞胎中獲取血液樣本。其中,同卵雙胞胎擁有相同的DNA序列,分享著共同的宮內(nèi)環(huán)境。雖然異卵雙胞胎DNA有差異,但是宮內(nèi)環(huán)境、成長(zhǎng)環(huán)境(一起長(zhǎng)大)相同。
結(jié)果顯示,相比于年輕的同卵雙胞胎,年老的同卵雙胞胎之間的組蛋白修飾差異較大。而且這些差異相當(dāng)于兩個(gè)*沒(méi)有血緣關(guān)系的人。進(jìn)一步數(shù)據(jù)分析表明,老年人表現(xiàn)出的表觀遺傳差異主要源于非遺傳因素,包括飲食、睡眠、運(yùn)動(dòng)、感染、工作、居住的地方,以及生理、心理壓力等。
責(zé)編:悠然
參考資料:
Key differences in young, older people's immune cells attributed to environment