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Nature：大白血病數(shù)據(jù)庫，輔助治療藥物優(yōu)選
導(dǎo)讀 | 歷經(jīng)多年研究，科學(xué)家們發(fā)布了一個龐大的數(shù)據(jù)集，詳細(xì)描述了500多名患有急性髓細(xì)胞性白血?。ˋcute myeloid leukemia，AML）患者腫瘤細(xì)胞的分子組成。該數(shù)據(jù)集包括數(shù)百個個體患者的細(xì)胞如何在實驗室中對一系列藥物做出反應(yīng)，為日后對于AML的研究進一步打下基礎(chǔ)。 |
DOI: doi.org/10.1038/s41586-018-0623-z
10月17日,《Nature》雜志以“Functional genomic landscape of acute myeloid leukaemia”為題報道了這項研究。
在美國，每年約有20，000人被診斷為AML。這種癌癥始于骨髓的造血細(xì)胞，zui常見于老年人，且在所有血癌中預(yù)后zui差。
過去40年里，這種疾病的治療進展一直停滯不前，60歲以上患者的五年生存率不到10%。盡管FDA已經(jīng)批準(zhǔn)了一些針對特定亞群患者的AML治療，患者對這些治療也有反應(yīng)，但卻經(jīng)常復(fù)發(fā)。
另一方面，開發(fā)有效的AML治療方法一直很有挑戰(zhàn)性，因為導(dǎo)致這種疾病的分子因素在患者中差異很大。研究人員已經(jīng)鑒定了至少11種AML基因，并在患者癌細(xì)胞中發(fā)現(xiàn)了成千上萬種不同的突變。
遺憾的是，盡管靶向癌癥療法試圖通過利用癌細(xì)胞*的分子弱點來消除癌細(xì)胞，但該方法只針對AML具有正確分子特征的患者才有可能奏效。迄今為止，研究人員還沒有一個明確的圖譜指南來確定特定治療的zui佳方案。
“雖然我們對這種白血病了解了很多，但仍然有很長的路要走。”這一研究的通訊作者、俄勒岡健康與科學(xué)大學(xué)(OHSU)研究員Brian Druker說。
圖片來源：Pixabay
根據(jù)Druker介紹，zui新這項研究擁有同類研究中zui大的癌癥數(shù)據(jù)集，其可以快速推進評估潛在AML治療的臨床試驗。使用一個新的在線數(shù)據(jù)查看器，研究人員現(xiàn)在可以在幾分鐘內(nèi)發(fā)現(xiàn)哪種靶向治療對特定的AML細(xì)胞亞群zui有效。“人們可以上網(wǎng)搜索我們的數(shù)據(jù)庫，并能很快找到譬如‘這是一種好藥物嗎？’或者‘我的藥物能在病人中發(fā)揮作用嗎？’等問題的相關(guān)答案。” Druker說。
具體而言，這項新研究報告了BeatAML項目的初步發(fā)現(xiàn)，該項目正在進入臨床試驗。Druker團隊包括11個學(xué)術(shù)醫(yī)療中心和11家制藥和生物技術(shù)公司的合作者，他們收集并分析了562名患者的672份癌細(xì)胞樣本，并評估了409個樣本的腫瘤細(xì)胞對122種不同靶向治療的反應(yīng)。
“真正的力量來自于對所有數(shù)據(jù)的整合。” Druker說，“你可以分析什么藥物有效，為什么有效，這是計劃在zui有可能出現(xiàn)反應(yīng)的病人身上試驗新療法的臨床試驗的基礎(chǔ)。”
通過描述AML患者數(shù)百份樣本的新數(shù)據(jù)集，研究人員可以了解哪些藥物對特定的患者群zui有效。該圖將ibrutinib的敏感性與腫瘤樣本中發(fā)現(xiàn)的兩種基因變化同時發(fā)生的敏感性聯(lián)系起來（來源：Nature）
在他們的分析中，Druker和他的同事確定了一組三種基因突變，這些突變可能使AML患者受益于ibrutinib（FDA批準(zhǔn)用于套細(xì)胞淋巴瘤[MCL]的靶向藥）治療。研究小組發(fā)現(xiàn)，攜帶這三種突變的AML細(xì)胞對ibrutinib的敏感性明顯高于僅攜帶一兩種突變的細(xì)胞。
需要指出的是，還需要臨床試驗來評估ibrutinib在這一組患者中的效果，但是將這三種突變與潛在的藥物敏感性聯(lián)系起來，展示了新數(shù)據(jù)集是如何幫助研究人員的。
“當(dāng)我們分析數(shù)據(jù)時，我們才剛剛觸及我們能做事情的表面。”Druker總結(jié)。
責(zé)編：浮蘇
參考資料：
Vast leukemia dataset could help researchers match therapies to patients
Functional genomic landscape of acute myeloid leukaemia