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2017-11-16 閱讀(5454)
那天突然有人問(wèn)我，miRNA是不是能做出那種network的網(wǎng)絡(luò)圖，就跟那種文章里一樣？
其實(shí)我自己也忘了到底應(yīng)該怎么整了，簡(jiǎn)單點(diǎn)的話，就自己去搜搜看miRNA怎么樣對(duì)應(yīng)基因做成列表就行了吧。但是負(fù)責(zé)任的我，還是搜到了一些miRNA分析的工具。
對(duì)，就是上面這個(gè)工具，可以分析單個(gè)基因或者多個(gè)基因?qū)蝹€(gè)miRNA和多個(gè)miRNA，實(shí)際上跟形成network圖沒(méi)什么關(guān)系。只是覺(jué)得這個(gè)做出來(lái)的東西，還蠻有意思的。我們可以搜多個(gè)miRNA與多個(gè)基因間的關(guān)系：
然后，它就會(huì)生成這么一個(gè)特別草率的二型網(wǎng)絡(luò)圖……
點(diǎn)擊里面的miRNA這邊的方塊，就能顯示miRNA分別對(duì)于各個(gè)靶基因的關(guān)系：
嗯，邊上還有一個(gè)kegg的圖標(biāo)，這個(gè)是給你做好的這些靶基因位于哪些信號(hào)通路的結(jié)果，點(diǎn)一下就會(huì)顯示：
有這個(gè)基因所在的信號(hào)通路的位置，包含了它能結(jié)合的miRNA結(jié)合位點(diǎn)……可以直觀地看看miRNA到底作用在什么信號(hào)套路上。
當(dāng)然，對(duì)于基因，也有相應(yīng)的描述，比如，這個(gè)基因到底有多少個(gè)剪接異構(gòu)本：
分別是哪些剪接異構(gòu)本能結(jié)合你搜的這個(gè)miRNA：
可能你也沒(méi)考慮過(guò)不同的剪接異構(gòu)本，受到的miRNA的調(diào)控不一樣吧……
