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質(zhì)粒DNA的純化
常使用的純化方法都利用了質(zhì)粒DNA 相對較小及共價閉合環(huán)狀這樣兩個性質(zhì)。例如,用氯化銫-溴化乙錠梯度平衡離心分離質(zhì)粒和染色體DNA 就取決于溴化乙錠與線狀以及與閉環(huán)DNA分子的結(jié)合量有所不同。溴化乙錠通過嵌入奮不顧身堿基之間而與DNA結(jié)合,進而使雙螺旋解旋。由此導(dǎo)致線狀DNA的長度有所增加,作為補償,將在閉環(huán)質(zhì)粒DNA中引入超螺旋單位。后,超螺旋度大為增加,從而阻止了溴化乙錠分了的繼續(xù)嵌入。但線狀分子不受此限,可繼續(xù)結(jié)合更多的染料,直至達到飽和(每2個堿基對大約結(jié)合1個溴化乙錠分子)。由于染料的結(jié)合量有所差別,線狀和閉環(huán)DNA分了在含有飽和量溴化乙錠的氯化銫度中的浮力密度也有所不同。多年來,氯化銫-溴化乙錠梯度平衡離心已成為制備大量質(zhì)粒DNA 的選方法。然而該過程既昂貴又費時,為此發(fā)展了許多替代方法。其中主要包括利用離子交換層析、凝膠過濾層析、分級沉淀等分離質(zhì)粒DNA和宿主DNA的方法。本實驗室采用離子交換層析法已可得到*純度的質(zhì)粒。
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