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上海申知心生物科技有限公司
主營產(chǎn)品： 高血脂癥動物模型,心血管疾病動物模型,缺血性心臟病動物模型 |
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SNP檢測
SNP檢測實驗原理：
單核苷酸多態(tài)性（Single Nucleotide Polymorphisms，SNP）是指基因組上單個核苷酸的變異，人類基因組平均每1000個就有一個SNP。它是由基因組DNA某一特定核苷酸位置上單個堿基的轉(zhuǎn)換、顛換、插入或缺失引起的點突變，使得群體之間和個體之間產(chǎn)生了差異。其中轉(zhuǎn)換和顛換發(fā)生頻率較高，轉(zhuǎn)換是指同型堿基之間的轉(zhuǎn)換，即嘌呤與嘌呤、嘧啶與嘧啶間；顛換是指發(fā)生在嘌呤與嘧啶之間的替換。事實上轉(zhuǎn)換的發(fā)生頻率占多數(shù)，且CG序列上出現(xiàn)的SNP為頻繁，而且多是C轉(zhuǎn)換為T，原因是CG中的C常因為甲基化自發(fā)地脫氨基后即成為胸腺嘧啶。
SNP檢測實驗流程：
1、直接測序法
1）樣品基因組DNA提取；
2）根據(jù)不同的區(qū)域進行引物設(shè)計、合成；
3）對樣品進行基因擴增并純化；
4）測序；
5）統(tǒng)計與分析。
2、PCR-RFLP分型法
1）PCR反應(yīng)；
2）PCR產(chǎn)物的酶切；
3）瓊脂糖凝膠電泳檢測。
3、TaqMan探針分型法（定量PCR）
1）DNA抽提和質(zhì)檢
2）引物/TaqMan探針設(shè)計與合成
3）熒光定量PCR檢測
4）測序
5）統(tǒng)計與分析。
4、Multiplex SNaPshot分型法
1）DNA抽提和質(zhì)檢
2）擴增、延伸引物的設(shè)計合成
3）擴增和延伸反應(yīng)
4）測序儀測序
5）數(shù)據(jù)統(tǒng)計與分析。
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