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炎癥性腸病苦不堪言?MALDI-7090成像技術揭秘其樣品組織復雜性
炎癥性腸病(Inflammatory Bowel Disease,IBD)是一組特定的腸道慢性疾病的統(tǒng)稱,主要包括潰瘍性結腸炎(UC)和 克羅恩氏?。–D)。IBD是病因不明的慢性和復發(fā)性炎癥,可增加患結腸炎相關癌癥的風險。當前的治療方法并非普遍有效,并且可能產生嚴重的不良影響。因此,早期發(fā)現(xiàn)和準確識別疾病類型對于采取正確的治療很重要。結腸組織很復雜,包含不同類型的細胞,因此需要一種細胞特異性的分析工具來改善診斷和預后。在這里,我們介紹了從IBD患者獲得的內窺鏡活檢的10微米(μm)空間分辨率的質譜成像(MSI)研究。由于脂質的組成在細胞類型之間有不同,因此脂質指紋可以充當每種病變的特征。
島津UK與西班牙巴斯克大學及巴利阿里群島帕爾馬大學附屬醫(yī)院消化內科共同研究MALDI成像技術,揭秘人炎癥性腸病樣品組織復雜性。
方 法
本研究的樣品收集得到了巴利阿里群島倫理研究委員會許可(IB 2118/13 PI)。將切除的人類結腸組織在液氮中速凍并冷凍切片,厚度為10μm。使用基質升華儀,將基質(1,5-二氨基萘, DAN)涂覆在組織切片上,并使用島津專為蛋白組學、組織成像設計的 MALDI-TOF-TOF (MALDI-7090)質譜儀采集數(shù)據(jù)(激光光斑直徑10μm,載物臺步長10μm,掃描范圍200-1200 Da)。
圖1 MALDI-7090
人體結腸的解剖學對MALDI-MS具有挑戰(zhàn)性,隱窩的襯里由單細胞厚層輪廓組成。因此,精心優(yōu)化的樣品制備和能夠實現(xiàn)高空間分辨率的MALDI儀器的結合對于提供結腸組織的準確表示至關重要。圖2顯示了m / z 861.550和885.550的MALDI圖像,以及相應的H&E染色部分和分割圖像。固有層,隱窩和肌層清晰可見,這得益于MALDI-7090的10um空間分辨率。
圖2、H&E的顯微鏡圖像與MALDI MS圖像(左)。離子分布的多重性表明,m / z 861.550處的離子特定于隱窩單元,而m / z 885.550處的離子特定于固有層。分割圖像(右)顯示上皮(白色)和固有層(橙色)之間的清晰分離。
采用6個潰瘍性結腸炎,6個對照組,7個克羅恩病和 7個對照進行數(shù)據(jù)分析。即使在單個像素級別,也可獲得出色的信噪比, 可以進行(亞)細胞水平的分析。
圖3顯示了PCA分類的結果。使用相關算法對MALDI圖像進行分割,揭示了脂質成分的真正復雜性。每個細胞群體都具有*的脂質特征, 能夠識別結腸細胞,隱膜細胞, 淋巴細胞或巨噬細胞。
圖3、LP和上皮(隱窩)的脂質特征分析
對照和疾病之間,以及在LP和上皮之間,脂質組成存在明顯差異。
結 論
使用基質升華和MALDI-7090,我們能夠確定克羅恩病和潰瘍性結腸炎的活檢切片中的脂質分布。固有層和隱窩中脂質分布的比較分析突出了脂質表達的重要差異。更深入的分析揭示了一個復雜的結構,其中每種細胞類型都具有特征性的脂質指紋。脂質表達的部分差異可能是由于免疫系統(tǒng)的浸潤細胞所致,從而增加了在分析這些復雜樣本時對空間敏感技術MALDI成像技術的需求。
島津MALDI成像系統(tǒng),樣品處理采用基質升華涂覆方式,更好地形成結晶,自動化控制基質層厚度提高重復性。高性能的MALDI-7090,配有長壽命固態(tài)激光器,2kHz高速采集,UV自清潔技術,多用戶操作平臺可同時上載10塊靶板,是MALDI質譜成像、蛋白組學、脂類小分子、翻譯后修飾等研究理想平臺。