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島津4in1代謝組學(xué)高效分析方案,為雜交水稻的高水平研究提速增效!
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導(dǎo)讀
代謝組學(xué)分析,尤其是非靶向代謝組學(xué)樣品分析對(duì)儀器、方法有極高的要求:色譜分離、質(zhì)譜檢測(cè)需要盡可能覆蓋未知化合物,組學(xué)樣品又存在樣品珍貴、總分析時(shí)間長(zhǎng)、樣品基質(zhì)復(fù)雜、對(duì)質(zhì)譜負(fù)荷較重等問(wèn)題;因此如何在最短的分析時(shí)間內(nèi),消耗最少的樣品,覆蓋盡可能多的未知物,對(duì)質(zhì)譜端產(chǎn)生最小的污染負(fù)荷并維持?jǐn)?shù)據(jù)穩(wěn)定性,是非靶向代謝組學(xué)分析一直面臨的挑戰(zhàn)。
島津4in1技術(shù)方案:全譜二維+高分辨質(zhì)譜或三重四極桿質(zhì)譜
島津4in1技術(shù)方案,通過(guò)全譜二維寬極性分離+LCMS-9050的正負(fù)極同時(shí)掃描功能,相比常規(guī)液質(zhì)分析方法,可以節(jié)省3/4的樣品和總分析時(shí)間,減少質(zhì)譜3/4的分析負(fù)擔(dān),并通過(guò)平行設(shè)計(jì)實(shí)現(xiàn)充分平衡和清洗,減少了交叉污染和記憶效應(yīng),提高了系統(tǒng)穩(wěn)定性和重現(xiàn)性。利用4in1技術(shù)方案,島津與雜交水稻全國(guó)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室檢驗(yàn)檢測(cè)中心合作開(kāi)展不同口感黑米非靶向代謝組學(xué)研究,結(jié)果優(yōu)異,一起來(lái)看看吧!
代謝組學(xué)包含非靶向和靶向代謝組學(xué),前者對(duì)不同組別樣品中的未知目標(biāo)物或全組分進(jìn)行分析,后者針對(duì)已知目標(biāo)物進(jìn)行分析檢測(cè),兩者最終目的均是通過(guò)對(duì)比不同組別樣品中的成分差異,通過(guò)統(tǒng)計(jì)分析得到具體差異代謝物,從而指導(dǎo)、分析、解讀組別差異的因果、機(jī)理并展開(kāi)差異物的實(shí)際篩查應(yīng)用。目前的通用分析配置是:液相色譜作為前端分離系統(tǒng),高分辨質(zhì)譜或三重四極桿質(zhì)譜作為檢測(cè)器(前者用于非靶向,后者用于靶向)。
非靶向代謝組學(xué)分析的三大難點(diǎn)
代謝組學(xué)分析對(duì)色、質(zhì)譜的分離檢測(cè)能力、軟件數(shù)據(jù)里處理和統(tǒng)計(jì)分析功能、應(yīng)用人員方法設(shè)置等均有較高的門(mén)檻和要求,而非靶向代謝組學(xué)還有以下幾個(gè)特殊需求,增加了分析難度:
01對(duì)液相色譜的分析要求:
因非靶向代謝組學(xué)面對(duì)的是完全未知的目標(biāo)物,其極性范圍、化合物數(shù)量、分離條件等均無(wú)法預(yù)設(shè),因此無(wú)法使用單一色譜柱,如反相色譜柱或親水色譜柱做分離;
02對(duì)質(zhì)譜端的分析要求:
同樣因?yàn)槟繕?biāo)物完全未知,無(wú)法判斷目標(biāo)物的電離能力,因此正離子和負(fù)離子必須都要掃描檢測(cè);
03樣品特殊性:
樣品通常較珍貴,如動(dòng)物組織樣品、細(xì)胞樣品、血液樣品等,因此要求樣品消耗量/進(jìn)樣量盡可能少;樣品數(shù)量多,通常有2-5組樣品,每組樣品數(shù)必須大于6個(gè),因此總分析時(shí)間長(zhǎng),如果樣品分析循環(huán)次數(shù)增加,則總分析時(shí)間更為成倍增加;樣品基質(zhì)復(fù)雜,對(duì)質(zhì)譜污染負(fù)擔(dān)較大。樣品特殊性在非靶向和靶向樣品都存在。
基于以上原因,如何在最短的分析時(shí)間內(nèi),消耗最少的樣品,覆蓋盡可能多的未知物,對(duì)質(zhì)譜端產(chǎn)生最小的污染負(fù)荷并維持?jǐn)?shù)據(jù)穩(wěn)定性,是非靶向代謝組學(xué)分析一直面臨的挑戰(zhàn)。
島津4in1代謝組學(xué)技術(shù)方案
兩大硬件部分
為了解決以上非靶向代謝組學(xué)三方面的難點(diǎn),島津推出了4in1代謝組學(xué)技術(shù)方案。該方案硬件組成分為兩部分:
前端系統(tǒng)為全譜二維液相系統(tǒng)。該系統(tǒng)基于兩個(gè)授權(quán)發(fā)明專(zhuān)利:極性分流技術(shù)、在線稀釋技術(shù),是島津獨(dú)家產(chǎn)品,適合于未知物和全組分分析,可作為寬極性多目標(biāo)物數(shù)據(jù)庫(kù)的通用分離平臺(tái),并適用于極限相差較大的兩類(lèi)關(guān)聯(lián)物質(zhì)的同時(shí)分析,而且該系統(tǒng)內(nèi)含一個(gè)UHPLC子系統(tǒng),方便日常常規(guī)檢測(cè);而且該系統(tǒng)具有平行設(shè)計(jì),可實(shí)現(xiàn)1D和2D的充分平衡和清洗,減少了交叉污染和記憶效應(yīng),提高了系統(tǒng)穩(wěn)定性和重現(xiàn)性。
全譜二維液相系統(tǒng)
質(zhì)譜端為LCMS-9050高分辨質(zhì)譜(非靶向)或三重四極桿系列產(chǎn)品(靶向)。LCMS-9050是島津最新推出的新一代高分辨QTOF。這一款高分辨四極桿-飛行時(shí)間液質(zhì)聯(lián)用儀傳承了島津LCMS-9030的優(yōu)秀設(shè)計(jì),依然保持準(zhǔn)確度高,穩(wěn)定性好,靈敏度高、高分辨率的卓越性能。相對(duì)于其他品牌Q-TOF,其優(yōu)勢(shì)是極性切換時(shí)間大大縮短,最大采集速度提升至200Hz,可在同一時(shí)段進(jìn)行正負(fù)離子同時(shí)掃描,完成普通Q-TOF需要兩次進(jìn)樣才能完成的工作。
方案優(yōu)勢(shì)
基于以上兩個(gè)技術(shù),組合成為島津4in1技術(shù)方案。對(duì)于普通色譜系統(tǒng),為了覆蓋高低極性化合物,需要分別用HILIC和RPLC進(jìn)行分離;為了完成未知物正負(fù)離子掃描,需要各進(jìn)一針完成正離子和負(fù)離子分析,而島津4in1方案=全譜二維+LCMS-9050,具有以下兩方面優(yōu)勢(shì):
(1)通過(guò)寬極性分離+正負(fù)極同時(shí)掃描,實(shí)現(xiàn)4in1分析模式,從而節(jié)省3/4的樣品和總分析時(shí)間,并減少質(zhì)譜3/4的分析負(fù)擔(dān);
(2)通過(guò)平行設(shè)計(jì)實(shí)現(xiàn)1D和2D的充分平衡和清洗,減少了交叉污染和記憶效應(yīng),提高了系統(tǒng)穩(wěn)定性和重現(xiàn)性。
島津4in1一針?lè)治?/span>=普通系統(tǒng)4針?lè)治?/span>
案例分享-不同口感黑米非靶向代謝組學(xué)研究
雜交水稻全國(guó)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室檢驗(yàn)檢測(cè)中心
雜交水稻全國(guó)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室是國(guó)家首批批復(fù)建設(shè)的20家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室之一,其檢驗(yàn)檢測(cè)中心的分子檢測(cè)與品質(zhì)安全兩項(xiàng)工作在雜交水稻科技創(chuàng)新中起到了關(guān)鍵支撐作用,為雜交水稻的高質(zhì)量發(fā)展保駕護(hù)航。島津與雜交水稻全國(guó)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室檢驗(yàn)檢測(cè)中心合作,利用4in1技術(shù)方案,嘗試不同個(gè)口感黑米非靶向代謝組學(xué)研究,取得優(yōu)異成果,并由此促成成立了“雜交水稻全國(guó)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室檢驗(yàn)檢測(cè)中心-島津合作實(shí)驗(yàn)室”。
島津企業(yè)管理(中國(guó))有限公司分析計(jì)測(cè)事業(yè)部營(yíng)業(yè)部副部長(zhǎng)朱精華(左)與雜交水稻全國(guó)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室執(zhí)行主任孫傳清(右)為合作實(shí)驗(yàn)室揭牌
利用4in1方案分析雜交水稻全國(guó)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室檢驗(yàn)檢測(cè)中心提供的30個(gè)不同口感黑米,并混合制作了一個(gè)QC樣品。為了評(píng)估、校準(zhǔn)系統(tǒng)穩(wěn)定性,在批處理過(guò)程中加入10針QC樣品分析,進(jìn)樣序號(hào)分別是1-4號(hào),20號(hào),36-40號(hào),時(shí)間跨度26小時(shí)。最后將正負(fù)離子同事采集的10個(gè)QC樣品的TIC圖做疊加展示,可見(jiàn)數(shù)據(jù)重現(xiàn)性非常*;另外,在樣品中添加兩個(gè)內(nèi)標(biāo),一個(gè)為高極性正離子響應(yīng),一個(gè)為低極性負(fù)離子響應(yīng),并提取計(jì)算10個(gè)QC樣品中這兩個(gè)內(nèi)標(biāo)的質(zhì)量穩(wěn)定性,結(jié)果兩個(gè)內(nèi)標(biāo)質(zhì)量偏差均小于0.85ppm,結(jié)果理想,符合4in1分析的預(yù)期。
基于穩(wěn)定的色、質(zhì)譜表現(xiàn),通過(guò)統(tǒng)計(jì)分析得到了優(yōu)異的代謝組學(xué)分析結(jié)果:正離子模式共檢測(cè)到代謝特征峰11780個(gè),負(fù)離子模式共檢測(cè)到代謝特征峰13637個(gè);統(tǒng)計(jì)分析顯示組內(nèi)相對(duì)聚集,組間區(qū)分明顯,滿足后續(xù)代謝組學(xué)分析要求;最后通過(guò)分組PLS-DA分析及置換驗(yàn)證模型驗(yàn)證,兩兩對(duì)比(好口感黑米vs差口感黑米)得到1473個(gè)差異代謝物,并通過(guò)數(shù)據(jù)庫(kù)鑒定了其中767個(gè)差異物,包含了脂肪?;ⅫS酮類(lèi)、氨基酸、萜類(lèi)、芳香族、苯類(lèi)等物質(zhì)。
10針QC樣品TIC重疊圖
10針QC樣品中內(nèi)標(biāo)質(zhì)量數(shù)偏差
分析對(duì)比篩選出大量差異代謝物 (其中BMZ、SB為口感好黑米、YHM、HH為口感差黑米)
結(jié)語(yǔ)
為了解決非靶向代謝組學(xué)難點(diǎn),島津推出了4in1代謝組學(xué)技術(shù)方案:通過(guò)全譜二維寬極性分離+LCMS-9050的正負(fù)極同時(shí)掃描功能,可以節(jié)省3/4的樣品和總分析時(shí)間,減少質(zhì)譜3/4的分析負(fù)擔(dān);另外,系統(tǒng)采用了1D和2D的平行設(shè)計(jì),實(shí)現(xiàn)了充分平衡和清洗,減少了交叉污染和記憶效應(yīng),提高了系統(tǒng)穩(wěn)定性和重現(xiàn)性。將該方案應(yīng)用于不同口感黑米非靶向代謝組學(xué)研究,數(shù)據(jù)優(yōu)異,結(jié)果可靠,獲得了合作方雜交水稻全國(guó)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室檢驗(yàn)檢測(cè)中心的高度肯定!
撰稿人:鐘啟升
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