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[供應(yīng)]Rubicon R400491 ThruPLEX Plasma-seq Kit,血漿cfDNA illumina 靶向測(cè)序文庫(kù)
產(chǎn)地：美國(guó)
更新時(shí)間：2024-12-25 17:12:30
有效期：2024年12月25日 -- 2025年6月26日
已獲點(diǎn)擊：408
華雅旗下紅榮微再*代理TAKARA Rubicon 文庫(kù)構(gòu)建（illumina平臺(tái)）產(chǎn)品
1500 1904 520 紅榮微再-客服: 經(jīng)銷商專員
Rubicon ThruPLEX® Plasma-seq Kit
ThruPLEX與所有Illumina平臺(tái)兼容
產(chǎn)品英文名稱：ThruPLEX® Plasma-seq Kit
產(chǎn)品中文名稱：血漿來(lái)源cell free DNA NGS文庫(kù)構(gòu)建試劑
樣本：血漿來(lái)源的cfDNA（cell free DNA）和ctDNA（循環(huán)腫瘤DNA）
用途：WGS，WES，靶向測(cè)序，ctDNA分析
ThruPLEX® Plasma-seq基于ThruPLEX技術(shù)，并用于血漿來(lái)源cfDNA高品質(zhì)NGS文庫(kù)（illumina平臺(tái)）構(gòu)建。
該試劑專門針對(duì)cell-free DNA進(jìn)行優(yōu)化，在保持樣本GC代表性的基礎(chǔ)上，提升了文庫(kù)的信息容量。文庫(kù)構(gòu)建后可用于CNV分析、全基因組測(cè)序分析或是采用一些panel針對(duì)目標(biāo)區(qū)域進(jìn)行捕獲富集后的DNA分析,如Agilent SureSelect® and Roche NimbleGen SeqCap® EZ。
血漿樣品采用ThruPLEX Plasma-seq試劑盒制備文庫(kù)，能有更好的靈敏度、更準(zhǔn)確的基因變異分析結(jié)果。與其它液體活檢的樣品一樣，血漿由于其易獲得、價(jià)值高的特點(diǎn)，深受研究腫瘤學(xué)或者孕婦血漿中胎兒游離DNA科研工作者的重視。
產(chǎn)品特點(diǎn)
專為cfDNA設(shè)計(jì)：修復(fù)及連接試劑配方更新，方法優(yōu)化
高品質(zhì)NGS文庫(kù)：在寬廣的GC含量范圍內(nèi)，可以達(dá)到高檢測(cè)再現(xiàn)性
起始量范圍廣：＜1 ng到30 ng cfDNA量
快速簡(jiǎn)便：?jiǎn)喂堋?/span>2小時(shí)、3步操作步驟，無(wú)需純化或樣品轉(zhuǎn)移步驟
應(yīng)用領(lǐng)域：液體活檢、ctDNA、靶向測(cè)序等領(lǐng)域文庫(kù)構(gòu)建
兼容自動(dòng)化平臺(tái)：Beckman® FXP Workstation
ThruPLEX與所有Illumina平臺(tái)兼容
Designed for cell-free DNA: newly formulated repair and ligation reagents with optimized protocols
High performance NGS libraries: high diversity with broad and reproducible GC coverage
Variable sample input: <1 ng to 30 ng of cell-free DNA
Fast and simple workflow: 3 steps in a single tube or well in 2 hours with no purification or sample transfer steps
Research applications: libraries from samples where results require high sensitivity including liquid biopsies, ctDNA, and targeted sequencing
Automation-friendly: Beckman® FXP Workstation
產(chǎn)品應(yīng)用
WGS，WES，靶向測(cè)序，ctDNA分析
cfDNA文庫(kù)構(gòu)建，腫瘤及產(chǎn)前*檢測(cè)（母體血漿中胎兒游離DNA分析）
ThruPLEX Plasma-seq 優(yōu)化用于cell-free DNA等液體活檢樣品
液體活檢樣品包括
循環(huán)核酸
– Cell-free DNA (cfDNA)
• 循環(huán)腫瘤DNA（ctDNA）占一小部分
及RNA 外泌體等
ThruPLEX技術(shù)原理
ThruPLEX技術(shù)和所有Illumina NGS平臺(tái)兼容。
技術(shù)要點(diǎn)：莖環(huán)形接頭
莖環(huán)形接頭的特別設(shè)計(jì)，免去了大多數(shù)Illumina等文庫(kù)制備技術(shù)需要的中間純化和樣品轉(zhuǎn)移步驟。整個(gè)實(shí)驗(yàn)只需15分鐘手動(dòng)操作且為1個(gè)反應(yīng)管、2個(gè)小時(shí)、3步反應(yīng)的簡(jiǎn)單過(guò)程。僅在PCR反應(yīng)后進(jìn)行1次磁珠純化，純化造成的樣品損失低，可對(duì)珍貴樣品進(jìn)行有效分析。
產(chǎn)品使用
適用樣本：液體活檢樣本
1ng-30ng 血漿、尿液來(lái)源的cfDNA
組份
分模板準(zhǔn)備、文庫(kù)合成和文庫(kù)擴(kuò)增三大部分。保存-20℃。
Template Preparation Buffer 模板準(zhǔn)備緩沖液（紅色）
Template Preparation Enzyme 模板準(zhǔn)備酶（紅色）
Library Synthesis Buffer文庫(kù)合成緩沖液（黃色）
Library Synthesis Enzyme文庫(kù)合成酶（黃色）
Library Amplification Buffer文庫(kù)擴(kuò)增緩沖液（綠色）
Library Amplification Enzyme文庫(kù)擴(kuò)增酶（綠色）
Nuclease-Free water 無(wú)核酸酶水（無(wú)色）
Indexing 試劑（藍(lán)色）
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自備材料：
PCR管或96孔PCR板和密封件
Low binding aerosol barrier tips
新鮮制備的80％（v / v）乙醇
Agencourt® AMPure® XP 磁珠（Beckman Coulter，目錄號(hào)A63880）
可選試劑：
KAPA®Library Quantification Kit – Illumina (Kapa Biosystems, CAT. NO. specific to real time PCR system used)
EvaGreen® Dye (20X in water, Biotium, CAT. NO. 31000-T)
Fluorescein Calibration Dye (Bio-Rad Laboratories, CAT. NO. 170-8780)
簡(jiǎn)單的工作流程：一管反應(yīng)
樣品加入PCR管。
準(zhǔn)備模版修復(fù)混合液1（紅蓋），加入PCR管，反應(yīng)。
準(zhǔn)備文庫(kù)合成混合液2（黃蓋），加入PCR管，反應(yīng)。
準(zhǔn)備文庫(kù)擴(kuò)增混合液3（綠蓋），加入PCR管，反應(yīng)。
產(chǎn)品性能
高cell-free DNA文庫(kù)多樣性、更少的Unmapped Reads。ThruPLEX Plasma-seq Kit構(gòu)建的文庫(kù)，具有高的多樣性和低的duplicates和unmapped reads。圖中表示cfDNA分別提取于3份血漿樣品，文庫(kù)定量采用Qubit熒光定量。Bioanalyzer測(cè)定mononucleosomal DNA在各樣品的量分別為0.09 ng、0.62 ng、15.44 ng。Pooled libraries采用illumina NextSeq 500 paired end模式測(cè)序，且每個(gè)文庫(kù)產(chǎn)生17 M到25 M reads。每個(gè)文庫(kù)在down-sampling數(shù)據(jù)至17 M reads以后，計(jì)算Duplication rates。
Rubicon R400490/R400491/R400492 訂購(gòu)信息
貨號(hào) | 名稱 | 規(guī)格 | 價(jià)格 |
R400490 | ThruPLEX Plasma-seq 12S Kit | 12 Rxns | ￥9109 |
R400491 | ThruPLEX Plasma-seq 48S Kit | 48 Rxns | ￥31533 |
R400492 | ThruPLEX Plasma-seq 96D Kit | 96 Rxns | ￥56760 |
Rubicon公司成立于2000年，總部位于美國(guó)密歇根州。產(chǎn)品都擁有技術(shù)，檢控嚴(yán)格，擁有cGMP級(jí)生產(chǎn)能力，是單細(xì)胞測(cè)序文庫(kù)構(gòu)建的。2017年1月，Rubicon 成為Takara的一員，并且發(fā)展良好。
華雅再生醫(yī)學(xué)旗艦公司：紅榮微再（上海）生物工程技術(shù)有限公司主營(yíng)細(xì)胞治療和精準(zhǔn)醫(yī)療等產(chǎn)品，2018年與TAKARA繼續(xù)合作，*代理（上海）其旗下Rubicon單細(xì)胞文庫(kù)構(gòu)建試劑等產(chǎn)品。
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