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原代細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)NanoString Technologies的科學(xué)家發(fā)現(xiàn),細(xì)胞群體的RNA平均表達(dá)水平不一定與群體中單個(gè)細(xì)胞的RNA表達(dá)相同。例如,有些基因持續(xù)在低水平表達(dá),而另一些則在短時(shí)間內(nèi)大量表達(dá)。對宏觀測定而言,這樣的表達(dá)模式被平均化。
該公司*的數(shù)字表達(dá)譜分析系統(tǒng)能直接對單個(gè)RNA分析進(jìn)行計(jì)數(shù),zui多可分析單細(xì)胞中的800個(gè)不同分子。這是利用nCounter Single Cell Gene Expression Assay中的分子條形碼來實(shí)現(xiàn)的,它識別特定的RNA分子。單細(xì)胞樣品在裂解后,經(jīng)過逆轉(zhuǎn)錄和預(yù)擴(kuò)增,隨后與分子條形碼雜交,純化后在nCounter®分析儀上讀取。
哈佛大學(xué)的Hongkun Park研究小組與Broad研究院的Aviv Regev研究小組合作,來研究看似均質(zhì)細(xì)胞中的基因表達(dá)異質(zhì)性1。Park、Regev及其同事利用一種稱為Smart-Seq的技術(shù),來讀取RNA轉(zhuǎn)錄本的覆蓋。與原先的RNA-Seq方法相比,Smart-Seq讓研究人員能夠更詳細(xì)了解mRNA選擇性剪接所產(chǎn)生的異構(gòu)體,同時(shí)更好地鑒定單核苷酸多態(tài)性(SNP)。
通過計(jì)算機(jī)分析,Regev和Park發(fā)現(xiàn),mRNA豐度和剪接模式都存在之前未觀察到的雙峰(bimodal)變化,并通過RNA-熒光原位雜交(FISH)對精選轉(zhuǎn)錄本進(jìn)行了驗(yàn)證。如今,他們正在擴(kuò)展樣品類型。Park談道:“目前我們正將原代細(xì)胞RNA-Seq方法應(yīng)用在各種免疫細(xì)胞、神經(jīng)細(xì)胞和癌癥細(xì)胞上,以便了解驅(qū)動細(xì)胞之間變化的因素、這種變化的動力學(xué)及其生物學(xué)影響。”
H-ras/Ras/Ras p21 磷酸化周期素E抗體
Hrasls3/HREV107 磷酸化周期素E抗體
HRG Beta1 磷酸化周期素B1抗體
HRG-alpha 磷酸化周期素B1抗體
HRH3/GPCR97 磷酸化周期素B1抗體
HRH4/GPCR105 磷酸化周期素B1抗體
HSA 磷酸化周期蛋白依賴激酶抑制因子1C抗體
HSA 磷酸化腫瘤易感候選基因3抗體
HSA 磷酸化腫瘤抑制基因PTEN抗體
HSD11B1/HSD1 磷酸化腫瘤抑制基因PTEN抗體
HSD11B2/HSD2 磷酸化腫瘤抑制基因P53抗體
HSD17B1 磷酸化腫瘤抑制基因P53抗體
HSD17B2 磷酸化腫瘤抑制基因P53抗體
原代細(xì)胞
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