全面了解界定肺功能的細(xì)胞和微環(huán)境對(duì)于減少肺部疾病的影響非常重要，目前肺部疾病在全球死亡原因中占比明顯。肺除了主要的氣體交換功能外，還有重要的屏障功能。雖然其他粘膜屏障組織通過明確的粘膜相關(guān)淋巴組織(MALT)調(diào)節(jié)適應(yīng)性免疫，但在健康人類肺部尚未報(bào)道這種次級(jí)淋巴結(jié)構(gòu)。LungMAP和人類肺細(xì)胞圖譜(HLCA)聯(lián)盟利用了單細(xì)胞和單核RNA測(cè)序(scRNA-seq和snRNA-seq)的最新進(jìn)展，并生成了許多描述跨物種、健康和疾病的肺細(xì)胞類型的圖譜。
目前的圖譜優(yōu)先考慮實(shí)質(zhì)組織，很少有研究檢查氣道的全深度。研究人員從死亡器官捐贈(zèng)者的健康肺和氣道中進(jìn)行了深層組織分析，允許沿著呼吸樹的近端到遠(yuǎn)端軸描述細(xì)胞類型。
相關(guān)研究發(fā)表在《Nature Genetics》上，文章標(biāo)題為：“A spatially resolved atlas of the human lung characterizes a gland-associated immune niche"。
研究人員使用無偏空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)(ST)方法，在健康人類肺和氣道的組織微環(huán)境中對(duì)細(xì)胞類型和狀態(tài)進(jìn)行背景分析，為HLCA添加了一個(gè)關(guān)鍵維度。
總的來說，共測(cè)序了129,340個(gè)單細(xì)胞和63,768個(gè)單核，并對(duì)來自人類氣管、支氣管和上下薄壁的20個(gè)組織切片進(jìn)行了Visium ST。這些數(shù)據(jù)和CellTypist自動(dòng)注釋模型可在lungcellatlas.org上獲得，作為數(shù)據(jù)下載、懸浮和空間基因表達(dá)分析的資源，以及新數(shù)據(jù)集的自動(dòng)注釋。
研究人員區(qū)分了80種細(xì)胞類型和狀態(tài)，其中包括11種在以前的肺圖譜研究中未注釋的細(xì)胞群。這些人群中許多表達(dá)功能性全基因組關(guān)聯(lián)研究(fGWAS)分析突出的疾病相關(guān)基因。我們深入的組織分析與空間基因組學(xué)結(jié)合，在全分子寬度上重建了肺和氣道中的已知組織微環(huán)境。超越已知的細(xì)胞組織單位，我們?cè)跉獾勒衬は孪?SMG)確定了IgA漿細(xì)胞先前未定義的免疫生態(tài)位。
分子相關(guān)實(shí)驗(yàn)室，需要經(jīng)常對(duì)環(huán)境中的DNA、RNA及DNA酶、RNA酶進(jìn)行高效清除及控制，推薦使用MB公司的PCR Clean，即用型產(chǎn)品，保障分子實(shí)驗(yàn)結(jié)果的穩(wěn)定。
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