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            BD單細胞測序聯(lián)合Absin多色,共同探索腦部腫瘤微環(huán)境

            閱讀:1144      發(fā)布時間:2022-12-15
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            腦惡性腫瘤又常稱為腦癌,分原發(fā)性和繼發(fā)性兩大類:原發(fā)性腦惡性腫瘤以腦膠質瘤最多,是一種起源于腦神經膠質細胞的腫瘤;繼發(fā)性腫瘤主要是指其他部位的腫瘤轉移到腦內形成的腦轉移性腫瘤,其發(fā)病率約是原發(fā)腫瘤的10倍,肺癌就是常見的原發(fā)癌種之一。

            2022年11月6日,復旦大學腫瘤醫(yī)院金偉教授和曹依群教授團隊在Clin. Transl. Med(IF=8.554)上發(fā)表了題為“Single-cell RNA sequencing reveals cellular and molecular reprograming landscape of gliomas and lung cancer brain metastases"的文章,通過scRNA-seq技術(BD Rhapsody system)聯(lián)合多重熒光免疫組化(abs50015,Absin),解析了GM和LC細胞的異質性,發(fā)現(xiàn)了一組具有特異性分子標記的干細胞樣細胞,對于肺癌腦轉移的免疫療法有重要的指導性意義。




            取樣、測序、分析和組織原位驗證的全流程

            研究中,科學家們發(fā)現(xiàn)一部分增殖巨噬細胞簇與不良預后相關。氣泡圖顯示了中樞神經系統(tǒng)駐留小膠質細胞(CNS)以及單核細胞來源的巨噬細胞(MDMs)表達TAMs相關基因的情況,其中CD163在MDMs高表達,而在CNS顯著低表達。通過小提琴圖分析可得,TOP2A基因在增殖巨噬細胞的分布(后兩列),中位值都比其他細胞更好。后續(xù)研究團隊通過對TOP2A和CD163進行多重免疫熒光染色在組織蛋白層面驗證了細胞群。


            癌癥干細胞(CSCs)是會導致癌癥轉移和化療或放療耐藥性的細胞亞群。研究團隊通過拷貝數(shù)變異分析鑒定了惡性細胞并劃分為10個惡性上皮細胞亞群,基于CytoTRACE分析和擬時序分析顯示,惡性上皮細胞亞群中Mep_C3和C8分化程度較低,可能包含CSCs。為了證實Mep_C3和_C8在LC組織中的存在,團隊通過多重免疫組化檢測了主要標記物的表達(EPCAM/DKK1/TRIM29),發(fā)現(xiàn)DKK1和TRIM29在這些細胞中特異性富集。



            總的來說,團隊的研究結果為小膠質細胞、巨噬細胞、中性粒細胞、ECs和T細胞的特征提供了特別的見解,還發(fā)現(xiàn)了癌癥干細胞的一個子集,這將加深對大腦腫瘤微環(huán)境的理解,從而為精準醫(yī)療的患者管理提供一些改善思路。

             

            多色小知識

            多色即多重熒光免疫組化(mIHC),主要原理來自TSA技術,TSA即酪酰胺信號放大(Tyramide signal amplification)是一類利用辣根過氧化酶(HRP)對靶蛋白或核酸進行高密度原位標記的酶學檢測方法。該技術可與高性能染料Alexa Fluor®、傳統(tǒng)熒光染料和比色檢測系統(tǒng)相兼容。

            TSA主要原理是利用酪胺Tyramide的過氧化物酶反應(酪胺鹽在HRP催化H2O2下形成共價鍵結合位點),產生大量的酶促產物,該產物能與周圍的蛋白殘基(包括色氨酸、組氨酸和酪氨酸殘基)結合,這樣在抗原-抗體結合部位就有大量的生物素沉積,與隨后加入的Streptavidin—HRP/熒光基團結合,經幾次這樣的循環(huán)放大,可以結合大量的酶分子or熒光基團,結果使其檢測信號得到幾何級放大。

            簡單來說,用這種方法做多重熒光染色是利用二抗上帶有的HRP(而不是直接偶聯(lián)熒光素),來催化后續(xù)添加入體系的非活性熒光素。該熒光素在HRP和過氧化氫的作用下被活化,跟臨近蛋白的酪氨酸殘基共價偶聯(lián),使得蛋白樣品與熒光素穩(wěn)定結合。然后進行微波處理,前一輪非共價結合的抗體被洗掉,共價結合的熒光素還留存在樣品上。再換個一抗來第二輪孵育,周而復始。等到所有抗體孵育結束,熒光素都結合好后,最后去檢測結果。



            TSA多重熒光免疫組化染色示意圖

            “墻裂"安利:Absin多色一站式解決方案

            ★ 多重熒光免疫組化試劑盒(有儀器,自己做,操作簡便,染料二抗全部具備?。?br/>

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            abs50012

            四色多重熒光免疫組化染色試劑盒(鼠兔二抗)

            20T/100T

            現(xiàn)貨

            abs50028

            四色多重熒光免疫組化染色試劑盒(兔二抗)

            20T/100T

            現(xiàn)貨

            abs50013

            五色多重熒光免疫組化染色試劑盒(鼠兔二抗)

            20T/100T

            現(xiàn)貨

            abs50029

            五色多重熒光免疫組化染色試劑盒(兔二抗)

            20T/100T

            現(xiàn)貨

            abs50014

            六色多重熒光免疫組化染色試劑盒(鼠兔二抗)

            20T/100T

            現(xiàn)貨

            abs50030

            六色多重熒光免疫組化染色試劑盒(兔二抗)

            20T/100T

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            abs50015

            七色多重熒光免疫組化染色試劑盒(鼠兔二抗)

            20T/100T

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            abs50031

            七色多重熒光免疫組化染色試劑盒(兔二抗)

            20T/100T

            現(xiàn)貨


            個性化服務(先做預實驗,實驗有保障?。?/strong>



            標準化檢測高性價比,已優(yōu)化過條件只需提供樣本,直接出實驗結果!強烈推薦!



            種屬

            六色  FLASH panel

            應用

            備注

            panCK、CD3、CD19、CD68、CD56

            常規(guī)腫瘤浸潤淋巴細胞panel,可評估腫瘤微環(huán)境冷熱,方便探究腫瘤抑制手段效果

            可更換其他免疫細胞指標及腫瘤指標

            小鼠

            panCK、CD3、CD19、F4/80、NK1.1

            CD4、CD8、LAG3、TIM-3、PD-1

            涵蓋多熱門免疫檢查點

            可替換其他染過的免疫檢查點指標

            小鼠

            CD4、CD8、LAG3、TIM-3、PD-1

            種屬

            五色  FLASH panel

            應用

            備注

            CD3、CD4、CD8、FOXP3

            T細胞分型panel

            FOXP3可替換為TH1指標T-bet或者TH2指標GATA-3

            小鼠

            CD3、CD4、CD8、FOXP3

            panCK、CD68、CD163、HLA-DR

            腫瘤相關巨噬細胞TAM及分型panel

            小鼠

            panCK、F4/80、CD86、CD163

            panCK、CD8、PD-1、PD-L1

            經典PD-1/PDL1可行性分析panel

            種屬

            四色  FLASH panel

            應用

            備注

            a-SMA、panCK、VEGF

            腫瘤相關成纖維及血管生成因子

            可更換FAP、VIM、FGF等相關因子

            小鼠

            a-SMA、panCK、VEGF

            CD8、ki-67、Granzyme B

            T細胞活化及增殖panel

            小鼠

            CD8、ki-67、Granzyme B


            參考文獻:

            Sun HF, Li LD, Lao IW, Li X, Xu BJ, Cao YQ, Jin W. Single-cell RNA sequencing reveals cellular and molecular reprograming landscape of gliomas and lung cancer brain metastases. Clin Transl Med. 2022 Nov;12(11):e1101. doi: 10.1002/ctm2.1101. PMID: 36336787; PMCID: PMC9637666.


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