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            首頁   >>   技術(shù)文章   >>   外泌體miRNA可通過細(xì)胞衰老途徑參與結(jié)腸炎發(fā)生?

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            外泌體miRNA可通過細(xì)胞衰老途徑參與結(jié)腸炎發(fā)生?

            閱讀:850      發(fā)布時間:2023-8-30
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            外泌體是直徑為30-200nm的小囊泡,幾乎來自所有細(xì)胞[1]。外泌體中包裹了RNA、DNA、蛋白質(zhì)和脂質(zhì),通過在不同細(xì)胞之間的傳遞,介導(dǎo)多種生理和病理過程。作為小的非編碼單鏈RNA,microRNAs (miRNAs)通過轉(zhuǎn)錄后抑制基因表達(dá),顯著調(diào)節(jié)細(xì)胞生長和代謝,可以被包裝在外泌體中以防止RNase的消化并進(jìn)入循環(huán),可作為潛在的疾病生物標(biāo)志物[2]。


            圖1 外泌體miRNA分泌機(jī)制

             

            2023年8月7日,武漢大學(xué)人民醫(yī)院董衛(wèi)國教授團(tuán)隊在國際學(xué)術(shù)期刊Gut Microbes在線發(fā)表了題為“Exosomal-miR-129-2-3p derived from Fusobacterium nucleatum-infected intestinalepithelial cells promotes experimental colitisthrough regulating TIMELESS-mediated cellular senescence pathway"研究性論文(IF 12.2)。該研究揭示了具核梭桿菌(Fusobacterium nucleatum,F(xiàn)n)通過外泌體加重潰瘍性結(jié)腸炎(UC)的分子機(jī)制,為UC的診斷和靶向治療提供了新的理論支持。


            圖2 文章信息

             

            核梭桿菌(Fn)感染可加劇潰瘍性結(jié)腸炎(UC)。然而,F(xiàn)n感染的腸上皮細(xì)胞(IEC)衍生外泌體(Fn-Exo)與UC進(jìn)展之間的聯(lián)系尚未被研究。該研究通過miRNA測序鑒定了Fn-Exo和未感染的IEC衍生外泌體(Con-Exo)中差異表達(dá)的miRNA。然后,在體外和體內(nèi)確定Fn-Exo在UC發(fā)育中的生物學(xué)作用和機(jī)制。作者發(fā)現(xiàn)外泌體將miR-129-2-3p從Fn感染的IECs傳遞到未感染的IECs,加劇上皮屏障功能障礙和實驗性結(jié)腸炎。機(jī)制上,F(xiàn)n-Exo通過miR-129-2-3p/TIMELESS軸誘導(dǎo)DNA損傷,隨后激活A(yù)TM/ATR/p53通路,最終促進(jìn)細(xì)胞衰老和結(jié)腸炎癥??傊?,Exo-miR-129-2-3p/TIMELESS/ATM/ATR/p53通路加重了細(xì)胞衰老、屏障損傷和實驗性結(jié)腸炎。目前的研究揭示了Fn感染性UC進(jìn)展中的一個前所未知的調(diào)控途徑。此外,血清中的外泌體-miR-129-2-3p可能作為UC和Fn-high-UC的新型潛在診斷生物標(biāo)志物[3]。


            圖3 Fn-Exo在結(jié)腸炎中的作用和機(jī)制示意圖

             

            一、愛必信擁有全套的外泌體&miRNA解決方案



            圖4 愛必信外泌體&miRNA解決方案

             

            1、miRNA提取

            一般來說,傳統(tǒng)的TRIzol及其它常用的RNA提取試劑盒提取的是較大分子的RNA,包括rRNA和mRNA,但對miRNA的提取效果不佳。這可能是因為如此小的核酸分子不易被醇類沉淀、也不易被核酸純化膜和磁珠吸附捕捉的原因。因而,要較好地提取miRNA,必須采取一些新的思路和方法。根據(jù)目前的研究結(jié)果顯示,miRNA富集法應(yīng)該是一種不錯的選擇。其原理為,先使用富集試劑將含量較低、分子量較小的miRNA聚集在一起,再使用核酸純化柱進(jìn)行提取。顯然,miRNA聚集后更加有利于miRNA的吸附和捕捉,從而得以有效地提升miRNA的提取得率。

            愛必信研發(fā)了可高效提取各樣本中miRNA的專門試劑盒,與部分同類試劑盒相比,顯著提升了miRNA的提取效率。

            1)采用特殊的消化技術(shù),去除較大分子的DNA和rRNA, 使miRNA更容易分離提取
            2)采用miRNA富集技術(shù),使miRNA聚集起來,使之更容易被核酸純化膜吸附純化,大幅提升miRNA的提取效率;
            3)操作簡便,只需30多分鐘即可獲得理想的miRNA提取結(jié)果。

             


            貨號

            產(chǎn)品名稱

            規(guī)格

            abs60262

            細(xì)胞miRNA提取試劑盒

            30T/60T

            abs60260

            血液miRNA提取試劑盒

            30T/60T

            abs60261

            組織miRNA提取試劑盒

            30T/60T

            abs60263

            外泌體RNA提取試劑盒

            50T/100T

            abs60264

            血漿血清miRNA提取試劑盒

            50T/100T









            2、miRNA逆轉(zhuǎn)錄&qPCR

            miRNA逆轉(zhuǎn)錄的難點在于其分子較小,逆轉(zhuǎn)錄引物無法理想地與miRNA結(jié)合。顯然,進(jìn)行miRNA逆轉(zhuǎn)錄時,需要對miRNA分子進(jìn)行加長改造。有兩種方法可達(dá)到這一目的:一種采用Poly(A)加尾法,另一種采用莖環(huán)法。對于加尾法逆轉(zhuǎn)錄來說,miRNA能否有效加長的關(guān)鍵在于Poly(A)聚合酶的活性。Poly(A)聚合酶活性高,就可以在短時間內(nèi)給miRNA加上較長的Poly(A)尾巴,使miRNA分子能夠高效地結(jié)合Oligo(dT)引物。另外Oligo(dT)引物的設(shè)計也至關(guān)重要,如果是簡單的Oligo(dT),引物與miRNA的結(jié)合往往會發(fā)生錯位,導(dǎo)致逆轉(zhuǎn)錄效率降低。高效的Oligo(dT)引物應(yīng)該加入錨定堿基,從而使二者的結(jié)合更加特異高效。莖環(huán)法逆轉(zhuǎn)錄成功的關(guān)鍵在于莖環(huán)的設(shè)計,該莖環(huán)應(yīng)能高效地與miRNA 3’端特異、高效地結(jié)合,同時還要能夠順利地折疊和打開。

            miRNA qPCR相對較為簡單,主要有染料法和探針法。兩種方法相比,探針法特異性更強(qiáng)。不過如果miRNA能夠高效提取,并且miRNA qPCR逆轉(zhuǎn)錄成功,無論miRNA qPCR選擇何種方法,一般都會有較為理想的結(jié)果。

            二、加尾法逆轉(zhuǎn)錄VS頸環(huán)法逆轉(zhuǎn)錄如何選擇?

            選擇何種miRNA逆轉(zhuǎn)錄以及定量方法,主要由實驗來決定。對于從事較多miRNA(3個以上)研究的研究者來說,選用加尾法逆轉(zhuǎn)錄試劑盒較好,因為一次逆轉(zhuǎn)錄后可以進(jìn)行多個miRNA的qPCR擴(kuò)增,省去了很多的實驗操作。但對于只檢測1-2個miRNA的研究者來說,選用莖環(huán)法比較合適,因為莖環(huán)法逆轉(zhuǎn)錄結(jié)果更加特異。


            貨號

            產(chǎn)品名稱

            規(guī)格

            加尾染料法

            abs60265

            miRNA加尾法逆轉(zhuǎn)錄試劑盒

            20T/40T

            abs60266

            miRNA加尾法逆轉(zhuǎn)錄試劑盒(血漿)

            25T/50T

            abs60271

            miRNA加尾染料法熒光定量PCR試劑盒

            200T/300T/400T

            探針法

            abs60267

            miRNA探針法逆轉(zhuǎn)錄試劑盒

            20T/40T

            abs60268

            miRNA探針法逆轉(zhuǎn)錄試劑盒(血漿)

            20T/40T

            abs60272

            miRNA探針法熒光定量PCR試劑

            100T/200T/400T

            莖環(huán)染料法

            abs60269

            miRNA莖環(huán)法逆轉(zhuǎn)錄試劑盒

            25T/50T

            abs60270

            miRNA莖環(huán)染料法熒光定量PCR試劑盒

            200T/400T






            需要特別注意的是,miRNA逆轉(zhuǎn)錄試劑盒和miRNA qPCR試劑盒一般是配套使用的,研究者最好買我公司配套的miRNA逆轉(zhuǎn)錄試劑和qPCR試劑,否則,有可能出現(xiàn)實驗失敗。其主要原因是逆轉(zhuǎn)錄引物上往往設(shè)計有qPCR引物結(jié)合序列,如果買不同廠家的試劑,qPCR引物可能無法特異地結(jié)合逆轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物。另外,對于初學(xué)者而言,miRNA上游引物的設(shè)計有一定難度,往往既花了時間,又得不到好的實驗結(jié)果,建議最好購買能夠贈送上游引物的逆轉(zhuǎn)錄試劑生產(chǎn)廠家。

            1)凡購買miRNA逆轉(zhuǎn)錄和定量試劑盒一套,即可免費獲得逆轉(zhuǎn)錄&qpCR引物;
            2)凡購買miRNA逆轉(zhuǎn)錄和定量試劑盒一套支持miRNA引物定制合成服務(wù)。

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            參考文獻(xiàn)


            [1] Pegtel DM, Gould SJ. Exosomes. Annu Rev Biochem. 2019;88:487–514. doi: 10.1146/annurev-biochem-013118-111902.

            [2] Jeppesen DK, Fenix AM, Franklin JL, Higginbotham JN, Zhang Q, Zimmerman LJ, Liebler DC, Ping J, Liu Q, Evans R, et al. Reassessment of exosome composition. Cell. 2019;177(2):428–445.e18. doi: 10.1016/j.cell.2019.02.029.

            [3] Wei S, Wu X, Chen M, Xiang Z, Li X, Zhang J, Dong W. Exosomal-miR-129-2-3p derived from Fusobacterium nucleatum-infected intestinal epithelial cells promotes experimental colitis through regulating TIMELESS-mediated cellular senescence pathway. Gut Microbes. 2023 Jan-Dec;15(1):2240035. doi: 10.1080/19490976.2023.2240035. PMID: 37550944; PMCID: PMC10411316.

             

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