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            關(guān)于WB實驗中的marker,你應(yīng)該知道的事

            閱讀:2016      發(fā)布時間:2024-10-23
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            1、什么是蛋白marker?

             

            蛋白Marker,也稱為蛋白質(zhì)分子量標(biāo)準(zhǔn)(Protein Molecular Weight Marker),是用于蛋白質(zhì)電泳分析中的一系列已知分子量的蛋白質(zhì)混合物。它們通常包含多個不同分子量的蛋白質(zhì)條帶,這些條帶在電泳過程中會根據(jù)分子量的大小和電荷差異遷移不同的距離,從而在凝膠上形成一系列有序的條帶。

             

            2、Marker在WB中的作用?

             

            分子量標(biāo)定:Marker包含一系列已知分子量的蛋白質(zhì),通過與Marker上的帶狀蛋白質(zhì)帶進(jìn)行比較,可以精確地確定待測蛋白的分子量;

            驗證電泳和轉(zhuǎn)印效果:Marker在電泳和轉(zhuǎn)印的過程中移動到膜上,可以幫助研究者驗證這些步驟的效果。通過檢查Marker的帶狀分布,可以確保電泳和轉(zhuǎn)印過程中沒有發(fā)生異常;

            確定蛋白質(zhì)遷移距離:通過測量Marker的遷移距離,可以估算待測蛋白質(zhì)的遷移距離。這對于進(jìn)一步的數(shù)據(jù)分析和結(jié)果解釋非常重要;

            標(biāo)定凝膠濃度:Marker還可以用于幫助研究者選擇適當(dāng)?shù)哪z濃度。不同分子量的Marker在不同的凝膠濃度下會產(chǎn)生不同的遷移模式,因此可以根據(jù)Marker的遷移特性選擇合適的凝膠濃度。

             

            3、Marker有哪些分類,各有什么特點?

             

            ● 天然蛋白Marker:

             

            這類Marker是從自然來源提取的蛋白質(zhì),它們經(jīng)歷了天然的修飾過程,如裂解、二硫鍵形成、糖基化或磷酸化,并保持其復(fù)雜的3D結(jié)構(gòu)。天然蛋白Marker更接近其在體內(nèi)的自然狀態(tài),這使得它們在藥物開發(fā)和生物醫(yī)學(xué)研究中非常有用。天然蛋白Marker可以提供更準(zhǔn)確的分子量估計,因為它們未經(jīng)過重組或合成,保持了蛋白質(zhì)的自然特性。abs9919非變性蛋白Marker (66-669kDa),經(jīng)過非變性電泳后,用考馬斯亮藍(lán)染色后可以得到分布均勻、密度相近的4條帶,不適用于SDS-Page,因為在SDS存在下,含有多個亞單位的蛋白會不同程度解聚。

             

            abs9919非變性蛋白Marker(66-669kDa)

             

            ● 變性Marker:

             

            這類Marker在生產(chǎn)過程中經(jīng)過了變性處理,通常是通過加熱和化學(xué)物質(zhì)(如SDS)的處理,以確保蛋白質(zhì)wan全展開成線性結(jié)構(gòu)。變性Marker的優(yōu)點在于它們提供了一致的蛋白質(zhì)遷移特性,這對于精確的分子量估計和實驗重復(fù)性非常重要。由于變性處理,這類Marker的蛋白質(zhì)保持一致的電荷和形狀,使得它們在電泳過程中的遷移更加可預(yù)測。

             

            變性蛋白Marker一般可分為預(yù)染和非預(yù)染兩種

             

            ● 未預(yù)染蛋白Marker:

             

            這類Marker包括寬分子量、高分子量和低分子量蛋白標(biāo)準(zhǔn)。它們是較簡單、較準(zhǔn)確的一種,因為不附帶染料分子或標(biāo)記分子,所以所示大小正好是蛋白原本的大小。缺點是在電泳過程中不可見,需要在電泳結(jié)束后經(jīng)過染色才能看到,無法實時監(jiān)控電泳過程。適合精確判斷蛋白大小,但操作相對麻煩,需要額外的染色步驟。如abs9840非預(yù)染蛋白Marker (14.4-97.4kDa),用考馬斯亮藍(lán)R-250染色可得分布均勻密度相同的六個條帶,產(chǎn)品含SDS, 不適合用于非變性膠。

             

            abs9840非預(yù)染蛋白Marker(14.4-97.4kDa)

             

            ● 預(yù)染蛋白Marker:

             

            這類Marker在生產(chǎn)時就結(jié)合了染料,因此在電泳過程中或轉(zhuǎn)膜時可以直接觀察到不同顏色的條帶。預(yù)染蛋白Marker方便實驗人員在電泳時、電泳后,以及轉(zhuǎn)膜后監(jiān)測電泳情況和估計遷移率。又分為單色預(yù)染和多色預(yù)染。單色預(yù)染Marker通常會利用其中某些條帶加倍濃度來提示其大小,而多色預(yù)染Marker用不同的顏色來區(qū)別,更易于辨認(rèn) 。需要注意的是,預(yù)染蛋白Marker與染料共價耦聯(lián),所以在不同的緩沖條件下電泳時遷移特性可能會發(fā)生某些變化,可能導(dǎo)致一些偏差,因此不太適合精確定位蛋白。

             

            abs923預(yù)染蛋白Marker(10-245kDa)

             

            ● 預(yù)染發(fā)光Western Marker

             

            傳統(tǒng)的Western Blot試驗需要使用預(yù)染蛋白Marker來跟蹤檢測陽性抗原信號和轉(zhuǎn)膜效率,但預(yù)染蛋白Marker無法在膠片上曝光,曝光信號需要根據(jù)膜上的預(yù)染蛋白Marker來判斷。absin新品abs90004 預(yù)染發(fā)光Western Marker由9種發(fā)光蛋白和9種預(yù)染蛋白組成;9中發(fā)光蛋白分別為23、30、36、44、50、62、90、120和160KDa,這些蛋白均可與抗體結(jié)合,因此能與抗原在同一張膜上曝出信號,陽性信號可以直接通過Western Marker的位置來判斷;9種預(yù)染蛋白分別為15、25、35、40、55、70、100、130和180KDa,其中70KDa為紅色,其他為藍(lán)色,轉(zhuǎn)膜完畢后在膜上肉眼可見。

            1)可與抗原同時檢測信號,使Western blot結(jié)果判斷更加簡便;

            2)發(fā)光marker沒有偶聯(lián)和標(biāo)記其他分子,分子量更加準(zhǔn)確;

            3)綜合發(fā)光marker和預(yù)染marker的優(yōu)勢,既能監(jiān)測轉(zhuǎn)膜又能與抗原同時檢測。

             

            HRP標(biāo)記的Goat anti mouse IgG二抗(一抗:mouse anti P38)ECL化學(xué)發(fā)光檢測

             

            多重?zé)晒鈾z測

             

            按照分子量又可以將marker分為高分子量、低分子量、寬分子量等。高分子量蛋白Marker是指那些用于檢測大分子量蛋白質(zhì)的標(biāo)記,通常包含的蛋白質(zhì)分子量范圍較高,它們提供的分子量范圍通常從幾十kDa到幾百kDa不等。低分子量蛋白Marker是指用于檢測小分子量蛋白質(zhì)的標(biāo)記,通常包含的蛋白質(zhì)分子量范圍較低,從幾kDa到幾十kDa的分子量范圍。寬分子量蛋白Marker是指覆蓋寬廣分子量范圍的標(biāo)記,通常包含從低到高多個分子量的蛋白質(zhì)。

             

            4、如何選擇marker?需要考慮什么因素?

             

            首先看實驗類型,非變性蛋白需要非變性蛋白marker,變性蛋白則需要變性marker,兩者不可以相互替換,然后看目的蛋白大小,選擇相應(yīng)的marker,在可選條件下,寬分子量蛋白marker,是不錯的選擇,另外看實驗要求,如果需要在電泳和轉(zhuǎn)印過程中檢測,需要選擇預(yù)染marker,如果需要精確的條帶分子量大小,則需要非預(yù)染marker做參考,可以同時使用預(yù)染marker和非預(yù)染marker,除了以上因素,還需要考慮marker的使用體系,absin常見marker信息如下:

             


            類型

            非變性蛋白marker

            非預(yù)染蛋白 Marker

            藍(lán)色預(yù)染蛋白 Marker

            多色預(yù)染蛋白Marker

            預(yù)染發(fā)光Western Marker

            貨號

            abs9919

            abs9840

            abs9511

            abs9859

            abs922

            abs923

            abs924

            abs90004

            分離量范圍

            66-669kDa

            14.4-97.4kDa

            3.3-31kDa

            14.4-97.4kDa

            10-180kDa

            10-245kDa(Tris-glycine-SDS)

            10-180kDa

            發(fā)光蛋白:23-160kDa

            預(yù)染蛋白:15-180kDa

            條帶數(shù)量

            4

            6

            5

            6

            10(10和17可能因為膠濃度原因跑不開)

            12

            10(10和17可能因為膠濃度原因跑不開)

            9

            條帶分子量

            66、238、440、669

            14.4、22、31、43、66.2、97.4

            3.3、6.5、14.4、20.1、31

            14.4、20.1、31、43、66.2、97.4

            10, 17, 25, 33, 43, 55,75, 95, 130,180

            11、17、20、25、35、48、63、75、100、135、180、135、180、245(Tris-glycine-SDS)

            10, 17, 25, 33, 43, 55,75, 95, 130,180

            發(fā)光蛋白: 23、30、36、44、50、62、90、120 、 160

            預(yù)染蛋白: 15、25、35、40、55、70、100、130 、 180

            顏色

            單色

            單色

            藍(lán)色

            藍(lán)色

            75紅色,25k綠色,其余藍(lán)色

            25綠色,75橙紅色,其余藍(lán)色

            72橙色,10綠色,其余藍(lán)色,10k條帶在15%以下膠濃度時深綠色

            預(yù)染蛋白70KDa為紅色,其他為藍(lán)色,

            推薦凝膠體系

            非變性電泳

            變性電泳

            Tricine SDS-PAGE

            Tris-Glycine,Bis-Tris,Tris-Acetate,藍(lán)色和綠色條帶表觀分子量無變化,橙色條帶和進(jìn)口一致

            Tris-Glycine,Bis-Tris,Tris-Acetate,藍(lán)色和綠色條帶表觀分子量無變化,橙色條帶和進(jìn)口一致

            Tris-Glycine
            Bis-Tris MOPS
            Bis-Tris MES

            Tris-Glycine,Bis-Tris,Tris-Acetate,藍(lán)色和綠色條帶表觀分子量無變化,橙色條帶和進(jìn)口一致

            Tris-Glycine,Bis-Tris等

            處理

            需要考馬斯亮藍(lán)染色,不能加熱

            需要考馬斯亮藍(lán)染色及上樣前沸水浴

            無需染色,勿加熱

            無需染色、無需加熱

            無需染色、直接使用,不要煮沸、稀釋和加入還原劑處理

            無需染色、無需加熱

            無需染色、直接使用,不要煮沸、稀釋和加入還原劑處理

            無需染色、直接使用,不要煮沸




             

            非變性蛋白電泳好物推薦


            貨號

            產(chǎn)品名稱

            規(guī)格

            abs9116

            免疫印跡及免疫沉淀用(WB/IP)裂解液

            100mL

            abs9360

            Tris-Glycine電泳緩沖液(10×)

            500mL

            abs9618

            Glass gel預(yù)制膠 Tris-Gly 15%, 10wells, 1.5mm

            10片/盒

            abs9954

            非變性非還原性蛋白上樣緩沖液(5×)

            1mL×5

            abs9919

            非變性蛋白 Marker(66-669kDa)

            200uL

            abs964

            考馬斯亮藍(lán)染色試劑盒(常規(guī)型)

            1kit




             

            WB好物推薦


             

            貨號

            產(chǎn)品名稱

            規(guī)格

            樣本處理

            abs9346

            細(xì)胞漿、細(xì)胞核及細(xì)胞膜蛋白抽提試劑盒

            50T

            abs9116

            免疫印跡及免疫沉淀用(WB/IP)裂解液

            100mL

            abs9162

            廣譜型磷酸酶抑制劑混合物(100×儲液)

            1mL

            abs9161

            廣譜型蛋白酶抑制劑混合物(不含EDTA,100×DMSO儲液)

            1mL

            蛋白定量

            abs9232

            BCA蛋白定量試劑盒

            500T

            配膠試劑盒,各類預(yù)制膠(參考前面表格)

            上樣與電泳

            abs953

            上樣緩沖液(2×)

            10mL

            abs951

            電泳液(10×)

            100mL

            abs923

            預(yù)染蛋白Marker(10-245kDa)

            500uL

            轉(zhuǎn)膜

            abs932

            PVDF膜(0.45μm)

            20張

            abs960

            NC膜(0.45μm)

            20張

            abs950

            電轉(zhuǎn)液(10×)

            100mL

            封閉

            abs9175

            脫脂奶粉

            500g

            abs9157

            牛血清白蛋白

            100g

            抗體稀釋與去除

            abs954

            WB專用一抗二抗稀釋液

            100mL

            abs967

            Western一抗二抗去除液(強(qiáng)堿性)

            500mL

            顯色與檢測

            abs920

            ECL化學(xué)發(fā)光檢測試劑盒

            25mL×2




             

             

            Absin產(chǎn)品線:

            爆款產(chǎn)品:試劑盒(mIHC、IHC、凋亡、ELISA、ChIP、Co-IP、TR-FRET、生化檢測、殘留檢測、多因子檢測);細(xì)胞培養(yǎng)(類器官試劑盒+基質(zhì)膠,胎牛血清+培養(yǎng)添加劑+細(xì)胞因子)、分化試劑盒;分子(mRNA合成服務(wù)+提取試劑盒);化合物大包裝;輔助試劑、耗材/儀器、定制服務(wù)(抗體/多肽/蛋白/標(biāo)記/檢測)...

            特色產(chǎn)品:雞胚提取物CEE、B27、N2、霍亂毒素B亞單位CTB、牛腦垂體提取物BPE、百日咳毒素PTX、重組人胰島素Insulin、人源低密度脂蛋白LDL...

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