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關(guān)于核酸檢測(cè),方法還是挺多的,比如常用的分光光度法,和熒光染料法。
一、分光光度法
此法不具有選擇性,無(wú)法區(qū)分DNA、RNA或蛋白質(zhì)。檢測(cè)數(shù)值J易受到其他污染物(如游離核苷酸、鹽和有機(jī)化合物)和堿基組成差異的影響。
二、熒光染料法
也是今天要重點(diǎn)介紹的,有哪些熒光染料,可以特異地與雙鏈DNA、單鏈DNA、RNA相結(jié)合,并在特定波長(zhǎng)光源的激發(fā)下,發(fā)出熒光,并且不會(huì)檢測(cè)到樣本中可能存在的其他雜質(zhì)分子,熒光強(qiáng)度與樣品中的靶分子濃度相對(duì)應(yīng)呢?
一起來(lái)看看吧:
首先,是 DNA和RNA定量試劑
Helixyte Green dsDNA定量試劑(17597)和StrandBrite Green RNA定量試劑(17611)分別對(duì)雙鏈DNA和單鏈RNA進(jìn)行了優(yōu)化。它們對(duì)核酸有很高的親和力,對(duì)結(jié)合核酸有J大的熒光增強(qiáng)作用,使得在幾分鐘內(nèi)直接檢測(cè)復(fù)雜溶液中微量核酸成為可能,而且一般不會(huì)受到其他生物分子的干擾。
小牛胸腺DNA中使用Helixyte 綠色和PicoGreen進(jìn)行DNA定量。由圖看出Helixyte 綠色和PicoGreen 具有幾乎相同的性能。
Helixyte Green是一種出色的核酸定量試劑,與dsDNA結(jié)合后可顯著增強(qiáng)熒光。其優(yōu)勢(shì)如下:
高靈敏度:Helixyte Green和StrandBrite Green的靈敏度比UV吸收率測(cè)定法高10,000倍
選擇性高:與紫外吸收的測(cè)量不同,這些檢測(cè)不受蛋白質(zhì),游離核苷酸或非常短的寡核苷酸的影響,從而使完整的寡核苷酸和核酸的定量在復(fù)雜混合物(例如血清或全血)中更加準(zhǔn)確。
操作簡(jiǎn)單:這些檢測(cè)方法非常簡(jiǎn)單,不需要分離步驟,因此非常適合自動(dòng)化,高通量篩選
檢范圍廣:對(duì)于Helixyte Green的檢測(cè),定量在四個(gè)數(shù)量級(jí)內(nèi)都是準(zhǔn)確的?;?span style="font-family: Calibri;">StrandBrite 的熒光檢測(cè)在三個(gè)數(shù)量級(jí)上都是準(zhǔn)確的。
1、dsDNA定量
Hoechst 33258,超級(jí)純,#AAT-17520
Hoechst染料是一類在顯微觀察中標(biāo)記DNA的熒光染料。因?yàn)檫@類熒光染料能標(biāo)記DNA,所以它們也經(jīng)常用于細(xì)胞核和線粒體的顯像觀察。這類染料中兩個(gè)相關(guān)的染料Hoechst 33258和Hoechst 33342經(jīng)常使用。這兩種染料都在紫外光下350nm處被激發(fā),都在461nm處大發(fā)射光附近發(fā)射藍(lán)/青色熒光。Hoechst染料可以用于活細(xì)胞或者固定化細(xì)胞,并且經(jīng)常用來(lái)代替其它核酸染料如DAPI。這兩種染料關(guān)鍵的不同點(diǎn)在于,與DAPI相比,Hoechst 33342加有乙基,這使它具有更強(qiáng)的親脂性,因此能更好的透過(guò)完整的細(xì)胞膜。在一些實(shí)驗(yàn)中,Hoechst 33258的滲透性明顯比Hoechst 33342要弱些。這些染料也可以用來(lái)檢測(cè)樣品中的DNA含量,通過(guò)繪制發(fā)射光強(qiáng)度與DNA含量的標(biāo)準(zhǔn)曲線。
2.RNA定量
StrandBrite 綠色RNA定量試劑,200X DMSO 溶液,#AAT-17610
檢測(cè)和定量小量RNA在各種分子生物學(xué)應(yīng)用中尤其重要,比如定量體外RNA轉(zhuǎn)錄及測(cè)量RNA濃度在準(zhǔn)備進(jìn)行Northern印記雜交,S1p核酸酶分析,RNA酶保護(hù)分析,cDNA文庫(kù)制備,逆轉(zhuǎn)錄PCR及DD-PCR。常用的是測(cè)定核酸濃度技術(shù),在260nm處測(cè)定吸光度。基于吸光度的方法主要的缺點(diǎn)是來(lái)自蛋白、游離核苷酸及其他紫外線吸收化合物的干擾。利用靈敏的帶熒光的核酸染色劑可減輕這種干擾狀況。StrandBrite RNA定量試劑是一種可在溶液中對(duì)RNA進(jìn)行定量檢測(cè)的超靈敏的熒光核酸染色劑。StrandBriteRNA定量試劑可檢測(cè)出濃度低至 5 ng/mL的RNA通過(guò)熒光酶標(biāo)儀或熒光光度計(jì)。
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