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            亞硫酸氫鹽測序試劑盒丨EpiNext 高敏感亞硫酸鹽測序試劑盒(illumina)

            時間:2024/7/16閱讀:122
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            DNA甲基化是通過在胞嘧啶環(huán)的5-碳上共價添加一個甲基基團(CH3),從而形成5-甲基胞嘧啶(5-mC)。DNA甲基化在調(diào)節(jié)幾乎所有生物過程中的基因表達中起著至關(guān)重要的作用,包括發(fā)育、生長和分化。DNA甲基化的改變已被證明會導(dǎo)致基因表達的變化。例如,高甲基化會導(dǎo)致基因沉默或基因表達降低,而低甲基化則激活基因或增加基因表達。異常的DNA甲基化也與疾病的病因有關(guān),如癌癥、自身免疫性疾病和精神分裂癥。因此,全基因組DNA甲基化分析可以提供有價值的信息,用于發(fā)現(xiàn)用于疾病診斷的表觀遺傳標記,以及用于治療的潛在靶點。

             

            目前,全基因組亞硫酸鹽測序(WGBS)或簡化代表性亞硫酸鹽測序(RRBS)等幾種方法用于全基因組DNA甲基化分析。這些方法將未甲基化的胞嘧啶轉(zhuǎn)化為尿嘧啶,而5-mC在亞硫酸鹽處理中保持不變。這允許將表觀遺傳差異解釋為遺傳差異,然后可以通過單堿基分辨率和全基因組范圍內(nèi)的測序來檢測。然而,實現(xiàn)這一點的傳統(tǒng)方法仍然沒有實際應(yīng)用,因為(1)這些方法需要大量的DNA>1微克)作為輸入材料,這在從有限的生物樣本(如腫瘤活檢樣本、早期胚胎、胚胎組織和循環(huán)DNA)中制備是困難的;(2)這些方法要求DNA首先被剪切,然后與適配器連接,接著進行亞硫酸鹽轉(zhuǎn)化(連接后亞硫酸鹽轉(zhuǎn)化)。這個過程導(dǎo)致大多數(shù)包含在適配器-DNA片段構(gòu)建中的DNA片段斷裂,從而形成單標簽?zāi)0澹谖膸旄患袑⒈灰瞥?。因此,在進行全基因組亞硫酸鹽測序時會出現(xiàn)不w全覆蓋和偏差;以及(3)這些方法耗時(2天)。為了克服這些方法的弱點,EpigenTek提供了EpiNext™高靈敏度亞硫酸鹽測序試劑盒(Illumina#P-1056A

             

            艾美捷亞硫酸氫鹽測序試劑盒特點:

            創(chuàng)新方法:允許同時進行亞硫酸鹽轉(zhuǎn)化和適當大小的DNA片段化。亞硫酸鹽處理后的DNA可以直接連接到適配器,從而消除了通常在使用全基因組亞硫酸鹽測序(WGBS)和簡化代表性亞硫酸鹽測序(RRBS)方法時發(fā)生的適配器連接片段斷裂的可能性。

            快速且流程簡化的程序:從DNA亞硫酸鹽處理到準備好的文庫DNA,整個過程可以在6小時30分鐘內(nèi)完成。

            w轉(zhuǎn)化:將未甲基化的胞嘧啶w全轉(zhuǎn)化為尿嘧啶(>99%),同時對甲基胞嘧啶到胸腺嘧啶的不當或錯誤轉(zhuǎn)化忽略不計。

            高靈敏度和高效率:創(chuàng)新的亞硫酸鹽DNA適配器連接消除了片段丟失和選擇偏差,使得輸入DNA可以低至0.2納克,非常適合對珍貴且有限的樣本進行甲基化分析。該試劑盒可用于非條形碼(單重)和條形碼(多重)DNA文庫的準備。

            極其方便:試劑盒包含DNA文庫準備每個步驟所需的所有組分,足夠進行亞硫酸鹽轉(zhuǎn)化、連接、清潔、大小選擇和文庫擴增,從而使亞硫酸鹽DNA文庫準備流程化,以獲得可靠和一致的結(jié)果。

            最小偏差:超高頻(Ultra HiFi)擴增能夠以最小的序列偏差和低錯誤率獲得可重復(fù)的高產(chǎn)量DNA文庫。

            廣泛的樣本適用性:起始材料可以是來自各種組織/細胞樣本的基因組DNA,如新鮮和冷凍組織、培養(yǎng)瓶或微孔板中的培養(yǎng)細胞、顯微切割樣本、石蠟包埋組織、活檢、胚胎細胞、血漿/血清樣本以及體液樣本等。來自各種富集反應(yīng)的DNA,如ChIPMeDIP/hMeDIP或外顯子捕獲,也可以作為起始材料。

             

            亞硫酸氫鹽測序試劑盒檢測原理:

            該試劑盒包含了直接使用微量輸入DNA生成的亞硫酸鹽DNA成功制備文庫所需的所有試劑。在這種制備過程中,DNA在亞硫酸鹽處理的同時被轉(zhuǎn)化為適當長度的片段。經(jīng)過亞硫酸鹽處理的DNA,以單鏈形式存在,隨后同時轉(zhuǎn)化為雙鏈DNA并連接適配器。連接后的片段使用MQ結(jié)合珠進行大小選擇和純化,然后使用高保真度PCR混合液進行擴增,這確保了從最小量的起始材料中獲得最大產(chǎn)量,并以低錯誤率和最小偏差提供了文庫DNA的高度精確擴增。

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