賽默飛離子阱質(zhì)譜是利用高電場使質(zhì)譜進(jìn)樣端的毛細(xì)管柱流出的液滴帶電，在氮?dú)鈿饬鞯淖饔孟拢旱稳軇┱舭l(fā)，表面積縮小，表面電荷密度不斷增加，直至產(chǎn)生的庫侖力與液滴表面張力達(dá)到雷利極限，液滴爆裂為帶電的子液滴，這一過程不斷重復(fù)使終的液滴非常細(xì)小呈噴霧狀，這時(shí)液滴表面的電場非常強(qiáng)大，使分析物離子化并以帶單電荷或多電荷的離子形式進(jìn)入質(zhì)量分析器。賽默飛離子阱質(zhì)譜從液相中產(chǎn)生離子，一般說來，肽段的混合物經(jīng)過液相色譜分離后，經(jīng)過偶聯(lián)的與在線連接的離子阱質(zhì)譜分析，給出肽片段的的氨基酸序列,但是分析時(shí)間一般較長。
賽默飛離子阱質(zhì)譜在蛋白質(zhì)組學(xué)和小分子應(yīng)用上奠定了新的里程碑。在得到充分證明的高性能平臺(tái)上，運(yùn)用新的離子阱技術(shù)，極大地提高了速度、分辨率、MS/MS效率和定量分析的重復(fù)性，從而達(dá)到的高性能。
1、極短的MS/MS循環(huán)時(shí)間，zui大的信息量。
2、全新的SMART離子隔離和碎裂技術(shù)。
3、ETD性能：靈敏度高、耐性好、可靠性強(qiáng)。
4、雙離子漏斗技術(shù)提高的靈敏度。
5、當(dāng)今世上分辨率zui高的離子阱質(zhì)譜儀，在全掃描模式下，分辨率高達(dá)30, 000。
6、賽默飛的RF發(fā)生器確保zui高的質(zhì)量精度。
7、高達(dá)20 Hz數(shù)據(jù)采集速度，并且實(shí)現(xiàn)“零時(shí)間延遲”正負(fù)模式切換。
賽默飛離子阱質(zhì)譜滿足蛋白質(zhì)組學(xué)研究的速度：
1、自下而上(Bottom-up)方法，鑒定到更多的低豐度蛋白質(zhì)。
2、杰出的ETD/PTR技術(shù)，的翻譯后修飾分析。
3、自上而下測序 (Top-Down sequencing; TDS)，zui高序列覆蓋率。
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