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兩種花青衍生物Cy3和Cy5亞磷酰胺是用于制備熒光標記的寡核苷酸的熒光標記試劑。 通常在5'末端添加一次花青染料，并且應在合成儀上除去MMT組。 MMT陽離子（黃色）的吸光度與DMT陽離子（橙色）明顯不同，因此三苯甲基吸光度可用于監(jiān)測寡核苷酸偶聯。 花青染料亞磷酰胺也已成功地鄰近3'末端使用。 含有花青染料的寡聚物的脫保護可以在室溫下用氫氧化銨進行，而不管所用單體上的堿保護基團如何。 如果在升高的溫度下使用氫氧化銨，則Cy3和Cy3.5比Cy5和Cy5.5更穩(wěn)定。 使用具有堿不穩(wěn)定保護基團的單體以在脫保護期間將暴露時間限制在65℃下2小時或更短時間。

英文名稱：Cy3-Phosphoramidite

Cyanine3-Phosphoramidite

中文名稱：Cy3亞磷酰胺

CAS：182873-76-3

分子式：C58H70ClN4O4P

分子量： 953.65

保存方法： -20°C in the dark

結構式：

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