液相色譜法：適于溶解后可制成溶液的樣品或有機介質(zhì)溶液，不受樣品的揮發(fā)性和熱穩(wěn)定性的限制，百分之七十以上的有機化合物可用液相色譜分析，特別是高沸點、大分子、揮發(fā)性差、強極性、熱穩(wěn)定性差化合物的分離分析，顯示出優(yōu)勢。

    氣相色譜法：適應易于汽化、熱穩(wěn)定性好、且沸點比較低的樣品分析。但不適應于對高沸點、揮發(fā)性差、熱穩(wěn)定性差、離子型及高聚物的樣品分析；色譜法的缺點主要是難以對未知物分析定性，如果沒有已知的純樣品或已知純樣品的色譜圖，就很難判斷某一色譜峰究竟代表何物。

    氣相色譜儀所能直接分離的樣品是可揮發(fā)、且熱穩(wěn)定的，沸點一般不超過500℃。據(jù)有關(guān)資料統(tǒng)計，在目前已知的化合物中，有20%～25%可用氣相色譜儀直接分析，其余原則上均可用液相色譜儀分析。也就是說氣相色譜儀的分析對象遠沒有液相色譜儀多。需要指出的是，有些雖然不能用氣相色譜法直接分析的樣品，通過特殊的進樣技術(shù)，如頂空進樣和裂解進樣，也可用氣相色譜法間接分析。比如高分子材料的裂解色譜就是如此。這在一定程度上擴大了氣相色譜法分析對象的范圍。此外，氣相色譜法比液相色譜更適合于*氣體的分析。

    氣相色譜法具有分離能力好，靈敏度高，分析速度快，操作方便等優(yōu)點，但是受技術(shù)條件的限制，沸點太高的物質(zhì)或熱穩(wěn)定性差的物質(zhì)都難于應用氣相色譜法進行分析。一般對500℃以下不易揮發(fā)或受熱易分解的物質(zhì)部分可采用衍生化法或裂解法。液相色譜法，只要求試樣能制成溶液，而不需要氣化，因此不受試樣揮發(fā)性的限制。對于高沸點、熱穩(wěn)定性差、相對分子量大(大于 400 以上)的有機物( 些物質(zhì)幾乎占有機物總數(shù)的 75% ～ 80% )原則上都可應用液相色譜法來進行分離、分析。 據(jù)統(tǒng)計，在已知化合物中，能用氣相色譜分析的約占20%，而能用液相色譜分析的約占70～80%。

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