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            RPA等溫擴增技術特征及與PCR優(yōu)勢是什么

            時間:2023/10/31閱讀:1211
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            RPA(recombinase polymerase amplification)即重組酶聚合酶擴增技術,在ATP存在條件下,重組酶與引物結合, 形成蛋白-核酸聚合體,并搜索配對目標;當引物尋找到配對DNA模板,ATP水解供應能量,重組酶離開引物,并在DNA聚合酶的作用下合成新DNA鏈;同時,單鏈DNA結合蛋白( SSB)同被置換出來的DNA單鏈進行結合,防止DNA模板再次形成雙鏈。RPA實驗能在恒定溫度下進行全程實驗,沒有復雜的操作,對儀器及人員的要求不高,適合基層或現(xiàn)場快速診斷。


            相關產(chǎn)品:

            HP80201 基礎型RAA核酸擴增試劑(凍干顆粒)

            HP80202 熒光型RAA 核酸擴增試劑(凍干顆粒)

            HP80203 基礎型RT-RAA核酸擴增試劑(凍干顆粒)

            HP80204 熒光型RT-RAA核酸擴增試劑(凍干顆粒)

            HP80205 試紙條型RAA核酸擴增試劑(凍干顆粒)

            HP80206 試紙條型RT-RAA核酸擴增試劑(凍干顆粒)


            RPA等溫擴增原理

            1. 復合物A能夠在單鏈上尋找同源序列,并連接成環(huán)狀分子。

            2. 單股DNA結合蛋白可以與單鏈DNA結合,防止其二級結構形成,并引導聚合酶與模板結合。

            3. DNA聚合酶負責在模板上合成新鏈DNA。

            RPA的優(yōu)勢在于其等溫反應、快速擴增和魯棒性,這使其非常適合POCT檢測。


            RPA具有以下主要特征

            1. 等溫反應

            RPA反應在常溫(37-42°C)下進行,不需要熱循環(huán)設備,這使其可以應用于簡易的POC診斷裝置中。

            2. 快速反應

            RPA反應只需要20-40分鐘,比PCR快幾倍,這可實現(xiàn)病原體 DNA的快速檢測。

            3. 強大的擴增效率

            RPA可以從少量模板DNA復制出109-1011個拷貝,擴增效率高達90%。

            4. 高度特異性

            RPA使用三個核酸酶(活動的復合體A、單股DNA結合蛋白及DNA聚合酶)實現(xiàn)序列特異性擴增,可檢出少至幾個拷貝的目標DNA。

            5. 魯棒性

            RPA可以在各種樣本中直接擴增(不需DNA精制),對PCR的常見阻礙因素如血清、肉湯等也具有很好的耐受性。

            6. 靈活性

            RPA可直接從各種原始樣本中擴增DNA,也可以與其他技術如磁珠分離等結合,實現(xiàn)樣本的預處理。


            RPA與PCR相比具有以下主要優(yōu)勢

            1. 等溫反應

            RPA在常溫下進行,而PCR需要進行多輪的溫度變化循環(huán),需要PCR儀等設備。RPA的等溫反應更簡單,不需要昂貴設備,這有利于POC檢測的應用。

            2. 速度更快

            RPA反應只需20-40分鐘,而PCR通常需要2-3小時。RPA可以實現(xiàn)病原DNA的快速檢測,適用于臨床急癥檢測。

            3. 更高擴增效率

            RPA可以得到109-1011拷貝的擴增產(chǎn)物,擴增效率高達90%,而PCR的擴增效率一般在80-90%之間。

            4. 魯棒性更強

            RPA可以直接從各種原始樣本擴增,而PCR更加敏感,常需進行DNA精制或分離。RPA對PCR的常見干擾因子也更具耐受性。

            5. 不產(chǎn)生二級片段

            RPA擴增產(chǎn)物為單一片段,而PCR可能產(chǎn)生二級擴增片段,影響結果的準確性。


            RPA也存在一定局限

            1. 目前報道較少:與PCR相比,RPA的研究報道和應用案例還比較少,相關技術和產(chǎn)品也較不成熟,有待進一步推廣。

            2. 專一性較差:RPA的擴增效率高,但其對非靶DNA的擴增也較PCR更明顯,這會產(chǎn)生更高的假陽性信號,影響檢測精度。

            3. 擴增片段較長:RPA獲得的擴增片段一般在100-1500bp之間,較PCR獲得的產(chǎn)物長,不利于某些下游檢測。

            4. 定量性較弱:與實時熒光PCR相比,RPA的定量能力較差,不利于獲得準確的DNA定量結果。

            RPA相比PCR,由于其等溫、快速、高效和魯棒等優(yōu)勢,更適用于簡易POCT檢測的應用。但其專一性較差、擴增片段較長和定量性較弱等也是不容忽視的局限因素。

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