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NuSmart^®在FFPE（福爾馬林固定石蠟包埋）鑒定中應(yīng)用

——無需脫蠟、一片即結(jié)果

 

FFPE是"福爾馬林固定、石蠟包埋"(Formalin-Fixed and Paraffin-Embedded)的縮寫，是一種常見的組織樣本保存方法。在醫(yī)學研究和臨床診斷中，F(xiàn)FPE可用于組織學檢查、病理診斷和分子分析。而FFPE在分子分析中的應(yīng)用主要包括：

1、癌癥研究：FFPE樣本常用于癌癥基因組學研究，包括突變分析、拷貝數(shù)變異檢測等。

2、基因表達分析：FFPE樣本中的RNA可用于基因表達分析，了解疾病相關(guān)基因的表達模式。

3、DNA甲基化分析：FFPE樣本可用于研究DNA甲基化狀態(tài)，探索與疾病相關(guān)的表觀遺傳學改變。

4、miRNA分析：FFPE樣本中的miRNA可用于研究其在疾病發(fā)生發(fā)展中的作用。

5、生物銀行和歷史樣本研究：利用存儲的歷史FFPE樣本進行生物標志物的發(fā)現(xiàn)和驗證研究。

愿望是美好的，現(xiàn)實是提取FFPE中DNA存在很多“痛處"，例如

1、DNA損傷和化學修飾：福爾馬林固定導致DNA發(fā)生化學修飾，如堿基脫嘌呤、鏈間交聯(lián)等。

2、DNA片段化：FFPE樣本中的DNA通常已部分降解，形成較小的片段，這可能影響某些需要較長DNA片段的實驗。

3、DNA與蛋白質(zhì)的交聯(lián)：DNA可能與組蛋白等蛋白質(zhì)緊密交聯(lián)，增加了提取和純化的難度。

4、樣品質(zhì)量控制：組織脫水、固定延遲或時間過長等因素都會損害標本質(zhì)量。

5、DNA提取效率：目前市場的FFPE提取試劑盒性能差異很大，提取時間和提取效率都有很大不同。

6、PCR抑制劑：FFPE樣本中可能存在PCR抑制劑，影響后續(xù)的PCR擴增反應(yīng)。

NuSmart^®技術(shù)wan美解決以上痛點，NuSmart^®FFPE樣本PCR試劑盒提供了FFPE Buffer用于將切片中組織DNA釋放出來，高耐受力的2× FFPE Smart Mix能夠抑制常見干擾劑?？偨Y(jié)來看有以下特點：

—1-2片切片就有結(jié)果

—操作簡單，無需脫蠟

—操作便捷，僅需要10分鐘

—僅需要加熱處理

—無需配備昂貴設(shè)備

 

操作流程

 

 

 

案例 不同組織切片擴增8對引物

 

1、肝 2、肺 3、胃

 

使用NuSmart^®FFPE樣本PCR試劑盒（貨號Nu-FFPE0101）處理肝、肺、胃三組切片，使用2× FFPE Smart Mix擴8對引物。