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            深圳市安培生物科技有限公司
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            提高實驗和質量的實用技巧

            時間:2024/3/20閱讀:904
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            1.提高實驗的效率

            1)實驗前有計劃安排、預備方案或者“車輪戰(zhàn)"(細胞實驗)

            一般從基礎的培養(yǎng)細胞開始,開始實驗時,實驗方法一般來自于實驗室或者文獻中條件優(yōu)化以及自我推測及驗證,因此做實驗之前預想實驗方案有助于我們不至于“手忙腳亂"。


            以實驗前的細胞鋪板實驗為例:

            表1 常用細胞培養(yǎng)體系:

            圖片

            細胞鋪板的孔數(shù)一般取決于我們后期實驗的目的,實驗前了解各類細胞的鋪板數(shù)量以及培養(yǎng)基添加量都十分重要。以病毒或者細菌感染細胞模型來說,我們需要一個比較準確數(shù)量級的細胞數(shù)目和病毒或菌液濃度得后期實驗的MOI值,細胞計數(shù)和病毒及菌液濃度測定也很關鍵;


            細胞鋪板:我們需要收集盡可能多的細胞,原因是當我們剩余出來的細胞可用于細胞傳代繼續(xù)保留,可若是鋪板數(shù)目達不到(重新離心收集細胞浪費時間)可能會導致加藥濃度過大使得細胞大量死亡而影響后期實驗,比如你要提取RNA或者蛋白,細胞數(shù)目不足,后期的RNA濃度或者BCA測蛋白濃度的結果都不是非常理想繼而影響后面實驗的進展。


            2)具體安排(Western blot實驗)

            從試驗干擾開始(給藥處理),根據(jù)實驗步驟來講,完整的Western blot實驗預計2-3天。

            (1)以給藥時間24h為例:24h后,收集細胞提取蛋白,貼壁細胞加IP裂解液或RIPA裂解液用細胞刮板移至1.5ml離心管;懸浮細胞收集細胞至離心管離心去除培養(yǎng)基,用PBS清洗離心去除上清再加入裂解液,預計提取蛋白以及BCA測蛋白濃度一上午的時間,估計上樣體積加入loading buffer煮蛋白置于-80℃保存;下午跑蛋白電泳,SDS-PAGE膠可于前一天晚上制好防止-4℃冰箱保存(用少量純水用封裝袋保存)或使用預制膠,大概1多小時蛋白maker跑到距離膠最下面1-2cm處停止電泳;轉模,根據(jù)目的蛋白的大小確定轉膜時間和毫安數(shù),結束后裁膜用5%脫脂奶粉封閉,之后孵育一抗4℃過夜,第二天洗膜孵育二抗并進行顯影,因此步驟時間熟練的話2天就可以完成一次WB實驗。


            (2)預備方案:實驗重復是不可避免的,因此預備下一周期實驗方案(車輪戰(zhàn))有助于縮短時間提高效率,當然,師兄師姐以及廣大學術里的經驗小tips也有助于提高實驗效率。例如,在WB配制SDS-PAGE膠的凝固時間通常會隨季節(jié)溫度的變化而改變,夏季和冬季應該時間就會產生差異(冬季凝固較慢),再者,AP 和TEMED 作為促凝劑,一般都是最后加入,尤其是AP(過硫酸銨)。實驗之前我們可能都會設計一個預期結果,我們可以在上一周期實驗的空余時間預備下一周所需要的實驗條件,例如重新細胞鋪板給藥等待時間周期等等。


            2.提高實驗結果的質量:減小系統(tǒng)誤差,消除人為錯誤

            ①減小系統(tǒng)誤差:一般設計3個重復孔,但是后期我統(tǒng)計數(shù)據(jù)時發(fā)現(xiàn),誤差bar仍可能較長,這時我們可以設計4個復孔,去除一個誤差最大的值也有助于結果的準確性。這時就要求我們會更加精準的使用移液槍。另外,重復實驗也有助于提高我們加樣的準確性。


            ②制備預混液:例如我要做30(2×5×3)孔兩個基因(包含內參),5個處理,3個復孔,那么我的熒光染料一個孔需要5ul,正反引物2ul,那么我們可以再不浪費試劑的情況下,計算量可為:15.5×5+15.5×2或者(15×5+15×2)×1.1,這一定程度上都是為了消除我們人為加樣誤差。

            圖片


            ③另外我們盡量增大加樣體積減少誤差:針對于10ul體系,提前將正反引物混合,配制SYBY+正反引物和cDNA+ddH2O,這時的體積為6+4或者7+3可減少加樣體積小帶來的加樣誤差。


            ④相關試劑使用前需離心使用:另外,在八聯(lián)管上機前需要用干凈的手套蓋上透明蓋子,適當離心將反應體系離心至管底。


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