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            2015年度9大改變世界的革命性技術(shù)

            閱讀:556          發(fā)布時間:2014-12-17

            基因編輯更快更準(zhǔn)更簡單

            1973年,斯坦利·N·科恩(Stanley N. Cohen)和赫伯特·W·博耶(Herbert W. Boyer)找到了改變生物體基因組的方法,成功將蛙的DNA插入到細菌中。20世紀(jì)70年代末,博耶的基因泰克(Genetech)公司對大腸桿菌進行基因改造,使其帶有一個人源基因(這個基因是人工合成的),zui后生產(chǎn)出治療糖尿病的胰島素。很快,加利福尼亞州拉霍亞的索爾克生物研究所(Salk Institute for Biological Studies)的科學(xué)家培育出了*只轉(zhuǎn)基因小鼠。

            20世紀(jì)70年代,科學(xué)家就找到了改變生物體基因組的方法,但這些方法不甚,并且難以用于量產(chǎn)。因此,很多基因修飾實驗依然既困難又昂貴。

            現(xiàn)在,一種名叫CRISPR的新技術(shù),也許將*革新基因組編輯。這一技術(shù)源自細菌的免疫防御系統(tǒng),比傳統(tǒng)方法更快速、更便宜、更簡單。商業(yè)化的CRISPR技術(shù)公司己經(jīng)吸引到了大量資金。

            研究人員已經(jīng)開始探索,如何將CRISPR技術(shù)應(yīng)用于艾滋病、精神分裂癥等多種疾病的治療。然而,因為CRISPR能非常輕易地改變植物、昆蟲和人類的基因組,倫理學(xué)家擔(dān)心這會引發(fā)一些負面后果。

            基因工程領(lǐng)域取得的這些巨大成就改變了現(xiàn)代醫(yī)學(xué)的進程。但是,早期的基因改造方法有兩大局限:不甚,并且難以量產(chǎn)。那時,DNA插入基因組的行為是隨機的,科學(xué)家只能祈求好運,但愿自己能得到一個有用的突變。1990年,研究人員取得了跨越式的進步。他們設(shè)計出能在特定位點對DNA進行剪切的蛋白,突破了*個局限。但是,每想要修改一段DNA序列,他們都必須設(shè)計一個新的蛋白,這種工作非常耗時,并且十分艱苦。

            時間終于到了2012年。瑞典于默奧大學(xué)(Ume? University)的埃馬紐埃爾·卡彭蒂耶(Emmanuelle Charpentier)和加利福尼亞大學(xué)伯克利分校的珍妮弗·杜德娜(Jennifer Doudna)領(lǐng)導(dǎo)的研究人員報道,他們在細胞中發(fā)現(xiàn)了一種遺傳機制,能讓科學(xué)家以的速度編輯基因組,并且過程十分簡單。此后不久,哈佛大學(xué)和麻省理工大學(xué)的一個課題組運用這種技術(shù),一次性地對細胞基因組的多個位點進行了修改。

            這種先進的技術(shù)已經(jīng)加快了基因工程產(chǎn)業(yè)的發(fā)展,對遺傳學(xué)和醫(yī)學(xué)也有深遠的推動作用??茖W(xué)家現(xiàn)在只要幾周時間,就能按需定制出經(jīng)過基因改造的實驗動物,省去了從前一年的工作量與時間。目前,研究人員正在運用該技術(shù),探索艾滋病、阿爾茨海默病、精神分裂癥等疾病的治療方法。該技術(shù)將生物體的基因修飾過程變得相當(dāng)簡單與廉價,研究人員和倫理學(xué)家甚至開始擔(dān)心,這會催生負面效應(yīng)。

            這種技術(shù)名叫CRISPR,是“clustered, regularly interspaced, short palindromic repeats”(即成簇、規(guī)律間隔的短回文重復(fù)序列)的縮寫。利用這種序列,細菌可以對侵襲過它的病毒產(chǎn)生“記憶”。自從日本科學(xué)家20世紀(jì)80年代末發(fā)現(xiàn)CRISPR之后,科學(xué)家就一直在研究這種奇怪的基因序列。然而,直到杜德娜和卡彭蒂耶偶然注意到一種名叫Cas9的蛋白,CRISPR才顯示出它作為基因組編輯工具的巨大潛力。

            2011年,杜德娜和卡彭蒂耶在波多黎各圣胡安的一次科學(xué)會議上相識。他們有很多共同點:他們的團隊都在研究細菌防御病毒入侵的機制;他們都已經(jīng)確認,細菌可以記住以前入侵過自己的病毒的DNA,以此來識別病毒,當(dāng)該病毒再次入侵時,它們就會立刻認出“敵人”。

            那次會議后不久,卡彭蒂耶和杜德娜決定合作。當(dāng)時,卡彭蒂耶在于默奧大學(xué)的實驗室剛剛發(fā)現(xiàn),鏈球菌似乎會用Cas9蛋白來“搗碎”突破其細胞壁的病毒。于是,杜德娜在伯克利的實驗室,也開始探究Cas9蛋白的作用機理。

            很多科學(xué)發(fā)現(xiàn)的背后都有一連串巧事,CRISPR的故事也不例外??ㄅ淼僖畬嶒炇业目巳帐餐蟹?middot;黑林斯基(Krzysztof Chylinski)和杜德娜實驗室的馬丁·伊內(nèi)克(Martin Jinek)在毗鄰的城鎮(zhèn)長大,說著同樣的波蘭方言。杜德娜說:“他們開始通過Skype聊天。兩人一拍即合,然后就開始分享數(shù)據(jù)、討論做實驗的想法。這個項目就這樣正式開始了。”

            兩個實驗室的科學(xué)家都意識到,他們或許可以用Cas9蛋白來進行基因組編輯?;蚪M編輯是基因工程中的一種方法,酶是這一過程中的“分子剪刀”,可以剪切DNA。這種酶名叫核酸酶(nuclease),能在特定的位點切斷雙鏈DNA。DNA斷裂后,細胞會對斷裂位點進行修復(fù)。有時,細胞中一些人為導(dǎo)入的基因片段,會在修復(fù)的過程中插入這些位點。杜德娜和卡彭蒂耶剛開始合作的時候,科學(xué)家如果想改變或關(guān)閉一個基因,的方法,是定制一種能找到特定DNA位點并對其進行切割的酶。換句話說,每修飾一次基因,科學(xué)家都不得不設(shè)計一種新的蛋白,專門針對想要修飾的DNA序列。

            但杜德娜和卡彭蒂耶意識到,Cas9蛋白——這種鏈球菌用于免疫防衛(wèi)的酶,會用RNA來引導(dǎo)自己找到目標(biāo)DNA。為了探測作用位點,Cas9-RNA復(fù)合物會在DNA上不停“彈跳”,直到找到正確的位點。這一過程看似隨機,其實不然。Cas9蛋白的每次彈跳,都是在搜索同一段短小的“信號”序列。Cas9會附著到DNA上,檢測鄰近的序列是否和充當(dāng)向?qū)У腞NA匹配。這種RNA叫做向?qū)NA(guide RNA,簡稱gRNA),而只有當(dāng)gRNA和DNA匹配時,Cas9蛋白才會對DNA進行切割。如果能將這套天然的RNA向?qū)到y(tǒng)利用起來,研究人員在切割DNA位點時,就不用每次都構(gòu)建一種新的酶了?;蚪M編輯可能會因此變得更簡單、更便宜,也更有效。

            這個橫跨大西洋的團隊一起對Cas9蛋白進行了幾個月的研究,并且取得了突破。杜德娜還能清楚地記起那個時刻。他們的實驗室坐落在伯克利校園邊緣一個綠樹成蔭的山坡上,對面就是希臘劇院,彼時還在做博士后研究的伊內(nèi)克一直那里在對Cas9蛋白進行實驗。一天,他來杜德娜的辦公室討論實驗結(jié)果。面對伊內(nèi)克和黑林斯基一直在討論的一個問題,他們陷入了沉思:在自然界中——也就是在鏈球菌體內(nèi),Cas9蛋白倚靠的不是一個,而是兩個RNA,來引導(dǎo)自己尋找DNA上的正確位點。

            如果在保留其向?qū)Чδ艿那疤嵯?,將兩條gRNA整合成一條RNA鏈,結(jié)果會怎么樣呢?如果只需修飾一個RNA序列,研究人員的工作速度將會得到極大的提升。gRNA序列與目標(biāo)DNA序列之間存在精妙的互補關(guān)系,利用這種關(guān)系構(gòu)建一條gRNA,比定制一個核酸酶更容易。

            “看著這些數(shù)據(jù),我們突然就開竅了——這種事情經(jīng)常發(fā)生,”杜德娜說道,“我們意識到,其實可以將這些RNA分子設(shè)計成一條gRNA。一套由一個蛋白質(zhì)和一條gRNA組成的系統(tǒng),就足以成為一個強大的基因修飾工具。我打了個寒顫,心想,‘天哪,我要趕快跑到實驗室去,如果這能成功的話……’”

            他們真的成功了。結(jié)果超出了杜德娜的設(shè)想(盡管她本來就抱有很高的期待)。2012年8月17日,當(dāng)杜德娜和卡彭蒂耶將他們對CRISPR-Cas9的研究成果公諸于眾時,該領(lǐng)域的科學(xué)家立刻認識到這一技術(shù)的變革性力量,他們都想知道CRISPR-Cas9究竟能做什么,一場性競賽由此拉開序幕。

            CRISPR是怎樣工作的?CRISPR 是細菌的“武器”,它能“搗碎”入侵細菌的病毒的DNA??茖W(xué)家可以利用這套工具,改變他們想要修飾的DNA序列。和從前的基因組編輯方法不同,CRISPR 系統(tǒng)采用一個通用酶——Cas9 來執(zhí)行剪切。研究人員需要做的一切,就是制造一個gRNA來引導(dǎo)Cas9,而合成一條RNA,遠比合成一個酶更加容易。

            2013年之前,研究人員一直在嘗試將CRISPR-Cas9應(yīng)用于植物和動物細胞——它們比細菌要復(fù)雜得多。在他們看來,這和復(fù)活尼安德特人與猛犸象一樣激動人心。在哈佛大學(xué),遺傳學(xué)家喬治·丘奇(George Church)領(lǐng)導(dǎo)的團隊用CRISPR技術(shù)來改變?nèi)祟惢颍瑸榧膊〉闹委熖峁┝硕喾N可能性。

            CRISPR-Cas9很快成為了投資的熱點。一年多以前,杜德娜聯(lián)手丘奇、麻省理工學(xué)院的張峰和其他研究人員,共同成立了愛迪塔斯醫(yī)藥公司(Editas Medicine),他們獲得了4300萬美元的風(fēng)險投資,用以開發(fā)一類新的、基于CRISPR的藥物(該公司還沒有透露他們首先瞄準(zhǔn)的是哪類疾病)。2014年4月,獲得2500萬美元投資的CRISPR醫(yī)療公司(CRISPR Therapeutics)在瑞士巴塞爾和英國倫敦成立,他們的目標(biāo)也是開發(fā)基于CRISPR的疾病療法。愛迪塔斯醫(yī)藥公司和CRISPR醫(yī)療公司都需要多年時間,才能開發(fā)出相應(yīng)的療法,然而,實驗室的供貨商們已經(jīng)在向世界各地的客戶銷售可以立即用于動物注射的CRISPR材料,并開始為客戶定制經(jīng)CRISPR改造的小鼠、大鼠和兔子。

            今年,我在一個潮濕的夏日拜訪了位于圣路易斯的SAGE實驗室(SAGE Labs),它是*批獲準(zhǔn)使用杜德娜的CRISPR技術(shù)來改造嚙齒類動物的公司之一。在那里,我能親眼見識CRISPR是如何起作用的。SAGE實驗室向大約20家*制藥公司,以及眾多高校、研究所和基金會供應(yīng)實驗材料。英國劍橋的生物技術(shù)公司地平線發(fā)現(xiàn)集團(Horizon Discovery Group)早前也已獨立涉足CRISPR產(chǎn)品的研發(fā);2014年9月,他們又以4800萬美元收購了SAGE實驗室。SAGE實驗室位于一個工業(yè)園區(qū)內(nèi),建在一條馬路盡頭的一組低矮的辦公建筑里。這里的科學(xué)家收到一個來自實驗室的網(wǎng)上訂單:加利福尼亞州薩克拉門托(Sacramento)的一個實驗室為研究帕金森病,訂購20只敲除了Pink1基因的小鼠。建筑新修的側(cè)樓耗資200萬美金,里面是為客戶定制的基因改造大鼠,以及其他經(jīng)CRISPR改造的嚙齒類動物。這些動物生活在超凈、恒溫的籠子里,籠子整整齊齊地放在一起,從地板一直排到天花板。工作人員填寫訂單、選出相應(yīng)的20只大鼠,將它們輕輕地放在盒子里打包,然后空運到加利福尼亞——整個流程就是這么簡單。如果有人想要研究精神分裂癥或疼痛控制,也可以這樣訂購實驗動物。

            不過,如果倉庫里沒有客戶想要定制的那種動物,流程就不一樣了。例如,有一個客戶想要研究帕金森病和一種新發(fā)現(xiàn)的可疑基因(或者一個基因的特定突變)之間的關(guān)系,當(dāng)他到SAGE實驗室訂購嚙齒類動物的時候,有幾個選擇。SAGE實驗室的科學(xué)家能用CRISPR技術(shù)“關(guān)掉”目標(biāo)基因,制造一個突變;他們也可以關(guān)掉目標(biāo)基因,然后再往里插入一個人源基因。從帕金森病到囊性纖維化,再到艾滋病,許多疾病都和基因突變有關(guān)。過去,科學(xué)家需要一年時間,才能培育出這些帶有復(fù)雜基因突變的實驗動物。但CRISPR不同于以往的基因組編輯技術(shù)。利用這種技術(shù),研究人員能同時在細胞內(nèi)快速地改變多個基因。培育基因工程動物的時間已因此縮短到幾周。

            SAGE的員工首先使用化學(xué)試劑盒,合成客戶定制的DNA,以及與這條DNA相匹配的RNA。他們將RNA和Cas9蛋白在培養(yǎng)皿里混合,一套具有基因組編輯功能的CRISPR工具就誕生了。然后他們會花上大約一周的時間,用一種外形類似于掃描儀的儀器,測試該工具在動物細胞內(nèi)的功能。這種儀器能夠發(fā)射電流,將CRISPR工具注入細胞。進入細胞的CRISPR工具會立刻開始工作,對DNA進行剪切,進行小量的基因插入與刪除。CRISPR并非100%有效:在某些細胞里,它們會剪切DNA、制造突變,在另一些細胞里則*不起作用。為了觀察CRISPR的表現(xiàn)究竟如何,科學(xué)家會從細胞中收集DNA,將它們集中起來,并將目標(biāo)位點附近的片段DNA復(fù)制多個拷貝。他們會對這些DNA進行處理與分析,然后查看顯示在電腦屏幕上的分析結(jié)果。如果CRISPR成功切開目標(biāo)位點,制造出突變,屏幕上就會顯示出一條模糊的條帶,并且,CRISPR剪切過的DNA越多,條帶就越明亮。接下來,“戰(zhàn)場”轉(zhuǎn)移到了側(cè)樓的動物實驗室里??茖W(xué)家就是在這里制造出經(jīng)基因改造的胚胎,以及突變過的嚙齒動物。生物學(xué)家安德魯·布朗(Andrew Brown)戴著外科手套、身穿藍色的長袍、戴著套鞋和蓬松的帽子,彎腰伏在解剖顯微鏡前。他用玻璃移液管的吸起一個大鼠胚胎,然后走到房間的另一頭,將胚胎轉(zhuǎn)移至另一臺裝有機械手臂的顯微鏡上。他將胚胎放到載玻片上的一滴液體里,固定到臺面上?,F(xiàn)在,CRISPR就要發(fā)揮它的魔力了:他用右手控制操縱桿,一只機械手臂將一根空的玻璃針頭扎入胚胎。

            從顯微鏡的目鏡看去,胚胎中來自雙親的兩個原核(pronucleus)就像是月球表面的環(huán)形山。布朗輕輕推動細胞,直到其中一個原核移到針尖的旁邊。他點擊電腦鼠標(biāo),一滴含有CRISPR的液體從針頭噴出,穿過細胞膜進入細胞。原核立即像一朵快速盛開的花一樣膨脹開來。布朗運氣不錯,一個突變細胞就此誕生了。SAGE實驗室中有3個技術(shù)員,他們一周4天、一天300次地重復(fù)著這項工作。

            布朗將完成注射的大鼠胚胎吸入移液管,移進培養(yǎng)皿,存儲在加熱至動物體溫的培養(yǎng)箱中。zui后,他需要將30~40枚經(jīng)過修飾的胚胎注射到代孕母鼠體內(nèi)。20天后,代孕大鼠將懷上5~20個“孩子”,當(dāng)這些“孩子”長到10天大的時候,SAGE實驗室的科學(xué)家將抽取組織樣本,檢測哪個“孩子”帶有改造過的基因。

            “這是zui令人激動的時候,”布朗說道。20個胚胎中,可能只有1個能被成功改造,而改造成功的動物,就是我們所說的種源動物(founder animal)。到了這一步,每個人都會慶祝一下。在我們看來,SAGE實驗室的科學(xué)家制造RNA、注射胚胎的方法似乎很簡單,很多實驗室也在用同樣的步驟培養(yǎng)基因工程動物。正如SAGE的執(zhí)行官戴維·斯莫勒(David Smoller)說的那樣,這是可以“量產(chǎn)”的基因組編輯技術(shù)。

            CRISPR已經(jīng)勇猛地踏上了商業(yè)化的征途,研究人員和商人都在為這種技術(shù)設(shè)想新的商業(yè)用途,其中的某些想法甚至有些狂妄。運用這種技術(shù),醫(yī)生或許可以在懷孕早期的婦女體內(nèi),改造與唐氏綜合征有關(guān)的異常染色體;育種人員可以重新向抗性雜草的基因組中引入對除草劑敏感的基因;我們還可以復(fù)活已經(jīng)滅絕的物種。這當(dāng)然會讓有些人感到害怕。比如,zui近就有一些警告性的頭條報道,將這種技術(shù)形容為“扮演上帝的好方法”,或者“瓶中妖”。這些文章?lián)?,?dāng)我們急于擺脫瘧蚊,太想治好亨廷頓病,或者期望“設(shè)計”出更好的嬰兒時,我們也可能是在創(chuàng)造一個充滿有害新基因的“侏羅紀(jì)公園”。

            以哈佛大學(xué)研究人員提出的“滅蚊項目”為例。美國伍德羅·威爾遜學(xué)者中心(Woodrow Wilson International Center for Scholars)的生物安全分析師托德·庫伊肯(Todd Kuiken)認為,戰(zhàn)勝瘧原蟲是一回事,但要消滅這種寄生蟲的載體,卻是*不同的另一項任務(wù)。如果我們的目標(biāo)是*瘧疾這種每年感染兩億人、殺死60萬人的疾病,我們就不得不小心,自己是否會制造出10個新麻煩。“我們必須想清楚,‘我們真要這樣做嗎?’如果答案是‘是’,我們有哪些可用的系統(tǒng)?有什么樣的保障措施?”

            科學(xué)家正在快速行動,他們希望預(yù)見CRISPR技術(shù)zui可能的危害,并制定應(yīng)對措施。2014年7月17日,當(dāng)哈佛大學(xué)的團隊發(fā)表一篇討論如何用CRISPR消滅瘧蚊的論文時,他們也在呼吁公眾對這一問題進行討論,他們也指出了基因改造在技術(shù)與監(jiān)管上的窘境。該團隊的生物倫理學(xué)家讓蒂寧·倫斯霍夫(JeantineLunshof)說:“CRISPR的發(fā)展如此迅猛,很多人還沒聽說過這種技術(shù),但是我們確實正在使用它。這是一種新現(xiàn)象。”現(xiàn)在,在伯克利的創(chuàng)新基因組計劃(Innovative Genomics Initiative)的框架下,杜德娜正在組建一個團隊,專門討論應(yīng)用CRISPR的倫理問題。如果對倫理問題的擔(dān)憂,撲滅了人們對CRISPR的熱情,后果將是不可想象的。例如,2014年6月,麻省理工學(xué)院的研究人員報道,他們直接從尾部向動物體內(nèi)注射CRISPR,治愈了患酪氨酸血癥(tyrosinemia,一種的罕見肝臟疾病)的成年小鼠。這種疾病由一種突變的酶引起。研究人員向小鼠體內(nèi)注射了3種gRNA序列和Cas9蛋白,以及突變基因的正確DNA序列。小鼠的每250個肝臟細胞中,就有1個插入了正確的基因。接下來一個月,被“修正”的肝臟細胞蓬勃生長,zui終取代了1/3的病變細胞——這足以使小鼠擺脫上述疾病。2014年8月,坦普爾大學(xué)(Temple University)的病毒學(xué)家卡邁勒·哈利利(Kamel Khalili)領(lǐng)導(dǎo)的研究人員報道,他們已經(jīng)用CRISPR在數(shù)個人類細胞系中對HIV病毒進行了剪切。

            自上世紀(jì)80年代起,哈利利一直奮戰(zhàn)在對抗HIV/AIDS的前線。對他來說,CRISPR是場不折不扣的革命。盡管艾滋病治療已經(jīng)取得了巨大的進步,但今天的藥物僅僅能控制病毒,仍然不能*疾病。不過,運用CRISPR,哈利利團隊已經(jīng)*從細胞中清除了HIV的完整DNA拷貝,將受感染的細胞轉(zhuǎn)化了成無病毒細胞。并且,除了“清洗”已經(jīng)感染病毒的細胞,CRISPR還可以將一段病毒序列整合進未受感染的細胞中,對其進行免疫——正如杜德娜和她的團隊在原始的細菌中觀察到的那樣。你可以將這種手段稱作“基因疫苗”。哈利利說:“這是*的治療方法,如果你在兩年前問我,‘你能地切割人類細胞中的HIV嗎?’我可能會說這非常困難。但現(xiàn)在,我們做到了。”

            通過輕輕地擠壓細胞,就可以讓一些大分子或納米材料進入細胞,進而改變細胞的運作。

            可編程的細胞

            假如人類能讓體內(nèi)的細胞按照我們的要求去運作,比如讓它們適時地合成胰島素,或去攻擊腫瘤,那么許多健康問題將會迎刃而解。不過,實現(xiàn)這一愿望并非易事?,F(xiàn)在普遍使用的方法是,利用病毒穿透細胞膜,對細胞進行干預(yù),但這樣會對細胞造成*性的損壞。

            2009年,麻省理工學(xué)院的研究人員在不經(jīng)意間解決了這一技術(shù)難題。他們當(dāng)時正嘗試用顯微水槍向細胞注入一些大分子和納米材料。這些物質(zhì)可以改變細胞的運作機制,同時又能保證細胞存活。化學(xué)工程師阿蒙·沙雷(Armon Sharei)發(fā)現(xiàn),水槍的沖擊使部分細胞的外形產(chǎn)生了短暫的畸變。

            令人吃驚的是,當(dāng)細胞的外形處于畸變狀態(tài)時,注射的物質(zhì)成功地進入到了細胞內(nèi)。沙雷說道:“這讓我們意識到,如果讓細胞在足夠短的時間內(nèi)產(chǎn)生形變,便可暫時克服細胞膜的阻礙。”不管怎樣,顯微水槍還只是一種較為粗放的方法,下一步工作是找到一種更加溫和的方式來擠壓細胞。

            為此,在顯微流控領(lǐng)域的奠基人之一克拉夫·F·延森(Klavs F. Jensen),以及另一位生物領(lǐng)域的先鋒人物羅伯特·S·蘭格(Robert S. Langer)的帶領(lǐng)下,沙雷開發(fā)出了一種以硅和玻璃為材質(zhì)的微芯片。這種芯片的表面,預(yù)先蝕刻了供細胞流動的通道,隨著細胞流動的方向,通道逐漸收窄,直到細胞無法繼續(xù)向前行進。此時,被卡住的細胞因受擠壓而產(chǎn)生形變,細胞膜上便會出現(xiàn)小孔。這些小孔的直徑,足夠許多可改變細胞運作的介質(zhì)通過,如蛋白質(zhì)、核酸、碳納米管等。

            這項技術(shù)甚至能將介質(zhì)成功引入脆弱的干細胞和免疫細胞中,這些細胞無法經(jīng)受以前那種擠壓方式的摧殘。“這項技術(shù)適用的細胞種類之多,讓我們都始料不及,”沙雷介紹道。

            自這項技術(shù)問世以來,沙雷所在的研究團隊已經(jīng)開發(fā)出了16種適用于不同細胞的芯片。當(dāng)然,還會有更多的芯片陸續(xù)問世。而且,在現(xiàn)有每秒擠壓50萬個細胞的基礎(chǔ)上,相關(guān)設(shè)備的處理效率還將更上一層樓。該團隊已經(jīng)成立了一家名為“SQZ生物科技”的公司,將這項技術(shù)推向市場。法國、德國、荷蘭及英國的科研人員有望很快用上該技術(shù)。

            通過注入特殊化合物,可以使動物變得通體透明,這項技術(shù)將成為生物醫(yī)學(xué)領(lǐng)域發(fā)展的助推器。

            透明動物

            5年前,維維安娜·格勒迪納魯(VivianaGradinaru)還在神經(jīng)生物學(xué)實驗室里,緩慢地處理著小鼠大腦切片的二維圖像,并將其合成為三維模型。一天,她慕名參觀了“人體世界”標(biāo)本展。整個展覽zui讓她著迷的,是經(jīng)過塑化處理、完整的人體循環(huán)系統(tǒng)。這件展品讓她深深感到,類似的處理方法可以運用到她的研究領(lǐng)域中,大大地提高實驗效率。

            “組織剝離”概念的提出已有100多年,但當(dāng)時的方法,如使用溶劑浸泡等,效率十分低下,通常也會破壞標(biāo)記細胞所需的熒光蛋白。為了找到更好的解決方法,當(dāng)時還是研究生的格勒迪納魯,與已故神經(jīng)免疫學(xué)家保羅·帕特森(PaulPatterson)實驗室的同事一起,開展了相關(guān)研究。這些研究的目的是替換組織中的脂肪分子——正是脂肪使得組織不透明。不過,他們必須找到一種可替代脂肪的物質(zhì),用以支撐組織的結(jié)構(gòu)。

            zui終,他們找到了合適的方法:首先對嚙齒類動物實施人道毀滅,并將甲醛注入其體內(nèi),利用心臟將甲醛泵至動物全身;之后,剝?nèi)游锏钠つw,從血管注入一種名為丙烯酰胺單體(acrylamide monomers)的白色無味化合物。丙烯酰胺單體可在動物體內(nèi)建立一個具有支撐作用的水凝膠網(wǎng),取代動物組織內(nèi)的脂肪,并使其呈現(xiàn)無色狀態(tài);兩周之內(nèi),這種物質(zhì)可以使一只小鼠變得通體透明。

            這種方法誕生后不久,他們便開始嘗試著繪制透明小鼠的完整神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)。透明器官讓他們夢想的不少研究都成為現(xiàn)實,比如分辨周圍神經(jīng)——這類人們從前知之甚少的細微神經(jīng)束。再比如向透明小鼠尾部注入帶有熒光標(biāo)記的病毒,觀察病毒如何透過血腦屏障進入小鼠的大腦。“掌握這項技術(shù),就好比擁有了洞察世間萬物的‘透視眼’,”格勒迪納魯介紹道。透明器官一方面可降低實驗中人為誤差的概率,另一方面可提高實驗效率,豐富實驗數(shù)據(jù),同時減少實驗動物的使用數(shù)量。格勒迪納魯愿意向任何有需要的實驗室提供她的水凝膠制作方法。下一步她將把這一技術(shù)推廣到癌癥以及干細胞領(lǐng)域的研究上。

            簡易快速的納米顯微鏡

            一種可以拍攝納米粒子的電子顯微鏡能快速檢測藥物、爆炸物中的分子信息。

            具備納米尺度分辨率的電子顯微鏡已經(jīng)得到了廣泛應(yīng)用,但其價格動輒高達數(shù)百萬美元,準(zhǔn)備樣品也非常麻煩。對于專業(yè)的研究型實驗室來說,這樣的狀況還能夠接受,但如果要快速掃描產(chǎn)品樣品,來查看內(nèi)置的微尺度水印呢?

            紐約大學(xué)物理學(xué)家戴維·格里爾(David Grier)和同事研制出的一種新型全息顯微鏡,就能解決這一問題。他們以商用蔡司(Zeiss)顯微鏡為基礎(chǔ),將它的白熾燈光源換成激光光源。激光照射到待觀察的樣品上,然后發(fā)生散射,形成由激光束和散射光互相干涉而成的三維圖像(即全息圖),并由攝像機錄下。

            數(shù)十年以來,科學(xué)家已經(jīng)可以生成微尺度物體的全息圖像,但從中提取出有用的信息總是很困難。這就是格里爾這項發(fā)明的價值所在。他的研究小組編寫了一種軟件,能夠快速求解描述光在球體上散射的方程中的未知參數(shù)。這些參數(shù)中包含了關(guān)于散射物體的所有信息。由于這種顯微鏡具有納米級的分辨率,研究人員得以追蹤膠體中懸浮的粒子(例如涂料樣品中漂浮的納米珠)。同時,它的成本只有電子顯微鏡的十分之一。

            格里爾希望這種儀器能夠提供一種快速而經(jīng)濟的方式,用來觀察產(chǎn)品內(nèi)部的單個粒子。設(shè)想一下,涂料桶或洗發(fā)水瓶中每滴液體都含有標(biāo)注了產(chǎn)品生產(chǎn)信息的微粒——就像指紋一樣。格里爾還補充道,這種顯微鏡同樣容易“讀”出“加蓋”在藥物、爆炸物及其他物品中的分子信息。

            液體發(fā)電

            唾液也許會成為醫(yī)用設(shè)備的新能源。

            默罕默德·穆斯塔法·侯賽因(Muhammad Mustafa Hussain),這位沙特阿拉伯阿卜杜拉國王科技大學(xué)(King Abdullah University of Science and Technology)的教授,畢生致力于極微型裝置的研發(fā)。他用一句話總結(jié)自己的研究:“小東西拉近了我們與未來的距離。”于是,當(dāng)他在2010年著手研究、可再生的發(fā)電設(shè)備,為偏遠地區(qū)的凈水或醫(yī)療診斷提供充足的能源時,他首先考慮的因素就是小巧。不過,利用唾液驅(qū)動燃料電池,卻是他在研究開始時*沒有想到的。

            這個“吐口唾沫”的點子來自于當(dāng)時侯賽因?qū)嶒炇业耐?、?dāng)時正在攻讀博士學(xué)位的賈絲廷·E·明克(Justine E.Mink,現(xiàn)為陶氏化學(xué)公司的研究員)。那時,明克正嘗試開發(fā)一種可以植入人體,安放在胰腺附近監(jiān)測糖尿病人血糖水平的微型裝置。微生物燃料電池——這種通過向細菌提供有機物(唾液中也富含有機物),利用細菌代謝產(chǎn)生電流的方法映入了她的眼簾。碰巧她和侯賽因的項目都可以利用這種方法,因此兩人找來高導(dǎo)電性的石墨烯電極,在上面附著了唾液細菌,在一周之內(nèi),這些細菌產(chǎn)生了1微瓦(百萬分之一瓦)的電量。

            雖然1微瓦看起來微不足道,卻足以驅(qū)動諸如芯片、診斷工具、或是明克的糖尿病監(jiān)測儀這樣的微型設(shè)備了。侯賽因現(xiàn)在正與3D打印人造器官的公司合作,將他的燃料電池嵌入人造腎臟中,并通過各種體液為電池充電。他說這只是他宏偉目標(biāo)的*步,今后,他打算幫助貧困國家,利用工業(yè)廢棄物中的有機物來發(fā)電,并將電力用于海水淡化。

            “原子積木”搭建新奇材料

            新材料的發(fā)現(xiàn)總是會促進人類文明的進步。這是推動人類社會從石器時代到青銅時代,再到鐵器時代,zui后來到硅時代的動力。

            樂高積木是一種很有魔力的塑料玩具,它不斷地激發(fā)出一個又一個新創(chuàng)意。樂高積木的塑料組件體積很小,能按照不同方式組合到一起,從而變成神奇的汽車、設(shè)計巧妙的城堡和許多其他結(jié)構(gòu)。而今天,新一代材料科學(xué)家正受樂高積木的啟發(fā),將這種組合方式應(yīng)用到納米世界。

            這里的積木組件是一些層狀材料。這些材料zui薄可以達到僅有一層原子,可以按照設(shè)計好的結(jié)構(gòu),以的順序一層一層地疊加到一起。這種的精密組合方式,能夠制造出全新的物質(zhì),這些物質(zhì)具備的電學(xué)和光學(xué)性能??茖W(xué)家們進一步設(shè)想,可以利用這些物質(zhì),制造出幾乎沒有電阻的導(dǎo)電材料,運算能力更強大、運行更快的計算機,以及可彎曲、可折疊而且非常輕的可穿戴電子器件。

            這些突破性的研究,是因石墨烯(graphene)的出現(xiàn)才產(chǎn)生的。石墨烯是一種片狀結(jié)構(gòu)的石墨新材料,厚度只有一個原子,其原子結(jié)構(gòu)是一個個重復(fù)的六邊形,看起來就像鐵絲網(wǎng)圍欄一樣。2004年,我和英國曼徹斯特大學(xué)的同事從塊狀石墨上分離出了單層石墨片——石墨烯,使用的方法是利用膠帶從塊狀石墨頂層剝離出一片片1個原子厚的晶體。過去10年間,研究人員發(fā)現(xiàn)了幾十種可以用這個方法剝離的塊狀晶體,而且這樣的晶體越來越多。云母(Mica)就是其中的一種晶體,還有一些具有*名字的材料,如六方氮化硼(hexagonal boron nitride)和二硫化鉬(molybdenumdisulfide)。

            這些晶體層被認為是二維材料,因為對任何材料來說,其zui小厚度就是單個原子厚度(稍厚點的晶體,如3個左右的原子厚度,也可以看做是二維的)。而根據(jù)制造者的需求,晶體層的其他尺寸——寬度和長度,可以非常大。由于二維晶體具有許多非常*的性能,在過去幾年里,它們已經(jīng)成為材料科學(xué)和固體物理領(lǐng)域非常熱門的話題。

            我們可以將這些晶體層非常穩(wěn)定地疊放在一起。它們并不是按常規(guī)方式通過化學(xué)鍵相連的,比如共享電子的共價鍵。當(dāng)它們相互靠得非常近時,原子間會通過大家熟知的微弱的范德華力相互吸引。這個力通常不夠大,無法將多個原子或分子聚合在一起,但因為這些二維晶體層的原子非常密集,彼此之間的距離也非常近,因此這些力累加到一起,會變得很強大。

            為了理解這種材料究竟會帶來什么誘人的可能性,我們可以想一下室溫超導(dǎo)。要實現(xiàn)無能量損失的電流傳輸,而且又不需要將設(shè)備置于超低溫環(huán)境中,這一直是幾代科學(xué)家的夢想。如果發(fā)現(xiàn)了可以實現(xiàn)這個目標(biāo)的材料,對人類文明一定會產(chǎn)生非常深遠的影響。研究人員的共識是,原則上這個目標(biāo)是可以實現(xiàn)的,但沒有人知道如何實現(xiàn)。到今天,超導(dǎo)材料的zui高臨界溫度(超導(dǎo)材料從正常態(tài)轉(zhuǎn)變?yōu)槌瑢?dǎo)態(tài)時的溫度)也要在-100℃以下。過去20年來,這方面的進展非常有限。

            我們zui近發(fā)現(xiàn),用我前面描述的方法,可以將許多氧化物(由至少一個氧原子和許多其他元素組成的化合物)超導(dǎo)體分解成厚度為1個原子的片層結(jié)構(gòu)。如果我們換一種順序,將各層重新組合,并且在中間添加一層其他晶體層,會發(fā)生什么呢?我們已經(jīng)知道,氧化物的超導(dǎo)性依賴于層間距離;我們還知道在晶面之間增加一層額外的晶體層,可以將弱導(dǎo)電甚至絕緣材料變?yōu)槌瑢?dǎo)體。測試這一想法的真實實驗還沒有完成,主要是因為,制備原子尺度的“樂高材料”的相關(guān)技術(shù)仍然處于初期階段,而且將復(fù)雜的多層結(jié)構(gòu)組合到一起也很困難。

            目前,這些結(jié)構(gòu)所含的不同晶體層很少能多于5種,一般只含兩種或3種不同的晶體層,一般是由石墨烯片與二維材料(絕緣體氮化硼、半導(dǎo)體二硫化鉬、二硒化鎢等)組成。因為這種堆疊結(jié)構(gòu)含有多種材料,經(jīng)常被看作異質(zhì)結(jié)構(gòu)。它們現(xiàn)在的尺寸都非常小,通常長寬都只有10微米,比頭發(fā)的橫截面還小。利用這些堆疊結(jié)構(gòu),我們可以通過實驗來探索其新奇的電學(xué)和光學(xué)性能以及新用途。這些結(jié)構(gòu)還有一個有趣的特性:它們不僅非常薄,還非常柔軟,而且透明。這就為制備多種形狀的發(fā)光設(shè)備提供了可能:研究人員有機會制備出可折疊的顯示屏,當(dāng)使用者需要大一點的顯示屏?xí)r,就可以將顯示屏展開;也可能制備出新的計算機芯片,耗能要比現(xiàn)在的芯片低很多。

            研究人員在研究這類新材料時,如果能有一些重大突破,我們相信,一定會發(fā)展出相應(yīng)的大規(guī)模制備技術(shù),以實現(xiàn)其工業(yè)應(yīng)用。就像石墨烯和其他一些二維晶體材料那樣。zui初制備那些材料時,僅能得到幾微米大的微晶,現(xiàn)在我們已經(jīng)可以得到幾百平方米大的片狀材料。

            目前,還沒有人發(fā)現(xiàn)這類新材料有什么改變世界的“殺手級應(yīng)用”,然而,這一領(lǐng)域取得的進步,已經(jīng)讓很多科學(xué)家感到興奮。新材料的發(fā)現(xiàn)總是會促進人類文明的進步。這是推動人類社會從石器時代到青銅時代,再到鐵器時代,zui后來到硅時代的背后力量。納米尺度的“樂高積木”代表了人類從未制造過的新材料?,F(xiàn)在,我們只能猜想未來的一切,但我們相信,這種新材料帶來的可能性將是無限的。

            聲波充電

            2011年,美國賓夕法尼亞大學(xué),當(dāng)時還是古生物學(xué)專業(yè)高年級學(xué)生的梅瑞狄斯·佩里(Meredith Perry)伸手去拿她的筆記本電腦充電器。

            突然間,一個想法躍入了她的腦海:是否有一天能拋開這些麻煩的充電線呢?她隨即開始尋找將這個想法變?yōu)楝F(xiàn)實的途徑。

            佩里了解到,已經(jīng)有基于磁共振和電磁感應(yīng)的無線電力傳輸技術(shù)了,但它們的傳輸距離有限。限制它們的是平方反比定律(inverse square law),即電磁輻射的強度與輻射源的距離的平方成反比。

            然而,機械振動卻不存在這個問題。使用壓電轉(zhuǎn)換器從空氣中獲取振動能量,就可以將機械能轉(zhuǎn)化為電能,這看起來是一個更好的主意。因為聲音其實就是振動的空氣粒子,所以從理論上來說,它應(yīng)該能夠傳輸能量。而安全、安靜且高能的超聲波是個的選擇。

            當(dāng)佩里同本校教授以及其他專家討論時,很多人都認為這個想法不可行,因為無法利用超聲波提取出足夠的能量來為電子設(shè)備充電;而且,如果她真要嘗試的話,還會遇到大量的電子工程和聲學(xué)方面的問題。“但是,我知道這在理論上是可行的,”佩里說,“而且沒有人能提出足夠的證據(jù),證明這無法實現(xiàn)。”所以,她找到了uBeam公司,來研發(fā)這項技術(shù)。

            目前,他們已經(jīng)開發(fā)出了uBeam發(fā)射機的原型樣機。它相當(dāng)于一臺定向揚聲器,可以將超聲波聚焦,產(chǎn)生一個能量“焦點”;與電子設(shè)備相連的接收器負責(zé)接收這股能量,并將其轉(zhuǎn)化為電能。她計劃在兩年內(nèi)推出*批產(chǎn)品。

            佩里說,通用無線充電系統(tǒng)不僅能讓我們不用再攜帶目前各式各樣且互不兼容的電線和充電器,還可以保證移動設(shè)備在進行高耗電操作時不會用盡電量。擺脫電線的束縛,還能帶來嶄新的室內(nèi)裝修設(shè)計思路。此外,目前載有沉重輸電線纜的飛機、汽車、太空船等運載工具,重量也可以大幅降低。

            “總的來說,無線充電技術(shù)將*改變我們與物質(zhì)世界的作用方式,”佩里說,“我們將不再受制于電源插座。”

            儲存熱能的電池

            基于熱耦合效應(yīng)的新型電池,可以將白白流失的熱能轉(zhuǎn)化為電能,這一技術(shù)擁有巨大的應(yīng)用前景。

            在工業(yè)生產(chǎn)中,每年都有100億瓦特的電量以熱能的形式被浪費掉了,而這些能量足夠為1000萬戶家庭提供照明用電。通過熱電效應(yīng)(thermoelectric effect),就可以利用溫差發(fā)電,把這類熱能轉(zhuǎn)化為電能。但是,這樣也只能利用其中的一部分。麻省理工學(xué)院的博士后研究員楊遠(Yuan Yang)解釋道:這是因為幾十年來的研究都表明,需要達到500℃以上的溫差,才能產(chǎn)生出具有實際使用價值的能量。不幸的是,據(jù)美國環(huán)境保護局(Environmental Protection Agency)的估計,在美國每年浪費的能量中,有三分之一都是以低于100℃的溫度逃逸掉的。

            楊遠和他的導(dǎo)師、斯坦福大學(xué)的陳剛(Gang Chen),以及博士后研究員崔屹(Yi Cui)和李碩祐(Seok Woo Lee)一道,研發(fā)出了一種溫差僅為理論值1/10(低至50℃)的發(fā)電技術(shù)。這種技術(shù)的關(guān)鍵是利用了熱耦效應(yīng)(thermogalvanic effect,與熱電效應(yīng)有類似之處)。在這個過程中,材料整體的溫度都隨電壓而變化,而非僅在電池中產(chǎn)生溫度差。研究團隊使用不帶電的電池芯,配以銅電極,在高溫時進行充電,然后再讓它們冷卻——神奇的事情發(fā)生了,電池的放電電壓比為它們充電時所用的電壓更高。換句話說,用于加熱電池的能量被電池以電能的形式收集了起來。

            直到近兩年,電池電極的效率才達到能將如此小的溫差轉(zhuǎn)化為電能的程度,楊遠介紹說。而且在實現(xiàn)商業(yè)化前,這項技術(shù)還需要很多的研究工作來進一步完善。但是,人們遲早會建起由大量電池組筑起的“圍墻”,環(huán)繞在工廠煙囪或發(fā)電廠的周圍,將以往白白浪費掉的熱能轉(zhuǎn)化為電力。“這一場景非常誘人,”楊遠說,“因為被浪費掉的熱能隨處可見。”

            新型聚合物“泰坦”

            環(huán)保、高強度、可自我愈合、可回收的聚合物,將改變汽車、飛機等諸多行業(yè)。

            當(dāng)化學(xué)家珍妮特·加西亞(Jeannette García)在zui近用過的一個燒瓶里,發(fā)現(xiàn)了一塊糖果大小的白色材料時,她壓根不知道到自己做出了什么東西。這種材料緊緊附著在玻璃上,所以只能用錘子打碎燒瓶才將其取出。但是,當(dāng)她再次用舉起錘子,去敲打這塊材料本身時,后者卻毫發(fā)無損。“當(dāng)意識到它的有多堅固時,我就知道必須要弄清楚我究竟做出了什么東西,”加西亞說。

            加西亞是IBM公司阿爾馬登研究中心的科學(xué)家。zui終,她在幾位同事的幫助之下解開了這個謎團。他們發(fā)現(xiàn),這種令人吃驚的材料是一類新型熱固性聚合物。這是一類極為堅固的塑料,能用于從智能手機到飛機機翼等眾多產(chǎn)品中。雖然在每年生產(chǎn)的聚合物中,熱固性材料就占到了三分之一,但是它們很難被回收利用。而加西亞發(fā)現(xiàn)的新材料(被稱為“泰坦”),是目前為止發(fā)現(xiàn)的*種可回收的、具有工業(yè)級強度的熱固性材料。

            傳統(tǒng)熱固塑料無法回收重塑,而上述新型聚合物可以通過化學(xué)反應(yīng)進行重新加工。在2014年5月的《科學(xué)》(Science)雜志上,加西亞和同事介紹了他們的發(fā)現(xiàn)。

            預(yù)計,對耐用且可回收的塑料產(chǎn)品的需求將很快大幅攀升。到2015年,歐洲和日本都將要求廠家在生產(chǎn)汽車部件時,可回收材料的比例要達到95%。“‘泰坦’恰恰可以地滿足這種需求,”加西亞說。此外,她相信這種新材料zui終還能推廣到更廣泛的應(yīng)用中,包括抗蝕抗菌涂層、給藥設(shè)備、粘結(jié)劑、3D打印、水凈化領(lǐng)域等。

            “泰坦”還有其他優(yōu)點。加西亞和同事發(fā)現(xiàn),這種材料還有第二種形態(tài)——在低溫時,它會呈現(xiàn)出可自愈合、類似凝膠的形態(tài)。這種形態(tài)被研究人員稱為“海德魯”(Hydro,意為水)。“如果將海德魯切成兩半,再放回一起,它們會立刻互相粘結(jié),”加西亞介紹說。這樣,“泰坦”就可以用作粘合劑,或者自修復(fù)涂料,其他相關(guān)的化學(xué)產(chǎn)品也將陸續(xù)被開發(fā)出來。“(我們發(fā)現(xiàn)的)不僅僅是一種新型聚合物,而且還是一種新的聚合物生成反應(yīng)。”加西亞說。

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