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千人教授:CRISPR在干細(xì)胞領(lǐng)域顯示廣闊前景
閱讀:222 發(fā)布時(shí)間:2015-1-8自2012年起,一種稱(chēng)作為CRISPR的強(qiáng)大的“基因組編輯"技術(shù)便被研究人員用來(lái)剪切、破壞、替換或是添加生物體的DNA序列?,F(xiàn)在來(lái)自約翰霍普金斯大學(xué)醫(yī)學(xué)院的科學(xué)家們證實(shí),這一系統(tǒng)還可以且有效地改變?nèi)祟?lèi)干細(xì)胞。
在發(fā)表于《Molecular Therapy》雜志上的一篇研究報(bào)告中,該研究小組表示這些研究成果可以簡(jiǎn)化及加快改變和定制人類(lèi)誘導(dǎo)多能干細(xì)胞(iPSCs)的研究工作,使得iPSCs能夠成為一種療法或用于開(kāi)發(fā)模式系統(tǒng)來(lái)研究疾病或測(cè)試藥物。
約翰霍普金斯大學(xué)醫(yī)學(xué)院醫(yī)學(xué)講師葉朝暉(Zhaohui Ye,音譯)博士說(shuō):“干細(xì)胞技術(shù)正在迅速地發(fā)展,我們認(rèn)為離我們能夠?qū)PSCs用于人類(lèi)治療的日子已不會(huì)太遠(yuǎn)。這是*項(xiàng)研究詳細(xì)記述了CRISPR在人類(lèi)iPSCs中的應(yīng)用,展示了它在這些細(xì)胞中的潛能。"
CRISPR源于包含著稱(chēng)作為成簇的規(guī)律間隔的短回文重復(fù)序列(clustered regularly interspaced short palindromic repeats)片段DNA的微生物免疫系統(tǒng)。這一工程編輯系統(tǒng)利用了一種DNA剪切酶和一段短RNA片段,后者可將這一工具引導(dǎo)到研究人員希望在基因組中引入切口或其他改變的位置。
以往的研究表明,相比于其他的基因組編輯技術(shù)例如轉(zhuǎn)錄激活樣效應(yīng)因子核酸酶(transcription activator-like effector nuclease, TALEN),CRISPR能夠通過(guò)這些干預(yù)更有效地引起基因組改變或突變。
盡管CRISPR具有一些優(yōu)勢(shì),近期的一項(xiàng)研究表明它還有可能在人類(lèi)癌細(xì)胞系中引起大量的“脫靶"效應(yīng),尤其是改變研究人員并不想觸及的一些基因。
為了解這種不良效應(yīng)是否會(huì)發(fā)生于其他人類(lèi)細(xì)胞類(lèi)型中,葉朝暉、約翰霍普金斯大學(xué)醫(yī)學(xué)院醫(yī)學(xué)和腫瘤學(xué)教授程臨釗(Linzhao Cheng)及同事們,在人類(lèi)iPSCs中比較了CRISPR和TALEN。iPSCs是一種行為像胚胎干細(xì)胞的重編程成體細(xì)胞,人類(lèi)iPSCs已在疾病的治療和研究方面顯示出巨大的應(yīng)用前景。
研究人員比較了兩種基因編輯系統(tǒng)在iPSCs中刪除已知基因,或是切除一段基因并以其他基因來(lái)替代它的能力。研究人員選擇了JAK2、SERPINA1和AAVS1來(lái)作為模式基因:當(dāng)JAK2基因突變時(shí)可引起一種稱(chēng)作為真性紅細(xì)胞增多癥的骨髓異常;SERPINA1突變則可引起α1抗胰蛋白酶缺陷——一種可引起肺病和肝病的遺傳性疾??;此外,近期的研究發(fā)現(xiàn)AAVS1是人類(lèi)基因組中插入外源基因的一個(gè)“安全港"( safe harbor)。
比較結(jié)果發(fā)現(xiàn)當(dāng)只是簡(jiǎn)單地刪除這些基因的某部分時(shí),在所有三個(gè)基因系統(tǒng)中CRISPR比TALEN更,其誘導(dǎo)的切割高100倍。而當(dāng)利用這些基因組編輯工具來(lái)替換基因的某部分,例如JAK2和SERPINA1基因的致病突變時(shí),CRISPR和TALEN在患者來(lái)源的iPSCs中顯示出大致相同的效率。
該研究小組說(shuō),與人類(lèi)癌細(xì)胞系的結(jié)果相反,CRISPR和TALEN在人類(lèi)iPSCs中具有相同的靶向特異性,只擊中設(shè)計(jì)影響的基因。研究人員還發(fā)現(xiàn)相比于TALEN,CRISPR系統(tǒng)具有一個(gè)優(yōu)勢(shì):當(dāng)只有一個(gè)拷貝的基因受累時(shí),可以設(shè)計(jì)它只靶向包含突變的基因,而不影響患者的健康基因。
葉朝暉和程臨釗說(shuō),這些研究結(jié)果結(jié)合早些時(shí)候發(fā)表在干細(xì)胞期刊《細(xì)胞干細(xì)胞》(Cell Stem Cell)雜志上的一項(xiàng)相關(guān)研究,確證了CRISPR是一種在人類(lèi)iPSCs中編輯基因的有用工具,且脫靶效應(yīng)風(fēng)險(xiǎn)極小。
“CRISPR介導(dǎo)的基因組編輯為在生物學(xué)相關(guān)細(xì)胞中實(shí)現(xiàn)許多的遺傳應(yīng)用打開(kāi)了一扇大門(mén),可促使更好地了解人類(lèi)疾病及其潛在療法,"程臨釗說(shuō)。