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            杭州實(shí)了個(gè)驗(yàn)生物科技有限公司

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            賽默飛q5熒光定量pcr儀操作規(guī)程

            2024-12-27  閱讀(281)

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            賽默飛 QuantStudio Q5 熒光定量PCR儀操作規(guī)程

            以下是 賽默飛 QuantStudio Q5 實(shí)時(shí)熒光定量PCR儀 的標(biāo)準(zhǔn)操作規(guī)程(SOP)。此規(guī)程涵蓋實(shí)驗(yàn)前準(zhǔn)備、儀器操作、實(shí)驗(yàn)設(shè)置、運(yùn)行和數(shù)據(jù)分析的步驟。


            1. 實(shí)驗(yàn)前準(zhǔn)備

            1.1 儀器檢查

            1. 確保儀器接通電源并處于正常工作狀態(tài)。

            2. 打開(kāi) QuantStudio Q5 儀器和配套的軟件系統(tǒng)。

            3. 檢查儀器光學(xué)模塊是否清潔,無(wú)塵無(wú)污染。

            4. 確認(rèn)實(shí)驗(yàn)室環(huán)境穩(wěn)定(溫度20-25°C,濕度40-60%),避免灰塵干擾。

            1.2 反應(yīng)材料準(zhǔn)備

            準(zhǔn)備 PCR 反應(yīng)所需試劑和耗材:

            • 樣本模板(DNA 或 RNA 轉(zhuǎn)錄的 cDNA)。

            • 引物和探針(根據(jù)靶標(biāo)基因設(shè)計(jì))。

            • 熒光定量PCR試劑(如SYBR Green Master Mix或TaqMan Master Mix)。

            • 96 孔板或 0.2 mL PCR 管,以及光學(xué)透明封板或封膜。

            • 無(wú)菌移液器、濾芯吸頭。

            1.3 標(biāo)準(zhǔn)反應(yīng)體系

            以下是 20 µL 體系的標(biāo)準(zhǔn)配方示例:

            成分體積(µL)說(shuō)明
            PCR Master Mix10含有聚合酶、dNTP、Mg2?等
            上下游引物(10 µM)0.5 各根據(jù)靶基因調(diào)整濃度
            探針(10 µM)或染料0.5如 TaqMan 探針或 SYBR Green
            模板 DNA/cDNA1-2根據(jù)樣本濃度調(diào)整體積
            無(wú)核酸酶水至 20 µL補(bǔ)足總反應(yīng)體系體積

            1.4 注意事項(xiàng)

            1. 反應(yīng)體系混合時(shí)保持在冰上操作。

            2. 混勻后輕微離心,避免產(chǎn)生氣泡。

            3. 使用負(fù)對(duì)照(無(wú)模板對(duì)照)和正對(duì)照,確保實(shí)驗(yàn)的可靠性。


            2. 儀器操作步驟

            2.1 啟動(dòng)儀器

            1. 打開(kāi) QuantStudio Q5 實(shí)時(shí)熒光定量PCR儀。

            2. 啟動(dòng)配套軟件(QuantStudio Design and Analysis Software)。

            3. 選擇“新建實(shí)驗(yàn)"以創(chuàng)建實(shí)驗(yàn)文件。

            2.2 實(shí)驗(yàn)參數(shù)設(shè)置

            1. 實(shí)驗(yàn)類(lèi)型選擇:

              • 絕對(duì)定量:用于計(jì)算 DNA 或 RNA 的絕對(duì)拷貝數(shù)。

              • 相對(duì)定量:用于基因表達(dá)水平比較。

              • 溶解曲線(xiàn)分析:檢查 PCR 產(chǎn)物的特異性。

              • 基因分型:分析基因突變和 SNP。

            2. 板型設(shè)置:

              • 根據(jù)實(shí)驗(yàn)需求選擇 96 孔或 384 孔板格式。

              • 為每個(gè)孔輸入樣本名稱(chēng)(如標(biāo)準(zhǔn)品、未知樣本、對(duì)照組)。

            3. 熒光染料設(shè)置:

              • 根據(jù)使用的染料或探針設(shè)置相應(yīng)的熒光通道(如 FAM、VIC、ROX)。

              • 啟用 ROX 參考染料(如果試劑中包含)。

            4. 熱循環(huán)程序:

              • 初始變性:95°C,2-10 分鐘。

              • 循環(huán)反應(yīng)(40 次循環(huán))

              • 95°C,15 秒(變性)。

              • 60°C,30-60 秒(退火和延伸,熒光信號(hào)采集階段)。

              • 設(shè)置標(biāo)準(zhǔn) PCR 循環(huán)程序:

              • 如果需要溶解曲線(xiàn)分析,加入升溫梯度(如從 60°C 至 95°C)。

            2.3 加載樣本板

            1. 將已封裝好的 PCR 板或管放入樣本托盤(pán)。

            2. 確保 PCR 板放置平穩(wěn),并封膜牢固,避免蒸發(fā)。

            3. 關(guān)閉樣本艙門(mén),確保儀器密封。

            2.4 啟動(dòng)實(shí)驗(yàn)

            1. 檢查設(shè)置無(wú)誤后,點(diǎn)擊 “運(yùn)行實(shí)驗(yàn)"。

            2. 儀器開(kāi)始運(yùn)行,同時(shí)采集熒光信號(hào)。

            3. 在運(yùn)行過(guò)程中,實(shí)時(shí)監(jiān)測(cè)擴(kuò)增曲線(xiàn)以確認(rèn)擴(kuò)增反應(yīng)正常。


            3. 數(shù)據(jù)分析

            3.1 實(shí)時(shí)監(jiān)控

            • 儀器運(yùn)行時(shí),軟件界面會(huì)顯示擴(kuò)增曲線(xiàn)的實(shí)時(shí)變化。

            • 檢查所有樣本的熒光信號(hào)是否正常累積。

            3.2 Ct 值分析

            • Ct 值(循環(huán)閾值): 自動(dòng)計(jì)算每個(gè)樣本的 Ct 值,Ct 值越低,樣本初始濃度越高。

            • 對(duì)照標(biāo)準(zhǔn)品生成標(biāo)準(zhǔn)曲線(xiàn),用于絕對(duì)定量計(jì)算樣本濃度。

            3.3 溶解曲線(xiàn)分析(SYBR Green 實(shí)驗(yàn))

            • 檢查 PCR 產(chǎn)物是否特異性擴(kuò)增。

            • 特異性擴(kuò)增應(yīng)顯示單一峰值,非特異性產(chǎn)物會(huì)有多個(gè)峰值。

            3.4 數(shù)據(jù)導(dǎo)出

            • 將分析結(jié)果(擴(kuò)增曲線(xiàn)、Ct 值表、溶解曲線(xiàn)等)保存為 Excel、PDF 或圖片格式

            • 確保實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)備份并存檔。


            4. 實(shí)驗(yàn)完成后的維護(hù)

            4.1 清潔儀器

            1. 實(shí)驗(yàn)完成后,取出樣本板并清理托盤(pán)。

            2. 用無(wú)塵布輕輕擦拭儀器內(nèi)部,防止樣本殘留。

            4.2 光學(xué)模塊維護(hù)

            • 定期清潔光學(xué)模塊,保持熒光檢測(cè)的靈敏度。

            • 如果出現(xiàn)熒光信號(hào)異常,需校準(zhǔn)光學(xué)模塊。

            4.3 溫控校準(zhǔn)

            • 按照儀器使用手冊(cè),每 3-6 個(gè)月對(duì)溫控模塊進(jìn)行校準(zhǔn),確保溫度一致性。

            4.4 軟件更新

            • 定期檢查軟件版本,安裝賽默飛發(fā)布的最新補(bǔ)丁或更新。


            5. 注意事項(xiàng)

            1. 樣本操作

              • 使用無(wú)核酸酶污染的耗材和移液器。

              • 避免模板 DNA 交叉污染。

            2. 試劑保存

              • 熒光染料和酶類(lèi)應(yīng)按照試劑說(shuō)明存放(如 -20°C 冷凍)。

              • 使用前確保試劑混勻。

            3. 實(shí)驗(yàn)運(yùn)行

              • 在運(yùn)行過(guò)程中不要隨意中斷儀器運(yùn)行,防止數(shù)據(jù)丟失。

              • 若出現(xiàn)異常終止,記錄故障代碼并聯(lián)系賽默飛技術(shù)支持。


            總結(jié)

            賽默飛 QuantStudio Q5 熒光定量PCR儀以其靈活性和高精度著稱(chēng),是中小型實(shí)驗(yàn)室開(kāi)展基因定量分析的理想工具。嚴(yán)格按照操作規(guī)程(SOP)進(jìn)行實(shí)驗(yàn),可提高實(shí)驗(yàn)結(jié)果的可靠性和可重復(fù)性,同時(shí)確保儀器的長(zhǎng)期穩(wěn)定運(yùn)行。



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