2013年2月17日，第十屆烏普薩拉電子捕獲與電子轉(zhuǎn)移裂解國際會議(UPPCON 2013)在北京友誼賓館召開，由北京生命科學(xué)研究所(NIBS)和中科院計算技術(shù)研究所合作承辦。UPPCON 2013是一個偏重質(zhì)譜基礎(chǔ)研究的國際會議，圍繞離子-離子和離子-電子的氣相反應(yīng)的理論、實驗、儀器開發(fā)和應(yīng)用，數(shù)位最的的學(xué)者介紹他們的研究工作。
會議現(xiàn)場
賽默飛展臺
賽默飛科技ETD技術(shù)發(fā)明人 John E.P.Syka博士
賽默飛ETD技術(shù)發(fā)明人John E.P. Saka博士的報告題目是《Instrumental Approaches to Improving ETD Spectral Quality》，介紹了ETD技術(shù)的進(jìn)展。
ETD是基于離子/離子氣相化學(xué)一種碎裂多肽的新方法，是鑒定蛋白及其翻譯后修飾強有力的工具。ETD通過從陰離子自由基到質(zhì)子肽轉(zhuǎn)移電子的化學(xué)能量將肽碎裂，引發(fā)多肽骨干分裂，獲得蛋白質(zhì)翻譯后修飾的重要序列信息。
LTQ Orbitrap 系統(tǒng)結(jié)構(gòu)
傳統(tǒng)的誘導(dǎo)活化裂解(CAD)常用來鑒定蛋白，并試圖確定和找到它們修飾的位點，但CAD技術(shù)有其固有的缺點。與線性離子阱的結(jié)合使用的ETD，可以很容易鑒定用CAD不能鑒定的多肽。
ETD 是由電子捕獲解離ECD 發(fā)展而來，但ECD僅能在的FT ICR 高分辨質(zhì)譜上使用，而ETD 的誕生，可以較為經(jīng)濟的在低分辨離子阱質(zhì)譜上實現(xiàn)同樣的功能。
報告討論了在質(zhì)譜上提高ETD產(chǎn)生離子的數(shù)量的方法。分別從兩個方面，一是進(jìn)入ETD的離子數(shù)量，一是ETD產(chǎn)生的m/z離子的數(shù)量。
賽默飛應(yīng)用中心 張偉博士
賽默飛應(yīng)用中心張偉博士作了題為《Method Development of Typical ETD Experiments for Proteomics Applications》的報告。
張博士認(rèn)為，ETD的發(fā)展非常迅速，能獲得更豐富的系列碎片。在蛋白質(zhì)組學(xué)等領(lǐng)域，ETD與CID是很好的互補，30%蛋白質(zhì)組學(xué)的用戶都在使用這個技術(shù)。
ETD產(chǎn)生離子的反應(yīng)機理
ETD產(chǎn)生離子的反應(yīng)機理很簡單，當(dāng)電子轟擊氮氣的時候，會產(chǎn)生一個熱電子，熱電子很容易被捕獲，肽段發(fā)生斷裂反應(yīng)。相對于傳統(tǒng)的CAD技術(shù)，ETD提供了更穩(wěn)定的方法來定性PTMs，鑒定大型多肽或甚至整個蛋白質(zhì)。ETD能夠?qū)⑵胀ǚg后修飾的多肽，或者多個堿性殘基的多肽甚至整個蛋白質(zhì)生成離子。 ETD也可以輕易碎裂含有二硫鍵的的多肽。
ETD中電子轉(zhuǎn)移裂解原理
ETD達(dá)到狀態(tài)的途徑
ETD實驗達(dá)到的狀態(tài)，主要通過四個部分的調(diào)節(jié)，一是對ETD源的調(diào)諧和優(yōu)化，二是建立合適的Tune文件，三是建立分析方法，最后是數(shù)據(jù)處理、搜庫軟件。
ETD應(yīng)用的例子
CID+ETD、CID-NL-ETD、DDDT的磷酸化蛋白質(zhì)組的分析。從老鼠睪丸體中取出全蛋白，通過分解后，用IMAC富集，然后數(shù)據(jù)處理就用PD Workflow。通過一系列的數(shù)據(jù)處理之后就得到所有譜圖的鑒定結(jié)果。CID+ETD、CID-NL-ETD、DDDT三種策略也是很好的互補。
CID+ETD、CID-NL-ETD、DDDT的互補性
關(guān)于賽默飛世爾科技
賽默飛世爾科技（紐約證交所代碼： TMO）是科學(xué)服務(wù)領(lǐng)域的世界。我們的使命是幫助客戶使世界更健康、更清潔、更安全。公司年銷售額130億美元，員工約39,000人。主要客戶類型包括：醫(yī)藥和生物技術(shù)公司、醫(yī)院和臨床診斷實驗室、大學(xué)、科研院所和政府機構(gòu)，以及環(huán)境與過程控制行業(yè)。借助于Thermo Scientific、Fisher Scientific和Unity™ Lab Services三個首要品牌，我們將創(chuàng)新技術(shù)、便捷采購方案和實驗室運營管理的整體解決方案相結(jié)合，為客戶、股東和員工創(chuàng)造價值。我們的產(chǎn)品和服務(wù)幫助客戶解決在分析領(lǐng)域所遇到的復(fù)雜問題與挑戰(zhàn)，促進(jìn)醫(yī)療診斷發(fā)展、提高實驗室生產(chǎn)力。欲了解更多信息，請瀏覽公司網(wǎng)站：
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