首頁 >> 公司動(dòng)態(tài) >> OncoCyte選擇Ion Torrent助力肺癌檢測方案走向臨床
自O(shè)ncoCyte公司選擇賽默飛Ion GeneStudio S5二代測序平臺開發(fā)癌癥早篩產(chǎn)品以來，近日OncoCyte公司表示可在今年年底推出非侵入性（液體活檢）肺癌檢測方案，并使用人口對照，盲測樣本隊(duì)列執(zhí)行的內(nèi)部驗(yàn)證，從而獲得強(qiáng)大的性能數(shù)據(jù)。
DetermaVu™液體活檢肺癌檢測方案 OncoCyte公司的這一肺癌檢測方案稱為DetermaVu™，通過對一組與人體癌癥免疫應(yīng)答相關(guān)的基因表達(dá)生物標(biāo)志物進(jìn)行分析，確定偶然或篩檢發(fā)現(xiàn)的肺部結(jié)節(jié)是否會發(fā)展成癌癥。
OncoCyte公司執(zhí)行官Bill Annett表示，這項(xiàng)檢測方案的應(yīng)用價(jià)值在于將大大減少不必要的肺組織活檢，因?yàn)榉尾炕顧z除價(jià)格高昂外，還存在較高的并發(fā)癥發(fā)生率。例如，近期在JAMA Internal Medicine上發(fā)表的一項(xiàng)研究調(diào)研了接受肺活檢的近350,000名患者的醫(yī)療記錄，并得出結(jié)論：65歲以下患者的并發(fā)癥發(fā)生率為22.2％，65歲及以上患者的并發(fā)癥發(fā)生率為24％。
OncoCyte選擇Ion Torrent二代測序平臺
OncoCyte公司在獲得Wistar研究所后開始將DetermaVu™商業(yè)化，最初預(yù)計(jì)于2017年底在市場上推出該產(chǎn)品。然而，2017年底，原先使用的基因檢測平臺在重現(xiàn)性方面面臨一些挑戰(zhàn)，從而使Oncyte公司開始尋找更合適的工具來幫助DetermaVu™走向臨床。2018年，OncoCyte公司對四個(gè)平臺進(jìn)行了評估，最終選擇了Ion Torrent二代測序平臺。
OncoCyte公司的研發(fā)高級副總裁Lyndal Hesterberg表示：
可以說Ion Torrent二代測序平臺符合我們所有的期望，而且它確實(shí)能實(shí)現(xiàn)我們所需的性能。 
OncoCyte在Ion Torrent平臺上分析700個(gè)樣本
雖然，OncoCyte公司對平臺和基因特征的重新考慮導(dǎo)致了公司商業(yè)計(jì)劃的推遲，Hesterberg仍認(rèn)為這一過程是必要的，這反映了OncoCyte公司對DetermaVu™的重視，要確保將其順利推向市場。
有趣的是，平臺評估過程導(dǎo)致的計(jì)劃延遲也為根據(jù)新基因表達(dá)陣列產(chǎn)品和數(shù)據(jù)重新檢測生物標(biāo)志物的特征提供了機(jī)會，這些產(chǎn)品和數(shù)據(jù)集在DetermaVu™開發(fā)初期還沒有，因此，OncoCyte公司決定增加新的生物標(biāo)志物，將其整合到新算法中。OncoCyte公司在本周報(bào)告驗(yàn)證數(shù)據(jù)之前，在Ion Torrent平臺上對700個(gè)樣本進(jìn)行了分析，增加的生物標(biāo)志物完善了其算法。
雖然平臺和生物標(biāo)志物發(fā)現(xiàn)從頭開始看起來是奇怪的舉措，但Hesterberg 稱，公司在驗(yàn)證中觀察到的性能優(yōu)勢是顯而易見的。
公司使用250個(gè)獨(dú)立盲測樣本檢測了DetermaVu™的性能，Hesterberg表示，這些樣本是專門為盡可能接近地反映接受檢測的實(shí)際臨床人群收集的。結(jié)果表明，該DetermaVu™assay的靈敏度為90％，特異性為75％，與公司2017年所預(yù)期的數(shù)據(jù)接近，并且有更強(qiáng)大的性能。
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