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            測(cè)序金標(biāo)準(zhǔn)之旅丨片段分析這么有用,您pick了嗎?

            閱讀:51      發(fā)布時(shí)間:2024-11-20
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            基因分析儀通常稱為測(cè)序儀,主要是因?yàn)樗鼈儽挥糜赟anger測(cè)序。但對(duì)于這一廣泛的DNA測(cè)序技術(shù),您可能不知道的是,您的基因分析儀也可以用于測(cè)定DNA片段的大小,稱為“片段分析"。這是指一種廣泛應(yīng)用的遺傳分析技術(shù),適用于突變檢測(cè)、基因分型、DNA圖譜測(cè)定、遺傳譜系繪制以及連鎖分析等應(yīng)用。

            Wow,原來它的原理so easy!

            在大多數(shù)片段分析應(yīng)用中,待分析的未知DNA片段使用熒光標(biāo)記的引物,通過PCR生成熒光標(biāo)記的PCR產(chǎn)物并與分子量標(biāo)準(zhǔn)品混合。分子量標(biāo)準(zhǔn)品是使用與未知片段不同的熒光染料標(biāo)記的已知大小的DNA片段混合物。

             

            隨后,使用熱循環(huán)儀對(duì)該樣品進(jìn)行變性處理,我們推薦使用“Veriti"熱循環(huán)儀,再將樣品放在基因分析儀中進(jìn)行分析。當(dāng)已知和未知的DNA片段混合物進(jìn)樣到基因分析儀中,在毛細(xì)管遷移時(shí)會(huì)根據(jù)片段大小進(jìn)行分離,較小的片段移動(dòng)較快,而較大的片段移動(dòng)較慢。

             

            系統(tǒng)照相機(jī)根據(jù)所使用的染料對(duì)每個(gè)標(biāo)記片段進(jìn)行檢測(cè),所產(chǎn)生的熒光信號(hào)會(huì)生成一個(gè)峰,然后,使用GeneMapper軟件分析電泳圖中的峰。根據(jù)分子量標(biāo)記物中每個(gè)已知DNA片段的分子量及其對(duì)應(yīng)的遷移時(shí)間,生成分子量標(biāo)準(zhǔn)曲線,該曲線可用于精確確定未知片段的大小。

             

            它的優(yōu)勢(shì),您get了嗎?

            基因分析儀進(jìn)行片段分析的一個(gè)非常大的優(yōu)勢(shì),是它的多重分析能力。當(dāng)您想要分析不同大小范圍的DNA片段時(shí),這些片段可用相同的染料標(biāo)記并在毛細(xì)管中進(jìn)行分離。然后再進(jìn)行單獨(dú)檢測(cè),這些都沒有問題。但是當(dāng)片段的分子量范圍重疊或者部分重疊時(shí),您將無法分辨哪個(gè)峰對(duì)應(yīng)哪個(gè)片段,這就需要熒光多重分析能力。使用基因分析儀可以同時(shí)檢測(cè)多個(gè)染料。因此,您可以使用不用染料標(biāo)記大小范圍相近的DNA片段。這些片段大小和熒光標(biāo)記組合實(shí)現(xiàn)高水平的多重化,使您能夠在單次遷移中分析多個(gè)片段。

            使用基因分析儀進(jìn)行片段分析的另一個(gè)優(yōu)勢(shì),在于可實(shí)現(xiàn)的靈敏度。且不說您可以使用任何類型的DNA模板,您甚至可以使用血斑或者FFPE這樣難分析的樣品。與測(cè)序不同,大部分片段分析應(yīng)用不需要在電泳前進(jìn)行復(fù)雜的樣品制備和純化。而且,由于根據(jù)分子量大小進(jìn)行結(jié)果確定,所以數(shù)據(jù)解讀非常簡(jiǎn)單。您可以在基因分析儀上運(yùn)行多種片段分析應(yīng)用,并且不需要預(yù)先知道DNA序列。您還可以在相關(guān)定量應(yīng)用中使用峰強(qiáng)度測(cè)量。

            您只需要加入一點(diǎn)創(chuàng)造力,就可以隨時(shí)開發(fā)一款自定義片段分析應(yīng)用。

             

             

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