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            上海乾思生物科技有限公司
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            半定量RT-PCR技術(shù)服務(wù)|實驗技術(shù)服務(wù)

            時間:2015/5/15閱讀:572
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            關(guān)鍵詞:半定量RT-PCR技術(shù)服務(wù)|實驗技術(shù)服務(wù)
            簡介:世界*品牌半定量RT-PCR技術(shù)服務(wù)|實驗技術(shù)服務(wù)原裝,質(zhì)量保證,*。
            半定量RT-PCR技術(shù)服務(wù)|實驗技術(shù)服務(wù)——pCzn1質(zhì)粒+Arctic Express宿主菌低溫表達體系。
            我們具備豐富的蛋白表達設(shè)計經(jīng)驗及實驗操作技巧,承諾客戶不成功不收費。在獲得重組蛋白產(chǎn)品的同時,我們也會提供相應(yīng)的原始數(shù)據(jù)和原始圖片,不需要再額外花費精力重復(fù)實驗。另一方面,我們所有的實驗數(shù)據(jù)真實可信,我們提供原始的表達菌株和克隆質(zhì)粒,客戶可以依據(jù)我們的實驗報告重復(fù)我們的實驗結(jié)果。
            產(chǎn)品品牌:   http://www.。。com/goodsid/fenleiyi/2868603/1.html    
            測序?qū)嶒灹鞒蹋?br>半定量RT-PCR參照的做法一般有兩種:
            1) 將要比較的兩個樣品的BETA-ACTIN 調(diào)成一樣的亮度,然后就可以直接比較目的基因的亮度了。方法的結(jié)果比較直觀,但較費事。
            2) 不進行調(diào)平,一個樣品里將目的基因和BETA-ACTIN直接比較,用軟件就可以做到,然后將不同樣品的這個比值進行比較就可以了。方法比較簡單,但結(jié)果不夠直觀。
            1.每個標本都要做自己的內(nèi)參,不能用同一個內(nèi)參!
            2.每個標本在實際做前都要摸*循環(huán)數(shù),包括內(nèi)參,但內(nèi)參的循環(huán)數(shù)不一定要和目的基因一樣,都要選擇上升期的中間數(shù)作為*循環(huán)數(shù),否則進入平臺期就沒有可比性了!所以內(nèi)參要有它自己的*循環(huán)數(shù)!
            3.電泳掃描后,計算灰度值,先用同一標本的內(nèi)參和目的進行比較,然后用這個相對值再去和其他你所要比較的平行組進行比較,一般每組4個樣本以上。
            1 樣品RNA的抽提
            ①取凍存已裂解的細胞,室溫放置5分鐘使其*溶解。
            ②兩相分離 每1ml的TRIZOL試劑裂解的樣品中加入0.2ml的氯仿,蓋緊管蓋。手動劇烈振蕩管體15秒后,15到30℃孵育2到3分鐘。4℃下12000rpm離心15分鐘。離心后混合液體將分為下層的紅色酚氯仿相,中間層以及無色水相上層。RNA全部被分配于水相中。水相上層的體積大約是勻漿時加入的TRIZOL試劑的60%。
            ③RNA沉淀 將水相上層轉(zhuǎn)移到一干凈無RNA酶的離心管中。加等體積異丙醇混合以沉淀其中的RNA,混勻后15到30℃孵育10分鐘后,于4℃下12000rpm 離心10分鐘。此時離心前不可見的RNA沉淀將在管底部和側(cè)壁上形成膠狀沉淀塊。
            ④RNA清洗 移去上清液,每1mlTRIZOL試劑裂解的樣品中加入至少1ml的75%乙醇(75%乙醇用DEPCH2O配制),清洗RNA沉淀?;靹蚝?,4℃下7000rpm離心5分鐘。
            ⑤RNA干燥 小心吸去大部分乙醇溶液,使RNA沉淀在室溫空氣中干燥5-10分鐘。
            ⑥溶解RNA沉淀 溶解RNA時,先加入無RNA酶的水40μl用槍反復(fù)吹打幾次,使其*溶解,獲得的RNA溶液保存于-80℃待用。
            2 RNA質(zhì)量檢測
            1)紫外吸收法測定
            先用稀釋用的TE溶液將分光光度計調(diào)零。然后取少量RNA溶液用TE稀釋(1:100)后,讀取其在分光光度計260nm和280nm處的吸收值,測定RNA溶液 濃度和純度。
            ① 濃度測定
            A260下讀值為1表示40 μg RNA/ml。樣品RNA濃度(μg/ml)計算公式為:A260 ×稀釋倍數(shù)× 40 μg/ml。具體計算如下:
            RNA溶于40 μl DEPC水中,取5ul,1:100稀釋至495μl的TE中,測得A260 = 0.21
            RNA 濃度= 0.21 ×100 ×40 μg/ml = 840 μg/ml 或 0.84 μg/μl
            取5ul用來測量以后,剩余樣品RNA為35 μl,剩余RNA總量為:
            35 μl × 0.84 μg/μl = 29.4 μg
            ②純度檢測
            RNA溶液的A260/A280的比值即為RNA純度,比值范圍1.8到2.1。
            2)變性瓊脂糖凝膠電泳測定
            ①制膠
            1g瓊脂糖溶于72ml水中,冷卻至60℃,10 ml的10× MOPS電泳緩沖液和18 ml的37% 甲醛溶液(12.3 M)。
            10×MOPS電泳緩沖液
            濃度  成分
            0.4M  MOPS,pH 7.0
            0.1M  乙酸鈉
            0.01M  EDTA
            灌制凝膠板,預(yù)留加樣孔至少可以加入25 μl溶液。膠凝后取下梳子,將凝膠板放入電泳槽內(nèi),加足量的1×MOPS電泳緩沖液至覆蓋膠面幾個毫米。
            ②準備RNA樣品
            取3μgRNA,加3倍體積的甲醛上樣染液,加EB于甲醛上樣染液中至終濃度為10μg/ml。加熱至70℃孵育15分鐘使樣品變性。
            ③電泳
            上樣前凝膠須預(yù)電泳5min,隨后將樣品加入上樣孔。5–6V/cm電壓下2h,電泳至溴酚蘭指示劑進膠至少2–3cm。
            3,待測樣品的待測基因?qū)崟r定量PCR
            ①所有cDNA樣品分別配置實時定量 PCR反應(yīng)體系。
            體系配置如下:
            序號  反應(yīng)物  劑量
            1  SYBR Green 1 染料   10 ul
            2  上游引物  1ul
            3  下游引物  1ul
            4  dNTP   1ul
            5  Taq聚合酶  2ul
            6  待測樣品cDNA  5ul
            7  ddH2O   30ul
            8  總體積  50 ul
            輕彈管底將溶液混合,6000rpm短暫離心。
            ②將配制好的PCR反應(yīng)溶液置于Realtime PCR儀上進行PCR擴增反應(yīng)。反應(yīng)條件為:93℃2分鐘預(yù)變性,然后按93℃ 1分鐘,55℃1分鐘,72℃1分鐘,共40做個循環(huán),zui后72℃7分鐘延伸。
            4, 實時定量PCR使用引物列表
            引物設(shè)計軟件:Primer Premier 5.0,并遵循以下原則:引物與模板的序列緊密互補;引物與引物之間避免形成穩(wěn)定的二聚體或發(fā)夾結(jié)構(gòu);引物不在模板的非目的位點引發(fā)DNA 聚合反應(yīng)(即錯配)。

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