如何選擇合適的宿主菌:
1、所選的宿主菌株應對所用質(zhì)粒的抗生素抗性基因敏感。
2、如進行藍/白斑篩選,宿主菌β-半乳糖苷酶的α-肽編碼區(qū)應在染色體或附加體上缺失掉( lac Z Δ Μ15)。*0和DH5α
都能用于藍/白斑篩選。
3、要表達重組蛋白,可使用帶有可誘導的T7 RNA聚合酶基因的菌株,如BL21(DE3)和BL21(DE3)pLysS。
4、使用pGEM載體克隆大片段時(>7-8 kb),經(jīng)轉化的菌株在30℃而不是在37℃生長,更有利于復蘇。作簡單的亞克隆連接實驗,亞克隆轉化效率的感受態(tài)細胞就可滿足克隆需要,更高轉化效率的感受態(tài)細胞可用于作比較困難的克隆實驗。為提高獲得目的克隆的機會,應用盡可能高轉化效率的感受態(tài)細胞(>10 8 cfu/μg DNA)。
如何篩選重組菌落:
1、可使用藍/白斑篩選法,在涂布有IPTG和X-Gal的篩選平板上,重組菌株為白色,未轉入重組質(zhì)粒的菌株為藍色。
2、可對小量提取的質(zhì)粒DNA做限制性酶切,采用Solarbio公司的質(zhì)粒提取試劑盒,可快速提取多個樣本,而且由于提取的質(zhì)粒純度高,不會有酶切切不開影響實驗的情況。
3、也可直接用細菌菌落進行PCR反應,篩選存在目的片段的重組菌落。Solarbio公司生產(chǎn)的PCR反應系統(tǒng)(MasterMix系列產(chǎn)品)特別適合這種方法。用滅菌的吸頭挑取單個菌落到已加入MasterMix的PCR管中,加入特異引物,進行PCR擴增。擴增反應前在94℃變性5分鐘,有利于細菌的裂解,提高PCR產(chǎn)物擴增的成功率。將所得PCR產(chǎn)物在瓊脂糖凝膠上檢測擴增帶。
4、另一種篩選重組菌落的方法是用插入片段特異引物進行菌落雜交。菌落生長后轉移到固體支持物如硝酸纖維膜上,作原位裂解,使質(zhì)粒附著到膜上,然后用核酸引物作雜交。多用于篩選稀有克隆菌落。
如何檢測感受態(tài)細胞的效價:
為確定感受態(tài)細胞的轉化效率,可將一定量的超螺旋質(zhì)粒轉化到感受態(tài)細胞中,取一部分轉化的細菌,涂布到選擇培養(yǎng)基上,可用菌落生長單位/μg DNA,按下面的方法計算感受態(tài)細胞的轉化效率。
計算公式:轉化效率=產(chǎn)生菌落的總數(shù)/鋪板DNA的總量
例如:取1μl(0.1 ng/μl)超螺旋質(zhì)粒轉化100μl的感受態(tài)細胞。
向轉化反應液中加入900μl培養(yǎng)液,讓細菌恢復一小段時間,取100μl鋪板,培養(yǎng),產(chǎn)生1000個菌落。
轉化0.1 ng DNA,用SOC稀釋到1000μl后,取1/10涂平板,則涂平板共用0.01 ng質(zhì)粒DNA,所以轉化率=1000克隆/0.01 ng DNA
=10 5 cfu/ng=10 8 cfu/μg。
轉化效率1×10 6 cfu/μg DNA可滿足普通的亞克隆實驗;1×10 7cfu/μg DNA用于作更復雜的亞克隆,有*的DNA的轉化,T-克隆實驗;構建文庫和突變要求用的轉化的效率為>1×10 8 cfu/μg DNA。
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