高內(nèi)涵在模式生物中的應(yīng)用(二)
高內(nèi)涵系統(tǒng)不僅僅適用于各種各樣的細(xì)胞模型,對(duì)各種小型的模式生物也非常友好,通過(guò)將這些模式生物放在微孔板中,我們就可以用高內(nèi)涵系統(tǒng)來(lái)拍攝和分析它們。本期,我們將繼續(xù)介紹高內(nèi)涵與這些模式生物的故事。
擬南芥
擬南芥為兩年生草本,一般可長(zhǎng)到7-40厘米,是植物學(xué)為常見(jiàn)的模式生物。其幼苗、根、莖、葉、原生質(zhì)體均可在高內(nèi)涵上進(jìn)行自動(dòng)成像和分析。
實(shí)驗(yàn)一
高內(nèi)涵用于研究活體擬南芥全葉組織中膜運(yùn)輸?shù)恼{(diào)節(jié),40倍水浸式物鏡對(duì)擬南芥葉片進(jìn)行多層掃描,使用高內(nèi)涵分析軟件Harmony識(shí)別膜泡轉(zhuǎn)運(yùn)體,統(tǒng)計(jì)其數(shù)目、熒光強(qiáng)度、定位等參數(shù)[2](如下圖)。
秀麗隱桿線蟲(chóng)
秀麗隱桿線蟲(chóng)在遺傳與發(fā)育生物學(xué)、行為與神經(jīng)生物學(xué)、衰老與壽命、人類(lèi)遺傳性疾病都有非常重要的貢獻(xiàn),成蟲(chóng)體長(zhǎng)為1mm,通身透明。一般首先對(duì)秀麗線蟲(chóng)進(jìn)行麻醉,再進(jìn)行高內(nèi)涵拍攝。
實(shí)驗(yàn)一
分析不同藥物處理后秀麗線蟲(chóng)的數(shù)量和熒光強(qiáng)度,10倍物鏡拍攝多個(gè)視野,高內(nèi)涵分析軟件Harmony識(shí)別不同線蟲(chóng),計(jì)數(shù)并分析線蟲(chóng)的熒光強(qiáng)度[3](如下圖)。
小型藻類(lèi)
藻類(lèi)的生長(zhǎng)、繁殖與水體環(huán)境密切相關(guān),常作為水體污染指示物,用于對(duì)水體的實(shí)時(shí)監(jiān)測(cè)中。小型藻類(lèi)可放置于微孔板中,通過(guò)離心使其貼底,從而進(jìn)行高內(nèi)涵的拍攝,根據(jù)研究?jī)?nèi)容不同,一般采用20倍-63倍水浸式物鏡進(jìn)行成像。很多研究中通過(guò)對(duì)葉綠體的成像來(lái)判斷藻類(lèi)的狀態(tài),成像過(guò)程需要設(shè)置針對(duì)葉綠素自發(fā)熒光特殊的檢測(cè)方法,即通過(guò)設(shè)定激發(fā)光和發(fā)射光,定義一個(gè)新的通道(excitation 460-490nm,emission 655-705nm)。
實(shí)驗(yàn)一
藻類(lèi)用于檢測(cè)水質(zhì)污染,本研究中,模擬微塑料水質(zhì)污染,檢驗(yàn)裸藻的生長(zhǎng)狀態(tài),采用20倍水浸式物鏡(NA 1.0) 進(jìn)行成像,綠色為微塑料,紅色為葉綠素。(如下圖)
生長(zhǎng)狀態(tài)不好的裸藻葉綠素?zé)晒鈴?qiáng)度減弱,形態(tài)發(fā)生變化。(如下圖)
左圖為Harmony軟件識(shí)別裸藻細(xì)胞,中間圖為通過(guò)形態(tài)區(qū)分形態(tài)正常的梭狀裸藻(紅色)和因毒性變圓的裸藻(綠色),右圖為通過(guò)熒光強(qiáng)度區(qū)分死亡裸藻(綠色)和存活裸藻(紅色)。
參考文獻(xiàn)
2.High-throughput confocal imaging of intact live tissue enables quantification of membrane trafficking in Arabidopsis. Plant Physiol. 2010 Nov;154(3):1096-104. doi: 10.1104/pp.110.160325. Epub 2010 Sep 14.
3.Expanding the Biological Application of Fluorescent Benzothiadiazole Derivatives: A Phenotypic Screening Strategy for Anthelmintic Drug Discovery Using Caenorhabditis elegans. SLAS Discov. 2019 Aug;24(7):755-765. doi: 10.1177/2472555219851130. Epub 2019 Jun 10.
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