核酸變性預(yù)制膠在分離片段DNA分子時效果很好,分辨率很高,甚至相差1bp的DNA的片段都能分開,一個標(biāo)準(zhǔn)點樣孔中可以容納相對大量的DNA。所以常被用于蛋白印跡實驗、遺傳圖譜構(gòu)建、數(shù)量形狀基因定位、標(biāo)記輔助選擇等生物多樣性研究等。
核酸變性預(yù)制膠的操作步驟:
一、非變性預(yù)制膠:
1、準(zhǔn)備樣品:將樣品和loadingbuffer(5×)按照4:1混合均勻。
2、準(zhǔn)備1×runningbuffer:取200ml的5×TBEbuffer,加入去離子水至1L,制備成1×TBEbuffer。
3、將預(yù)制膠裝入兼容的電泳槽中,加入電泳緩沖液,再緩慢地將梳子拔出。
4、上樣:在梳孔內(nèi)加入適當(dāng)濃度和體積的DNA樣品。
5、電泳條件:150V,50~75min(電泳時間取決于凝膠濃度)
6、電泳結(jié)束,取出凝膠。
二、尿素變性預(yù)制膠:
1、準(zhǔn)備樣品:將樣品和UREA-TBEloadingbuffer(5×)按照4:1混合均勻,100℃下加熱3-5min。
2、準(zhǔn)備1×runningbuffer:取200ml的5×TBEbuffer,加入去離子水至1L,制備成1×TBEbuffer。
3、將核酸變性預(yù)制膠裝入兼容的電泳槽中,加入電泳緩沖液,再緩慢地將梳子拔出。
4、上樣:用1×TBEbuffer反復(fù)沖洗梳孔以清除梳孔內(nèi)的尿素,在梳孔內(nèi)加入適當(dāng)濃度和體積的DNA樣品。
5、電泳條件:150V,50~75min(電泳時間取決于凝膠濃度)
6、電泳結(jié)束,取出凝膠。
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