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            干貨分享--WB實驗問題總結與處理方案(三)

            來源:西安昊興生物科技有限公司   2021年07月27日 15:22  

            41、跑電泳的時候配的膠總是“縮”是什么原因呢?是有的成分不對嗎?

            答:沒什么問題,就是你膠里的水分被蒸發(fā)了。過夜時拿保鮮膜包起來,在里面加點水保持濕度就可以了;也可能母液(30%聚丙酰胺)有問題,你可以重新配制一份觀察;能夠替換的試劑,盡量換一下,選用好的試劑。

             

            42、蛋白質的分子量跨度很大,如要分離小21KD,中至66KD,大至170KD,可以一次做好嗎?

            答:這么廣的分布不好轉移,一般建議:21kd66kd可以一起轉,12SDS-PAGE 濕轉120mA, 45-60min就可以了, 可以根據(jù)你實驗室的經(jīng)驗調節(jié);170kd 7%SDSPAGE,200mA 90-120min

             

            43、不能很好地將大分子量蛋白轉移到膜上, 轉移效率低怎么樣解決?

            答:可以考慮:轉移緩沖液中加入20%甲醇(是指終濃度),因為甲醇可降低蛋白質洗脫效率,但可增加蛋白質和PVDF膜的結合能力,甲醇可以防止凝膠變形,甲醇對高分子量蛋白質可延長轉移時間;轉移緩沖液加入終濃度0.1%SDS,也是為了增加轉移效率;用優(yōu)質的轉移膜,或使用小孔徑的PVDF膜(0.2微米)。

             

            44、我用的是可視marker,但是電泳總跑不全8條帶,請問什么原因?怎樣改善?膠用過8%,10%,12%,都是這樣。marker是新買的。

            答:一般來說,是小分子量Marker跑走了,增加膠濃度或減少電泳時間試試看。當然梯度膠也是不錯的選擇。

             

            45、是否Western Blot實驗半定量一定要加ACTIN內參?

            答:半定量實驗需要有內參。

             

            46、核內抗原Western Blot內參選擇什么合適?

            答:可以選用組蛋白,組蛋白在細胞核中的表達是很穩(wěn)定的,有很多都可以當成內參,在網(wǎng)上查查就可以選出你要的內參。

             

            47、做半定量Western Blot,內參β-actin,GAPDH哪個好?

            答:兩者均可。

             

            48、想問一下細胞裂解液選擇蛋白酶抑制劑時有什么原則嗎?受不受組織來源的影響?胞膜和胞漿有區(qū)別嗎?

            答:一般來說提取時加入廣譜的蛋白酶抑制劑就可以了,操作時保持低溫。除非有文獻特別指明用特殊的方法,一般來說都沒有區(qū)別。

             

            49、轉膜后的脫脂奶粉封閉液是5%TBST脫脂奶粉”,其中TBST最后那個TTween嗎,濃度多大?

            答:是Tween,配方如下:Tris-Buffered Saline Tween-20 (TBST), NaCl8g Tris base2.42g 加水 800ml溶解, 500-1000ul Tween-20, HCl 調節(jié)pH 7.4, 加水定容至 1L

             

            50、封閉,一抗,二抗時的溫度有沒有什么規(guī)定呢,比如在室溫里做,或者要在4度下?

            答:均可在室溫進行,如果時間不夠,一抗孵育可以先在室溫進行一個小時,然后4度過夜。

             

            51、請問一下PVDF膜和硝酸膜結合蛋白的原理是什么?

            答:一般而言,硝酸纖維素膜是通過疏水作用來和蛋白質相聯(lián),這樣的話,反復洗幾次后,蛋白容易掉下來,結果較差。PVDF膜主要通過它膜上的正電荷和蛋白接合,同時也有疏水作用,但相對較弱。這樣的話,PVDF膜和蛋白接合較牢,不易脫落,結果較好。

             

            52、怎樣才能把膠跑的非常漂亮,泳道都能很直,上樣的量和灌膠是否很重要,電壓有什么要求?

            答:影響跑膠跑的質量,有以下幾個因素:

            1)電壓,小的電壓會使膠的分子篩效應得到充分發(fā)揮。電壓越小,條帶越漂亮,濃縮膠55v,分離膠75v就能跑得很好。

            2)膠的均勻度,膠越均勻,條帶越窄,分離越均勻。倒膠之前,一定要充分混勻,玻璃板一定要干凈,雙蒸水隔離時,一定要比較輕地加上去,避免稀釋上層的分離膠.

             

            53、為什么提高大分子量蛋白的轉移的時候,小分子量蛋白會丟失一些哪?什么原因?

            答:小分子的蛋白在轉移過程中,會透過膜去,所以大分子的上去以后,有一部分小分子的就透過去了。

             

            54.電泳中常出現(xiàn)的一些現(xiàn)象:

            ●︶ 條帶呈笑臉狀

            原因:凝膠不均勻冷卻,中間冷卻不好; 電泳系統(tǒng)溫度偏高。

            ●︵ 條帶呈皺眉狀

            原因:可能是由于裝置不合適,特別可能是凝膠和玻璃擋板底部有氣泡,或者兩邊聚合不*。

            ●拖尾

            原因:樣品溶解不好。

            ●紋理(縱向條紋)

            原因:樣品中含有不溶性顆粒。

            ●條帶偏斜

            原因:電極不平衡或者加樣位置偏斜。

            ●條帶兩邊擴散

            原因:加樣量過多。

             

            55Western blot結果中背景較高

            可能的原因及建議:

            ●膜封閉不夠

            延長封閉的時間;選擇更加適合的封閉液。

            ●一抗稀釋度不適宜

            對抗體進行滴度測試,選擇最適宜的抗體稀釋度。

            ●一抗孵育的溫度偏高

            建議4℃結合過夜。

            ●選擇的膜容易產(chǎn)生高背景

            一般硝酸纖維素膜的背景會比PVDF膜低。

            ●膜在實驗過程中干過

            實驗過程中要注意保持膜的濕潤。

            ●檢測時曝光時間過長

            減少曝光時間。

             

            56Western blot結果中雜帶較多

            可能的原因及建議:

            ●目的蛋白有多個修飾位點(磷酸化位點、糖基化位點、乙酰化位點等),本身可以呈現(xiàn)多條帶。

            查閱文獻或進行生物信息學分析,獲得蛋白序列的修飾位點信息,通過去修飾確定蛋白實際大小。

            ●目的蛋白有其它剪切本

            查閱文獻或生物信息學分析可能性。

            ●樣本處理過程中目的蛋白發(fā)生降解

            加入蛋白酶抑制劑;樣本處理時在冰上操作。

            ●上樣量過高,太敏感

            適當減少上樣量。

            ●一抗特異性不高

            重新選擇或制備高特異性的抗體。

            ●一抗不純

            純化抗體

            ●一抗或者二抗?jié)舛绕?/span>

            降低抗體濃度。

             

            57 . Western blot結果中無信號或顯示信號弱

            可能的原因及建議:

            ●檢測樣本不表達目的蛋白

            選擇表達量高的細胞作為陽性對照,用于確定檢測樣本是否為陰性。

            ●檢測樣本低表達目的蛋白

            提高上樣量,裂解液中注意加入蛋白酶抑制劑。

            ●轉移不*或過轉移

            可以用麗春紅染膜并結合染膠(考馬斯亮藍)后確定條帶是否轉至膜上或轉移過頭;適當調整轉膜的時間和電流。

            ●抗體不能識別測試種屬的相關蛋白

            購買抗體前應當認真閱讀抗體說明書,確定其是否能夠交叉識別測試種屬的對應蛋白。

            ●一抗孵育時間不足

            建議4℃結合過夜。

            ●二抗與一抗不匹配

            選擇針對一抗來源的種屬的抗體。

            ●洗膜過度

            洗膜時間不宜過長,加入的去垢劑不宜過強或過多,建議使用0.1%的弱去垢劑Tween-20。

             

            58. 其它現(xiàn)象:

            ●膜上多處出現(xiàn)黑點或黑斑

            原因:抗體與封閉試劑發(fā)生非特異性的結合。

            ●反白(條帶顯白色)

            原因:目的蛋白含量太高或者一抗?jié)舛绕摺?/span>

            ●蛋白分子量偏低或偏高

            原因:膠濃度不適合,高分子量要用低濃度膠;小分子蛋白要用高濃度膠。

             

            59.安全問題:

            操作有毒試劑時,帶手套,且操作揮發(fā)性試劑應在通風櫥中進行。


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