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            漲知識 | 克隆專題五:分子克隆轉(zhuǎn)化方法

            來源:翌圣生物科技(上海)股份有限公司   2023年11月15日 10:28  

             


            克隆技術(shù),又稱為“生物放大技術(shù)”,目前應(yīng)用泛的技術(shù)為“分子克隆”,即通過重組技術(shù)將目的DNA片段按照人們的設(shè)計定向連接起來,在特定的受體細(xì)胞中與載體同時復(fù)制并得到表達(dá),產(chǎn)生新的遺傳性狀的技術(shù)。

             

            大部分的分子克隆方法,諸如傳統(tǒng)分子克隆、TA克隆、Gatway克隆、TOPO克隆、無縫克隆等都繞不開目的片段制備、載體制備、連接、轉(zhuǎn)化、篩選等等步驟。其中,轉(zhuǎn)化是分子克隆的關(guān)鍵步驟,其目的是產(chǎn)生重組DNA質(zhì)粒的多個拷貝。接下來小翌就具體解析一下重組質(zhì)粒轉(zhuǎn)化至宿主細(xì)胞的過程,為您的實(shí)驗提供好方法。

             

            轉(zhuǎn)化是細(xì)菌細(xì)胞低頻率吸收外界DNA的自然過程,在分子生物學(xué)實(shí)驗中,用于在專門為吸收DNA而制備的“感受態(tài)”細(xì)菌內(nèi)增殖質(zhì)粒。在轉(zhuǎn)化過程中,質(zhì)粒DNA被引入到適當(dāng)?shù)木曛?,以便菌株可以?fù)制目標(biāo)序列,用于后續(xù)進(jìn)一步的分析或操作。轉(zhuǎn)化通常包括化學(xué)轉(zhuǎn)化法和電轉(zhuǎn)化法。

             

            01

            化學(xué)轉(zhuǎn)化法(CaCl2

            化學(xué)轉(zhuǎn)化是分子克隆實(shí)驗中的方法。該方法在1970年由Mandel和Hige發(fā)現(xiàn),研究表明大腸桿菌細(xì)胞經(jīng)CaCl2溶液處理時能夠吸收λ噬菌體DNA。原理是利用理化方法誘導(dǎo)細(xì)胞,改變細(xì)胞膜狀態(tài),增強(qiáng)細(xì)胞膜的通透性,細(xì)胞膜表面性狀發(fā)生暫時性改變,方便外源基因或者載體進(jìn)入受體細(xì)胞,這種處于最適攝取和容納外來DNA狀態(tài)的細(xì)胞稱為感受態(tài)細(xì)胞(competent cell)。感受態(tài)細(xì)胞是基因克隆和蛋白表達(dá)所的工具。市面上就能提供可實(shí)現(xiàn)高效、可靠轉(zhuǎn)染的感受態(tài)細(xì)胞。

             

             
            其核心步驟主要分為三步
             
             

            ①質(zhì)粒DNA進(jìn)入細(xì)胞;

            ②細(xì)胞恢復(fù);

            ③細(xì)胞接種培養(yǎng)。

             

            可根據(jù)下游應(yīng)用的不同,選擇不同的感受態(tài)細(xì)胞,如表1所示,常見的有翌圣DH5α化學(xué)感受態(tài)(Cat#11802ES)、化學(xué)感受態(tài)(Cat#11801ES)BL21(DE3)化學(xué)感受態(tài)(Cat#11804ES)、根癌農(nóng)桿菌感受態(tài)等。

             

            表1.感受態(tài)菌株的選擇

            菌株

            特點(diǎn)

            用途

            DH5α

            一種常用于質(zhì)??寺〉木辍H笔Ш怂醿?nèi)切酶(endA),提高了質(zhì)粒DNA的產(chǎn)量和質(zhì)量;重組酶缺陷型(recA)減少插入片段的同源重組率,保證了插入DNA的穩(wěn)定性;lacZΔM15的存在使得DH5α可用于藍(lán)白斑篩選。

            構(gòu)建克隆,

            質(zhì)粒提取,

            藍(lán)白斑篩選


            生長速度快(比DH5α快),10小時可見克隆,recA1和endA1的突變有利于插入DNA的穩(wěn)定和高純度質(zhì)粒DNA的提取。

            構(gòu)建克隆,

            質(zhì)粒提取,

            藍(lán)白斑篩選

            BL21(DE3)

            用于以T7 RNA聚合酶為表達(dá)系統(tǒng)的高效蛋白表達(dá)宿主,可同時表達(dá)T7 RNA聚合酶和大腸桿菌RNA聚合酶,用于pET系列,pGEX、pMAL等質(zhì)粒的蛋白表達(dá)。

            非毒性蛋白的表達(dá)

             

            翌圣利用改良的生產(chǎn)菌株,采用嚴(yán)格的生產(chǎn)工藝,制備了高效、穩(wěn)定、適用性廣的高效感受態(tài)細(xì)胞,其批次間穩(wěn)定性強(qiáng),轉(zhuǎn)化效率高(>108 cfu/μg),無雜菌污染,無抗性偏好。廣泛適用于高效的DNA克隆和質(zhì)粒擴(kuò)增,能保證高拷貝質(zhì)粒的穩(wěn)定遺傳,適用于藍(lán)白斑篩選。

             

            圖1. 翌圣、DH5α和BL21三種感受態(tài)不同批次的轉(zhuǎn)化效率穩(wěn)定

             

            為了加快感受態(tài)轉(zhuǎn)化的流程,市面上也有應(yīng)運(yùn)而生的快速感受態(tài),如翌圣F DH5α化學(xué)感受態(tài)(Cat#11803ES),與傳統(tǒng)的感受態(tài)相比,轉(zhuǎn)化效率高,轉(zhuǎn)化時間短,僅需10 min就能完成轉(zhuǎn)化過程,省去了熱激、復(fù)蘇等步驟,更加高效快速。

             

            圖2.感受態(tài)轉(zhuǎn)化流程

             

            02

            電擊法

            電擊法是通過電脈沖迅速打開細(xì)胞膜上按觸外界的通道,引導(dǎo)外源基因轉(zhuǎn)入細(xì)胞中,即通過施加電流來改變物質(zhì)化學(xué)性質(zhì)的方法。將待轉(zhuǎn)化的DNA溶解于受體細(xì)胞懸浮液中,然后加入電擊轉(zhuǎn)化儀的樣品槽內(nèi),兩端施加瞬時高壓電場,使細(xì)胞膜產(chǎn)生細(xì)小的縫隙,此時DNA片段便可不經(jīng)過胞飲作用直接進(jìn)入受體細(xì)胞。電擊法常用于對磷酸鈣共沉淀法無效的細(xì)胞類型,如生長在懸浮液中的淋巴細(xì)胞等。電擊法的優(yōu)勢是操作簡單,成本低廉,沒有基因毒性,但需要電擊杯、電轉(zhuǎn)儀器,且存在轉(zhuǎn)化效率低的問題。
             
            除了通用的轉(zhuǎn)化法,質(zhì)粒DNA還能通過其他方法轉(zhuǎn)化至細(xì)胞中,包括PEG法轉(zhuǎn)化、根癌農(nóng)桿菌介導(dǎo)法等。

             

            03

            PEG介導(dǎo)法

            PEG介導(dǎo)法為高國楠,該方法是通過PEG(細(xì)胞融合劑)將外源基因轉(zhuǎn)入原生質(zhì)體中。PEG(Cat#60304ES作為細(xì)胞融合劑,可通過引起細(xì)胞膜表面電荷的紊亂,干擾細(xì)胞間的識別,從而有利于細(xì)胞間融合和外源DNA分子進(jìn)入原生質(zhì)體。碳酸鈣可與DNA結(jié)合形成DNA-碳酸鈣復(fù)合物而被原生質(zhì)體攝入。PEG法的優(yōu)勢在于其操作簡單,但存在原生質(zhì)體制備限制、轉(zhuǎn)化效率低的問題。

             

            04

            根癌農(nóng)桿菌介導(dǎo)法

            根癌農(nóng)桿菌介導(dǎo)法(ATMT)是通過根癌農(nóng)桿菌侵染細(xì)胞,將其攜帶的T DNA質(zhì)粒插入細(xì)胞中。研宄表明根癌農(nóng)桿菌的轉(zhuǎn)化效率受到啟動子、受體材料、根癌農(nóng)桿菌菌株、共培養(yǎng)溫度、共培養(yǎng)時間等因素的影響。轉(zhuǎn)化技術(shù)往往對儀器設(shè)備要求高,操作復(fù)雜,轉(zhuǎn)化效率低。根癌農(nóng)桿菌介導(dǎo)法具有可選擇的受體材料范圍廣,對儀器設(shè)備要求低,轉(zhuǎn)化效率高,操作簡單等特點(diǎn)。翌圣乙酰丁香酮(Cat#60326ES)能誘導(dǎo)根癌農(nóng)桿菌Ti質(zhì)粒和發(fā)根農(nóng)桿菌Ri質(zhì)粒攜帶的VirA基因的活化和高效表達(dá),從而啟動其他Vir基因表達(dá),切割下質(zhì)粒上的一段T-DNA單鏈,促進(jìn)其轉(zhuǎn)化和整合入寄主植物基因組內(nèi)。目前普遍應(yīng)用于農(nóng)桿菌介導(dǎo)的遺傳轉(zhuǎn)化研究中。
             
            通過轉(zhuǎn)化反應(yīng),重組DNA質(zhì)粒已轉(zhuǎn)化至宿主細(xì)胞中,接下來就來到了分子克隆的最后一步——陽性轉(zhuǎn)化子的篩選。即把要轉(zhuǎn)化的細(xì)胞置于含有適量抗生素的瓊脂板上,通過藍(lán)白斑或其它方法篩選含有所需質(zhì)粒及插入片段的菌落。那么篩選步驟中應(yīng)用到的技術(shù)和試劑又有哪些呢?關(guān)注我們,小翌會在下一期的分子克隆技術(shù)專題中給大家具體講解篩選技術(shù),為您的實(shí)驗帶來新的思路與方向,期待下一次的見面~

             

            05

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            產(chǎn)品定位

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            產(chǎn)品貨號

            規(guī)格

            快速感受態(tài)細(xì)胞

            DH5α Fast Chemically Competent Cell F DH5α化學(xué)感受態(tài)

            11803ES80

            10×100 μL

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            0 Chemically Competent Cell 0化學(xué)感受態(tài)細(xì)胞

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