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            上新 | 磁珠法土壤/糞便DNA提取試劑盒,助力宏基因組學(xué)研究

            來(lái)源:翌圣生物科技(上海)股份有限公司   2023年12月13日 18:01  

             


            宏基因組學(xué)是直接研究環(huán)境樣品中的遺傳學(xué)材料,主體研究對(duì)象是微生物群落的基因組,即所有微生物個(gè)體基因組的總和。對(duì)于微生物組學(xué)的研究,最常見(jiàn)的就是通過(guò)高通量測(cè)序技術(shù)對(duì)16SrDNA/18S rDNA/ITS等序列進(jìn)行測(cè)序,從而獲得樣品中的微生物群落組成以及相對(duì)豐度,進(jìn)而揭示環(huán)境樣品中的物種組成,物種多樣性特征,預(yù)測(cè)基因功能信息等。
             

            圖1.宏基因組學(xué)概貌(Berg et al. Microbiome (2020) 8:103)

             

            環(huán)境樣本,比如土壤、糞便、水體等樣本中含有豐富的微生物,但這些樣本成分復(fù)雜;

             

            翌圣生物經(jīng)過(guò)匠心打造,自主研發(fā)出高性能的磁珠法土壤/糞便DNA提取試劑盒,助力宏基因組學(xué)的研究!

             

             

            產(chǎn)品介紹

             
            MolPure® Mag Soil/Stool DNA Kit磁珠法土壤/糞便DNA提取試劑盒(Cat#18526ES)適用于土壤、糞便、水樣、水體濾膜、細(xì)菌、真菌等環(huán)境樣本基因組DNA的提取。采用的磁珠和精心優(yōu)化的緩沖體系,可最大限度的分離純化樣本中的微生物基因組DNA。提取的核酸純度高,質(zhì)量穩(wěn)定可靠,適用于各種下游應(yīng)用實(shí)驗(yàn),如酶切、PCR、建庫(kù)等。配合磁珠法自動(dòng)化提取儀器使用,可實(shí)現(xiàn)核酸的高通量提取。

             

             

            產(chǎn)品特點(diǎn)

             
            • 操作便捷:室溫操作,僅需1h內(nèi)即可回收DNA;

            • 產(chǎn)量高:的研磨珠能高效裂解土壤微生物,釋放更多DNA,最大限度地提高其產(chǎn)量;

            • 適用范圍廣:適合土壤、糞便、水體、濾膜、拭子等環(huán)境樣本;

            • 純度高:有效去除環(huán)境樣本中腐殖酸、重金屬離子等雜質(zhì),適用于各種下游應(yīng)用實(shí)驗(yàn),如酶切法建庫(kù)。

             

             

             

            操作流程

             

            圖2.土壤/糞便DNA提取操作流程圖

             

             

            產(chǎn)品性能

             
            01
            DNA的濃度和純度
             
             
            土壤、糞便、水體樣本,分別用18526ES和競(jìng)品M進(jìn)行DNA提取,其中18526ES搭配翌圣48通道自動(dòng)化核酸提取儀使用,洗脫體積均為70μL,結(jié)果顯示:18526ES相對(duì)競(jìng)品展現(xiàn)出更優(yōu)異的DNA濃度和純度。

             

            圖3.土壤/糞便/水樣DNA的濃度和純度

             

            02
            16S qPCR擴(kuò)增
             
             

            土壤、糞便、水體樣本,分別用18526ES和競(jìng)品M進(jìn)行DNA提取,各取相同體積的DNA溶液進(jìn)行細(xì)菌16S qPCR擴(kuò)增實(shí)驗(yàn),結(jié)果顯示,18526ES提取產(chǎn)物Ct值均小于競(jìng)品M。

             

            圖4 .土壤/糞便/水樣DNA16S qPCR擴(kuò)增結(jié)果

             

            03
            NGS文庫(kù)構(gòu)建分析
             
             

            土壤樣本和糞便樣本,分別用18526ES和競(jìng)品M進(jìn)行DNA提取,各取100ng DNA用翌圣一步法DNA建庫(kù)試劑盒V2(Cat#12195ES)進(jìn)行宏基因組建庫(kù),結(jié)果顯示,18526ES提取的DNA文庫(kù)產(chǎn)量和QC指標(biāo)與競(jìng)品M相當(dāng),微生物種類數(shù)量?jī)?yōu)于競(jìng)品M。

             

            圖5.土壤/糞便DNA文庫(kù)數(shù)據(jù)質(zhì)量

             

             

             

            產(chǎn)品推薦

             

             

            產(chǎn)品名稱

            產(chǎn)品貨號(hào)

            產(chǎn)品規(guī)格

            MolPure® Mag Soil/Stool DNA Kit磁珠法土壤/糞便DNA提取試劑盒

            18526ES20

            20T

            18526ES50

            50T

            18526ES70

            200T

            MolPure® Mag48 SoilStool DNA Kit FA 磁珠法48孔土壤/糞便DNA提取試劑盒FA(預(yù)封裝)

            18528ES48

            48T

             

             

             

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            產(chǎn)品應(yīng)用

            產(chǎn)品名稱

            產(chǎn)品編號(hào)

            磁珠法石蠟包埋組織DNA提取

            MolPure® Magnetic FFPE DNA Kit 

            18371ES

            血漿、血清游離DNA提取

            MolPure® Magnetic Circulating Cell-Free DNA Kit

            18382ES

            拭子樣本病毒DNA/RNA提取

            MolPure® Magnetic Swab Viral DNA/RNA Kit

            18300ES

            磁珠法組織/細(xì)胞總RNA提取

            MolPure® Magnetic Tissue/Cell Total RNA Kit

            18600ES

            磁珠法血液DNA提取

             MolPure® Magnetic M4P1 Blood DNA Kit

            18504ES



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