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            干貨分享 | 一套搞定,小翌助您跑出的電泳圖!

            來源:翌圣生物科技(上海)股份有限公司   2024年01月10日 15:11  

            核酸電泳是進(jìn)行核酸研究的重要手段,是分離、鑒定和純化核酸的主要方法。核酸電泳一般有瓊脂糖凝膠電泳和聚丙烯酰胺凝膠電泳。瓊脂糖凝膠電泳是以瓊脂糖作為支持介質(zhì)的一種電泳方法,常用于DNA切膠回收,DNA分離和用于佐證DNA是否重組、質(zhì)粒是否切開等等,因其分離范圍較廣,在實(shí)驗(yàn)室中應(yīng)用廣泛。

             


             

            操作流程

             

            圖1.核酸電泳操作流程

             

            01

            電泳緩沖液制備

             
             

            電泳緩沖液是核酸凝膠電泳系統(tǒng)的一個(gè)重要組成,主要作用是維持合適的pH,使溶液兩極的pH保持基本不變。且具有一定的導(dǎo)電性,利于核酸分子從負(fù)極遷移到正極。其成分及其離子強(qiáng)度影響物質(zhì)的電泳遷移率,內(nèi)含的EDTA可螯合Mg2+等二價(jià)陽離子,防止電泳時(shí)激活DNA酶及Mg2+與核酸生成沉淀,保護(hù)樣本的理化性質(zhì)不變。

             

            核酸電泳緩沖液分為TAE緩沖液、TEB緩沖液、TPE緩沖液,因?yàn)殡p鏈線狀DNA在TAE的遷移率較其他兩種緩沖液更快,因此實(shí)驗(yàn)室多使用TAE電泳緩沖液。

             

            50×TAE Buffer配制單如下表所示:(使用時(shí)需稀釋50倍)

            試劑

            稱量值

            方法

            Tris(氨基丁三醇)

            242 g

            置于1 L燒杯中,加入約600 mL去離子水,充分?jǐn)嚢杈鶆颍?/span>

            Na2EDTA·2H2O

            37.2 g

            CH3COOH(冰乙酸)

            57.1 mL

            充分溶解后,用NaOH調(diào)pH至8.3,加去離子水定容至1 L。

             

            02

            配制瓊脂糖凝膠

             
             

            瓊脂糖是純化的線性半乳聚糖親水膠體,提取自瓊脂或者含瓊脂的海藻。瓊脂糖的基本參數(shù)包括:硫酸鹽含量、凝膠強(qiáng)度、膠凝點(diǎn)、電內(nèi)滲(EEO)等。合適的瓊脂糖是核酸電泳跑出好膠的重要前提,翌圣高質(zhì)量瓊脂糖(Cat#10208ES),膠孔清晰、膠體不易斷,具備純度高(硫酸鹽含量低)、凝膠強(qiáng)度大、膠凝點(diǎn)相對高(常溫條件下凝固快)、電內(nèi)滲低等特點(diǎn),是實(shí)驗(yàn)室DNA/RNA凝膠電泳的  。

             

             

            產(chǎn)品優(yōu)勢

            嚴(yán)格控制瓊脂糖參數(shù),保證凝膠質(zhì)量

             

            電滲值低(EEO≤0.13),條帶分離效果好,分得開、跑得快;

            圖2.不同濃度凝膠電泳圖

             

            注:0.75%瓊脂糖凝膠上樣:1kb ladder,1%瓊脂糖凝膠上樣:100 bp ladder、1kb ladder、2000 DNA Marker、5000 DNA Marker,2%瓊脂糖凝膠上樣:100 bp ladder、2000 DNA Marker、5000 DNA Marker;上樣量:Marker 原液 2 μl 稀釋 5 倍后上樣 10 μl;0.75%、1%、2%瓊脂糖凝膠電泳程序分別為:115V,45min;130V,40 min;130V,50 min。

             

            瓊脂糖凝膠電泳必然離不開核酸染料的加持,核酸染料一般是芳香環(huán)化合物,這些化合物能夠與DNA中的核苷酸發(fā)生靜電作用,從而將核酸染料吸附到DNA分子表面。分子中含有的環(huán)結(jié)構(gòu)可以吸收紫外線或藍(lán)光,并發(fā)出熒光。翌圣核酸染料YeaRed/YeaGreen是油性大分子產(chǎn)品,不能穿透細(xì)胞膜進(jìn)入細(xì)胞內(nèi),不易揮發(fā)升華,人體不會(huì)吸入,經(jīng)過艾姆斯氏和相關(guān)測試表明這兩種染料無明顯誘變性,是集高靈敏、低毒性和超穩(wěn)定于一身 的熒光核酸凝膠染色試劑。

             

             

            瓊脂糖凝膠配制對照表

             

            03

            Marker選擇

             
             

            DNA Marker是分子量不同的DNA片段的組合,主要用途為DNA分子凝膠電泳時(shí),與樣品共同加入凝膠中進(jìn)行電泳分離,通過樣品條帶與DNA Marker對應(yīng)條帶大小及亮度的對比,可以粗略估算樣品DNA分子量的大小以及在溶液中的濃度。


            目前翌圣生物DNA Marker分子量大小范圍覆蓋了從50 bp到15 kb的DNA片段,符合絕大多數(shù)實(shí)驗(yàn)需求。Marker上樣量通常為5-10 μL,如果大分子條帶彎曲、拖尾且分不開,可以將Marker原液2 µL稀釋5倍加10 µL,條帶清晰不拖尾。

             

             

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            相關(guān)產(chǎn)品如下表所示,歡迎選購。


            產(chǎn)品定位

            產(chǎn)品名稱

            產(chǎn)品貨號

            規(guī)格

            高質(zhì)量瓊脂糖

            Agarose瓊脂糖

            10208ES60/76

            100 g/500 g

            Low Melting Point Agarose 低熔點(diǎn)瓊脂糖

            10214ES25/60

            25 g/100 g

            3:1 Agarose 3:1瓊脂糖

            10220ES25/60

            25 g/100 g

            High Sieving Agarose 高分辨率瓊脂糖(PCR級)

            10221ES08/25

            5 g/25 g

            Agarose Tablets 瓊脂糖(片劑,0.5 g/片)

            10226ES70

            1盒(200片)

            核酸染料

            YeaRed Nucleic Acid Gel Stain(10,000× in Water) YeaRed核酸染料(10,000× 水溶液)

            10202ES76

            500 μL

            YeaGreen Nucleic Acid Gel Stain (10,000×in Water)

            10204ES76

            500 μL

            DNA Marker

            GoldBand DL2,000 DNA Marker

            10501ES60

            100 T

            GoldBand DL600 DNA Marker

            10502ES60

            100 T

            GoldBand DL5,000 DNA Marker

            10504ES60

            100 T

            GoldBand 100 bp DNA ladder

            10507ES60

            100 T


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