國際期刊 | 翌圣克隆試劑助力武大團(tuán)隊破譯細(xì)胞分裂調(diào)控密碼!
細(xì)胞分裂(cell division)是生物體中細(xì)胞增殖的過程,通過這一過程,一個母細(xì)胞(mother cell)復(fù)制其所有必要的成分,并分成兩個或更多個具有相似遺傳信息的子細(xì)胞(daughter cells)。細(xì)胞分裂對于維持生命活動至關(guān)重要,是所有細(xì)胞生命的基礎(chǔ)。無論是對于單細(xì)胞生物的增長和繁殖,還是對于多細(xì)胞生物的生長、修復(fù)損傷組織和生殖都是不可少的。
古細(xì)菌作為地球上最早出現(xiàn)的生命形式之一,其細(xì)胞分裂機(jī)制能提供關(guān)于早期生命如何增殖和演變的重要線索。通過了解古細(xì)菌的分裂方式,科學(xué)家可以更好地理解生命起源時原始細(xì)胞的復(fù)制機(jī)制,以及后來不同生物域的細(xì)胞分裂方式的演化過程。大多數(shù)古細(xì)菌使用原核微管蛋白同源物FtsZ或運輸所需的內(nèi)體分選復(fù)合物(ESCRT)(也稱為Cdv系統(tǒng))來實現(xiàn)細(xì)胞分裂,但這兩種系統(tǒng)都沒有得到可靠的表征,人們對于古細(xì)菌的分裂系統(tǒng)及其調(diào)控機(jī)制了解相對較少。
2024年3月4日,武漢大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院杜世燊團(tuán)隊在Nature Microbiology(IF:30.964)上發(fā)表了題為“Widespread photosynthesis reaction centre barrel proteins are necessary for haloarchaeal cell division”的研究論文,該論文以沃氏富鹽菌(Haloferax volcanii)為模型,發(fā)現(xiàn)了能調(diào)控細(xì)胞分裂的新型CdpB蛋白,揭示CdpB蛋白在細(xì)胞分裂過程中的作用機(jī)制,表明光合作用反應(yīng)中心(PRC)桶蛋白在古菌的細(xì)胞分裂中起到重要作用,以期為深入理解細(xì)胞分裂的調(diào)控機(jī)制提供新的視角。
圖1.CdpB1-GFP與已知細(xì)胞分裂蛋白共定位的代表性圖像(圖片來自原文)
研究人員通過同源重組構(gòu)建雙元表達(dá)質(zhì)粒,判斷不同分裂基因能否雙重表達(dá)。結(jié)果顯示HVO_1691的熒光蛋白融合定位于細(xì)胞中(圖1),且與已知的細(xì)胞分裂蛋白FtsZ1、FtsZ2和SepF存在熒光共定位的情況,共定位百分比可達(dá)100%。表明HVO_1691蛋白在細(xì)胞分裂中起著重要作用,并將其重命名為細(xì)胞分裂蛋白B1 (CdpB1)。
圖2.CdpB1的缺失導(dǎo)致細(xì)胞分裂后形態(tài)缺陷(圖片來自原文)
圖3.去除色氨酸后cdpB1s轉(zhuǎn)錄水平的RT-qPCR分析(圖片來自原文)
為了確認(rèn)CdpB1參與細(xì)胞分裂,研究人員構(gòu)建His標(biāo)記和非標(biāo)記的CdpB1缺失菌株,將其啟動子替換為色氨酸誘導(dǎo)啟動子Ptna,使其表達(dá)受色氨酸調(diào)節(jié)。在色氨酸存在下,細(xì)胞生長良好;當(dāng)從培養(yǎng)物中去除色氨酸后,細(xì)胞逐漸變大和畸形(圖2)。定量PCR逆轉(zhuǎn)錄(RT-qPCR)和蛋白質(zhì)印跡分析證實,去除色氨酸后,cdpB1轉(zhuǎn)錄本和His-CdpB1蛋白水平急劇降低(圖2和圖3)。表明CdpB1對細(xì)胞分裂和細(xì)胞形態(tài)至關(guān)重要,降低它的表達(dá)水平導(dǎo)致細(xì)胞分裂及形態(tài)出現(xiàn)嚴(yán)重缺陷。
圖4.PRC桶蛋白在鹽古菌細(xì)胞分裂中廣泛保守(圖片來自原文)
a:PRC桶蛋白PRC桶狀蛋白在Natrinema sp. J7和H. hispanica細(xì)胞中定位的代表性圖像。b:CdpB1缺失的H. volcanii細(xì)胞分別與CdpB1或其同源物NJ7GCdpB1和HAHCdpB1互補(bǔ)的代表性圖像。c:CdpB1同源物的缺失分別在Natrinema sp. J7和H. hispanica細(xì)胞中引起嚴(yán)重和中度分裂缺陷。
進(jìn)一步研究發(fā)現(xiàn),CdpB1直接與細(xì)胞分裂蛋白FtsZ的膜錨定蛋白SepF相互作用,依賴FtsZ來調(diào)控細(xì)胞分裂。CdpB1的家族成員CdpB2和CdpB3也參與細(xì)胞分裂過程,但其缺失對細(xì)胞分裂的影響不同。CdpB蛋白的同源物也參與其他鹽古菌的細(xì)胞分裂,表明CdpB1蛋白的細(xì)胞分裂功能在不同物種中高度保守(圖4)。比較基因組學(xué)分析和系統(tǒng)發(fā)育樹顯示,CdpB蛋白是PRC-barrel蛋白超家族的成員,含有PRC結(jié)構(gòu)域,廣泛分布于各種古菌分支中。值得注意的是,古菌ESCRT細(xì)胞分裂系統(tǒng)中的關(guān)鍵蛋白CdvA也含有PRC結(jié)構(gòu)域,表明PRC結(jié)構(gòu)域在古菌細(xì)胞分裂系統(tǒng)中具有廣泛而保守的作用。綜合分析表明,PRC蛋白家族是古菌細(xì)胞分裂系統(tǒng)中的重要組成部分,可能作為適配器招募其他參與細(xì)胞分裂的蛋白,在古菌細(xì)胞分裂中具有保守功能。
綜上所述,本研究發(fā)現(xiàn)了一類廣泛保守的古菌細(xì)胞分裂蛋白并初步揭示了其分子機(jī)制,這些發(fā)現(xiàn)為細(xì)胞分裂機(jī)器的演化提供了新的見解,為深入研究古菌細(xì)胞分裂機(jī)制及分裂機(jī)器的演化奠定了基礎(chǔ)。
在該研究中,研究人員選擇了翌圣克隆試劑盒用于構(gòu)建表達(dá)載體、qPCR Mix用于基因表達(dá)情況分析、高保真酶用于擴(kuò)增目的片段。
(截圖來自原文Data 7)
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