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            干貨 | 細(xì)胞轉(zhuǎn)染原理及應(yīng)用全面解讀

            來(lái)源:翌圣生物科技(上海)股份有限公司   2024年05月06日 15:35  

            細(xì)胞轉(zhuǎn)染是指將外源DNA或RNA導(dǎo)入目標(biāo)細(xì)胞中的過(guò)程。這一過(guò)程可以通過(guò)多種方法實(shí)現(xiàn),包括化學(xué)法轉(zhuǎn)染、物理法轉(zhuǎn)染、生物法轉(zhuǎn)染等。細(xì)胞轉(zhuǎn)染技術(shù)在生命科學(xué)研究中具有廣泛的應(yīng)用,例如基因表達(dá)研究、功能研究、基因治療和藥物開(kāi)發(fā)等。通過(guò)轉(zhuǎn)染,可以實(shí)現(xiàn)基因編輯、蛋白質(zhì)表達(dá)、信號(hào)傳導(dǎo)研究等,為揭示細(xì)胞機(jī)制、開(kāi)發(fā)新藥和治療疾病提供了重要工具。

             

            真核生物的轉(zhuǎn)錄發(fā)生在細(xì)胞核中,蛋白質(zhì)合成發(fā)生在細(xì)胞質(zhì)中。因此,一個(gè)真核信使RNA必須從細(xì)胞核中被運(yùn)出來(lái)才能被翻譯成多肽。而原核細(xì)胞沒(méi)有細(xì)胞核,所以它們的轉(zhuǎn)錄和翻譯都在細(xì)胞質(zhì)中進(jìn)行。

             


            圖1.真核&原核細(xì)胞轉(zhuǎn)錄和RNA加工流程[1]

             

            細(xì)胞轉(zhuǎn)染主要分為瞬時(shí)轉(zhuǎn)染和穩(wěn)定轉(zhuǎn)染:

             
            穩(wěn)定轉(zhuǎn)染

            是指將外源DNA導(dǎo)入細(xì)胞中,目的基因能夠入核,并整合到宿主細(xì)胞基因組中,通過(guò)藥物加壓篩選,只保留成功轉(zhuǎn)染的陽(yáng)性細(xì)胞,使其在細(xì)胞分裂和傳代過(guò)程中持續(xù)穩(wěn)定地存在和表達(dá)。通過(guò)穩(wěn)定轉(zhuǎn)染,外源DNA能夠遺傳給后代細(xì)胞,從而實(shí)現(xiàn)長(zhǎng)期的基因表達(dá)。

             
             
             
             
            瞬時(shí)轉(zhuǎn)染

            瞬時(shí)轉(zhuǎn)染是指將外源DNA或RNA導(dǎo)入細(xì)胞中,使其在一段有限的時(shí)間內(nèi)進(jìn)行高效表達(dá),但是不能隨細(xì)胞傳代而持續(xù)穩(wěn)定表達(dá)。瞬時(shí)轉(zhuǎn)染通常使用化學(xué)轉(zhuǎn)染試劑或物理方法(如電穿孔、微注射等)導(dǎo)入外源DNA,并使其在短暫的時(shí)間內(nèi)表達(dá)所需的蛋白質(zhì)。

             
             
             

             

             

            常用轉(zhuǎn)染方法及應(yīng)用

             

            目前轉(zhuǎn)染方法主要包括物理方法、化學(xué)方法及生物方法,轉(zhuǎn)染方法的選擇取決于細(xì)胞類(lèi)型以及研究目的,即使相同的細(xì)胞,不同的轉(zhuǎn)染試劑之間也有較大差異,所以在使用新細(xì)胞系時(shí),系統(tǒng)評(píng)估轉(zhuǎn)染條件至關(guān)重要[2,3]。

             

             

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            圖2.細(xì)胞轉(zhuǎn)染示意圖[4]

             

             

             

            穩(wěn)定轉(zhuǎn)染和瞬時(shí)轉(zhuǎn)染有何異同

             

            相同點(diǎn):針對(duì)質(zhì)粒DNA,不論是瞬時(shí)轉(zhuǎn)染還是穩(wěn)定轉(zhuǎn)染,都可以通過(guò)物理法(電轉(zhuǎn)、顯微注射、基因槍?zhuān)?,化學(xué)法(陽(yáng)離子脂質(zhì)體,陽(yáng)離子聚合物、磷酸鈣),生物法(病毒介導(dǎo))進(jìn)行轉(zhuǎn)染;并且轉(zhuǎn)染環(huán)節(jié)的操作基本一致。

            差異點(diǎn):穩(wěn)轉(zhuǎn)細(xì)胞株構(gòu)建所用質(zhì)粒,一定是包含抗性基因,便于后續(xù)加壓篩選;瞬轉(zhuǎn)所用的質(zhì)??梢园剐曰蛞部梢圆话剐曰颉?/span>

             

             

             

            瞬時(shí)轉(zhuǎn)染和穩(wěn)定轉(zhuǎn)染常見(jiàn)誤區(qū)

             

            誤區(qū)一

            穩(wěn)定轉(zhuǎn)染目的基因會(huì)整合到染色體,瞬時(shí)轉(zhuǎn)染不會(huì)

            首先我們要了解基因從DNA到蛋白質(zhì)的過(guò)程:DNA被轉(zhuǎn)運(yùn)至細(xì)胞后會(huì)入核,DNA在細(xì)胞核內(nèi),根據(jù)堿基互補(bǔ)配對(duì)原則,和基因的選擇性表達(dá)等,轉(zhuǎn)錄出mRNA;mRNA通過(guò)核孔來(lái)到細(xì)胞質(zhì)中的核糖體上,通過(guò)高爾基體,內(nèi)質(zhì)網(wǎng)等加工,在空間上通過(guò)折疊,反轉(zhuǎn),螺旋等方式形成空間結(jié)構(gòu)。從而形成具有生物活性的蛋白質(zhì)。一般會(huì)分為胞內(nèi)表達(dá)、分泌型、單次跨膜及多次跨膜不同形態(tài)。

             

            所以不管是瞬轉(zhuǎn)還是穩(wěn)轉(zhuǎn),DNA都會(huì)入核并有一定概率隨機(jī)整合到宿主染色體;的區(qū)別在于,穩(wěn)轉(zhuǎn)所用的質(zhì)粒含有抗性基因,后期是通過(guò)藥物篩選,把沒(méi)有轉(zhuǎn)進(jìn)目的基因的細(xì)胞殺死,保留下來(lái)的就是成功轉(zhuǎn)入目的基因的細(xì)胞,所以通過(guò)一定時(shí)間的藥物篩選,保存下來(lái)的細(xì)胞都是能夠穩(wěn)定遺傳的細(xì)胞,稱(chēng)之為穩(wěn)定轉(zhuǎn)染;而瞬時(shí)轉(zhuǎn)染由于沒(méi)有藥物加壓篩選,加上僅有少量的細(xì)胞中有目的基因整合到染色體,所以在傳代的過(guò)程中,陽(yáng)性細(xì)胞會(huì)越來(lái)越少,導(dǎo)致表達(dá)量逐漸降低,進(jìn)而不能長(zhǎng)期穩(wěn)定表達(dá)。

             

            圖3.蛋白表達(dá)模式圖[5]

            誤區(qū)二

            只有慢病毒感染才能構(gòu)建穩(wěn)轉(zhuǎn)細(xì)胞株

            能夠用來(lái)做瞬轉(zhuǎn)的轉(zhuǎn)染方法,都可以用來(lái)做穩(wěn)轉(zhuǎn)細(xì)胞株構(gòu)建,比如電轉(zhuǎn)、化學(xué)試劑轉(zhuǎn)染、慢病毒感染等,只不過(guò)三種轉(zhuǎn)染方法在具體的應(yīng)用上會(huì)有一定差異;需要注意的是RNA轉(zhuǎn)染,由于RNA不需要入核,所以針對(duì)RNA轉(zhuǎn)染一般只是做瞬轉(zhuǎn)表達(dá)。

            誤區(qū)三

            構(gòu)建穩(wěn)轉(zhuǎn)細(xì)胞株費(fèi)時(shí)費(fèi)力,周期長(zhǎng),不確定性高,常規(guī)實(shí)驗(yàn)室不方便構(gòu)建

            1、細(xì)胞株構(gòu)建需要通過(guò)藥物加壓篩選,與瞬轉(zhuǎn)相比周期長(zhǎng),但在進(jìn)行科學(xué)研究時(shí),確定了一個(gè)長(zhǎng)期研究的靶標(biāo),后續(xù)都會(huì)針對(duì)某一基因進(jìn)行相關(guān)實(shí)驗(yàn),那么這個(gè)時(shí)候構(gòu)建穩(wěn)轉(zhuǎn)細(xì)胞株就顯得尤為必要,畢竟細(xì)胞株相較于瞬轉(zhuǎn)來(lái)說(shuō),最大的優(yōu)點(diǎn)就是表達(dá)穩(wěn)定性高,批間差異小,實(shí)驗(yàn)結(jié)果可靠性更高。

             

            2、有的細(xì)胞轉(zhuǎn)染效率比較低,通過(guò)瞬轉(zhuǎn)的方式,很難獲得足夠的陽(yáng)性細(xì)胞進(jìn)行實(shí)驗(yàn),通過(guò)構(gòu)建細(xì)胞株,就可以提高陽(yáng)性率,獲得足量穩(wěn)定過(guò)表達(dá)的細(xì)胞株。

             

            3、有的人可能會(huì)覺(jué)得構(gòu)建細(xì)胞株周期太久,結(jié)果不可控;其實(shí),在我們構(gòu)建細(xì)胞株時(shí),通常會(huì)在轉(zhuǎn)染后48h進(jìn)行表達(dá)量檢測(cè)以及初步的功能驗(yàn)證,這個(gè)時(shí)候我們就可以知道是否轉(zhuǎn)染成功,就可以知道細(xì)胞株構(gòu)建是否會(huì)成功;至于操作難度,這里也可以給大家分享實(shí)驗(yàn)protocol(具體操作如下)。

             

            穩(wěn)轉(zhuǎn)細(xì)胞株構(gòu)建操作流程:

            1、重組質(zhì)粒構(gòu)建:按照實(shí)驗(yàn)室的需求,將目的基因構(gòu)建到含有抗性基因的載體中(如pLVX-puro),進(jìn)行無(wú)內(nèi)毒素質(zhì)粒抽提,獲得目的質(zhì)粒,最終拿到的質(zhì)粒,濃度最好不低于1000 ng/μL,濃度過(guò)低會(huì)影響轉(zhuǎn)染效率。

             

            2、細(xì)胞準(zhǔn)備:在轉(zhuǎn)染前一天傳代細(xì)胞,保證在第二天能夠有70%左右的匯合度(具體情況可根據(jù)細(xì)胞而定)。

             

            3、細(xì)胞轉(zhuǎn)染:按照轉(zhuǎn)染試劑說(shuō)明書(shū)進(jìn)行細(xì)胞轉(zhuǎn)染即可。

             

            4、細(xì)胞檢測(cè):轉(zhuǎn)染后48h,取部分細(xì)胞進(jìn)行表達(dá)量或功能檢測(cè),初步判斷是否轉(zhuǎn)染成功,若失敗,查找失敗原因;若成功,則進(jìn)行后續(xù)實(shí)驗(yàn)。

             

            5、細(xì)胞鋪板:細(xì)胞計(jì)數(shù)后,按照10/100/1000個(gè)細(xì)胞每孔鋪板96孔板(鋪板數(shù)量可以梯度測(cè)試),鋪板培養(yǎng)基需要含有篩選藥物;不建議直接在原細(xì)胞中直接加入藥物進(jìn)行篩選,這樣會(huì)降低細(xì)胞存活率。

             

            6、克隆挑選:細(xì)胞鋪板后14天,顯微鏡觀察克隆生長(zhǎng)情況,并將陽(yáng)性克隆移至12孔板繼續(xù)培養(yǎng)(根據(jù)細(xì)胞量轉(zhuǎn)移到合適的細(xì)胞培養(yǎng)板即可)。

             

            7、克隆檢測(cè):按照實(shí)驗(yàn)室檢測(cè)方法進(jìn)行表達(dá)量或功能驗(yàn)證,篩選出若干個(gè)優(yōu)選克隆繼續(xù)傳代培養(yǎng),待細(xì)胞大量擴(kuò)培后,可再進(jìn)行一次復(fù)檢。

             

            8、細(xì)胞建庫(kù):按照實(shí)驗(yàn)需求進(jìn)行細(xì)胞建庫(kù),如果需要構(gòu)建單克隆細(xì)胞株,可以在優(yōu)選克隆基礎(chǔ)上按照單個(gè)細(xì)胞每孔進(jìn)行二輪篩選。

             

             

            細(xì)胞轉(zhuǎn)染常見(jiàn)FAQ

             

            問(wèn)

            一般哪些因素會(huì)影響細(xì)胞轉(zhuǎn)染效率
             

            質(zhì)粒:首先要確保我們序列的準(zhǔn)確性,其次是質(zhì)粒的高純度;質(zhì)粒濃度最好不低于1000 ng/uL(該濃度只是建議濃度,低濃度也可以成功轉(zhuǎn)染,只不過(guò)轉(zhuǎn)染效率會(huì)有所降低)。
            細(xì)胞類(lèi)型:要保證是一個(gè)健康狀態(tài)的細(xì)胞;不同細(xì)胞類(lèi)型對(duì)轉(zhuǎn)染方法和試劑的敏感性不同,因此轉(zhuǎn)染效率也會(huì)有差異。
            轉(zhuǎn)染方法:按照轉(zhuǎn)染試劑說(shuō)明書(shū)要求進(jìn)行轉(zhuǎn)染條件摸索,確定最佳轉(zhuǎn)染條件。

            問(wèn)

            通過(guò)多種轉(zhuǎn)染方式均無(wú)法提高轉(zhuǎn)染效率,應(yīng)該怎么解決
             

            如果瞬轉(zhuǎn)效率比較低,這時(shí)會(huì)推薦構(gòu)建穩(wěn)轉(zhuǎn)細(xì)胞株,可以通過(guò)藥物加壓篩選,獲得穩(wěn)定過(guò)表達(dá)的細(xì)胞株,提高陽(yáng)性率,解決轉(zhuǎn)染效率低的問(wèn)題。

            問(wèn)

            如何選擇合適的轉(zhuǎn)染方法
             

            目前主要有物理方式,化學(xué)試劑及病毒等轉(zhuǎn)染方式;通常物理轉(zhuǎn)染需要昂貴的儀器及復(fù)雜的轉(zhuǎn)染參數(shù),一般實(shí)驗(yàn)室無(wú)法滿(mǎn)足;化學(xué)試劑是目前比較通用的一種方法,因其價(jià)格便宜,操做簡(jiǎn)單,被廣泛使用,不過(guò)該類(lèi)產(chǎn)品一般只能轉(zhuǎn)染比較常規(guī)的細(xì)胞,針對(duì)個(gè)性化腫瘤細(xì)胞其轉(zhuǎn)染效率會(huì)下降,所以針對(duì)較難轉(zhuǎn)染的細(xì)胞,主要是通過(guò)慢病毒進(jìn)行轉(zhuǎn)染;當(dāng)然,如果細(xì)胞本身就是那種非常難轉(zhuǎn)染的,慢病毒也不一定會(huì)有很高的轉(zhuǎn)染效率。

            問(wèn)

            穩(wěn)轉(zhuǎn)細(xì)胞株構(gòu)建是否需要將質(zhì)粒線(xiàn)性化
             

            不需要,質(zhì)粒線(xiàn)性化和未線(xiàn)性化均可,親測(cè)兩種差異不大。

            問(wèn)

            報(bào)告基因細(xì)胞株如何構(gòu)建
             

            報(bào)告基因細(xì)胞株構(gòu)建流程和上述細(xì)胞株構(gòu)建方法基本一致,首先需要確定所用報(bào)告基因質(zhì)粒是正確(涉及到具體的信號(hào)通路),根據(jù)細(xì)胞類(lèi)型,選用適合的轉(zhuǎn)染方法,按照質(zhì)粒載體上標(biāo)注的抗性基因進(jìn)行藥物篩選即可。(翌圣生物提供上百種報(bào)告基因質(zhì)粒產(chǎn)品可供選擇)

             

             

             

            相關(guān)產(chǎn)品

             

            針對(duì)細(xì)胞轉(zhuǎn)染,翌圣可以提供多款轉(zhuǎn)染試劑,能夠匹配更多應(yīng)用場(chǎng)景,如常規(guī)DNA轉(zhuǎn)染、siRNA/miRNA轉(zhuǎn)染及病毒包裝轉(zhuǎn)染試劑等,其中PEI轉(zhuǎn)染試劑能夠提供GMP級(jí)別產(chǎn)品,支持項(xiàng)目申報(bào)。

             

            產(chǎn)品名稱(chēng)

            貨號(hào)

            應(yīng)用

            Hieff Trans® Liposomal Transfection Reagent 脂質(zhì)體核酸轉(zhuǎn)染試劑

            40802ES

            轉(zhuǎn)染DNA,文章高引用產(chǎn)品

            Hieff Trans®siRNA/miRNA體外轉(zhuǎn)染試劑

            40806ES

            轉(zhuǎn)染siRNA/miRNA

            Calcium Phosphate Cell Transfection Kit 磷酸鈣法細(xì)胞轉(zhuǎn)染試劑

            40803ES

            轉(zhuǎn)染DNA,效率高,成本低

            Polyethylenimine Linear (PEI) MW40000(rapid lysis) 線(xiàn)性PEI轉(zhuǎn)染試劑(速溶型)MW40000

            40816ES

            PEI轉(zhuǎn)染試劑(粉末)

            Hieff Trans® PEI轉(zhuǎn)染試劑

            40820ES

            PEI轉(zhuǎn)染試劑(科研級(jí))

            Hieff Trans® PEI Transfection Reagent-GMP

            40821ES

            PEI轉(zhuǎn)染試劑(GMP級(jí))

             

            參考文獻(xiàn)


            [2] Hamm A, Krott N, Breibach I, Blindt R, Bosserhoff AK. Efficient transfection method for primary cells. Tissue Eng. 2002 Apr;8(2):235-45. doi: 10.1089/107632702753725003. PMID: 12031113.

            [3] Badakov R, Ja?wińska A. Efficient transfection of primary zebrafish fibroblasts by nucleofection. Cytotechnology. 2006 Jun;51(2):105-10. doi: 10.1007/s10616-006-9018-3. Epub 2006 Sep 21. PMID: 19002901; PMCID: PMC3449684.

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            [5] Ahmad M, Hirz M, Pichler H, Schwab H. Protein expression in Pichia pastoris: recent achievements and perspectives for heterologous protein production. Appl Microbiol Biotechnol. 2014 Jun;98(12):5301-17. doi: 10.1007/s00253-014-5732-5. Epub 2014 Apr 18. PMID: 24743983; PMCID: PMC4047484.



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