上新 | Fast PNGase F, 僅需10分鐘完成且無偏好地去糖基化
隨著糖蛋白質組學和抗體藥研究的迅速發(fā)展,糖基化修飾也備受關注。細胞與細胞、細胞與病原體的接觸主要是通過糖與蛋白質相互作用完成的,糖基化決定了糖復合物的粘附特性。在IgG中,F(xiàn)c區(qū)Asn297處的保守N-連接糖對其活性也至關重要。此外,一些抗體還具有額外的N-糖鏈,與 Fc區(qū) Asn297處的保守位點一起影響抗體的識別、半衰期和免疫反應。
蛋白質糖基化是一種復雜的翻譯后修飾,涉及糖鏈在蛋白質特定位點的連接,依據(jù)糖鏈類型的差異,糖蛋白被分為N-連接糖蛋白、O-連接糖蛋白等;另外,蛋白質糖基化還受到宿主細胞類型和發(fā)酵條件(如培養(yǎng)基、pH值、溫度等)波動的影響。因此,糖蛋白在糖基化模式上通常具有異質性,包括糖基化位點、糖基化程度以及糖鏈的具體結構,使得糖鏈分析和結構表征工作具挑戰(zhàn),為了程度上獲得糖鏈結構信息,目前糖鏈分析的主要策略是先把糖鏈從蛋白上游離下來,然后進行詳細的分析表征。在此策略中,高效、準確、穩(wěn)定的去糖基化方法至關重要。
酶促法是目前應用比較廣泛的去糖基化方法。
其中PNGase F (N-糖苷酶 F)是去除糖蛋白中幾乎所有 N-連接寡糖的有效的酶促方法,可以裂解由天冬酰胺連接的高甘露糖、雜合和復雜的寡糖糖蛋白,特異性除去N-連接糖。切割位點為:最內側N-乙酰葡糖胺(GlcNAc)和天冬酰胺殘基之間的酰胺鍵,同時將酶解后蛋白上的天冬氨酰轉化為天冬氨酸。
當α1-6巖藻糖位于GlcNAc核心時,PNGase F也可以切割;只有當α1-3巖藻糖位于GlcNAc核心時(常見于植物和昆蟲糖蛋白),PNGase F不能切割。
但常規(guī)PNGase F酶促反應釋放抗體N-聚糖需要長達幾小時,同時由于聚糖釋放存在偏好性,不全的去糖基化可能導致結果的偏差,所獲得的聚糖分布不能代表治療性抗體的正確組成。因此,盡量在最短時間內獲得準確的 N-糖鏈糖譜對于抗體及抗體融合蛋白等生物治療劑生產(chǎn)過程中糖基化監(jiān)測至關重要。
Fast PNGase F,N-糖苷酶 F(快速版)是一種經(jīng)過優(yōu)化的重組試劑,可以在數(shù)分鐘內對抗體、免疫球蛋白、融合蛋白以及其他糖蛋白進行快速的去糖基化。此酶能夠迅速且無偏好性地去除所有的 N-糖鏈,并且可直接進行下游的色譜或質譜分析。翌圣Fast PNGase F,N-糖苷酶 F(快速版) 簡化了實驗流程,可在保證靈敏度和重復性的前提下減少實驗時間。
產(chǎn)品特點
速度快:數(shù)分鐘內進行快速的去糖基化;
純度高:無蛋白酶、糖苷酶污染,純度≥95%;
無偏好性:迅速且無偏好性地去除所有的 N-糖鏈;
兼容性好:可直接進行下游的色譜或質譜分析。
測試數(shù)據(jù)
一步法蛋白質去糖基化
10 ug底物/100 ug抗體和ddH2O混合至16 uL的總體積;
加入4 μL的Fast PNGase F Buffer(5x),終體積為20 uL;
加入1 μL的Fast PNGase F;
在50℃下孵育10分鐘。
兩步法蛋白質去糖基化:
10 ug底物/100 ug抗體和ddH2O混合至16 uL的總體積;
加入4 μL的Fast PNGase F Buffer(5x),終體積為20 uL;
在80℃下孵育2分鐘,冷卻至室溫;
加入1 μL的Fast PNGase F;
在50℃下孵育10分鐘。
結論
1.翌圣Fast PNGase F在同等反應條件下同進口競品有著等同的酶切效率或高于進口競品;
2.推薦進行兩步法酶切,可保證更高的酶切效率。某些抗體(如Fab N-糖基化)需要預熱步驟來進行高效的脫糖基化。
另外,我司還提供常規(guī)PNGase F,包括PNGase F, N-糖苷酶 F(Cat#20407ES,比活性:100000 U/mL),PNGase F, N-糖苷酶 F(Cat#20415ES,比活性:750000 U/mL),以及其他類型的糖苷酶,如Endo H糖苷內切酶H(Cat#20414ES),Endo S糖苷內切酶S(Cat#20413ES)。
貨號 | 20406ES | 20407ES | 20415ES | 20414ES | 20413ES |
產(chǎn)品 名稱 | Fast PNGase F | PNGase F | PNGase F | Endo H | Endo S |
來源 | 酵母重組表達 | 酵母重組表達 | 酵母重組表達 | 酵母重組表達 | 大腸桿菌表達 |
比活 | 不適用 | 100000U/mL | 750000U/mL | 1000000U/mL | 8000 U/mg |
切割 位點 | 幾乎所有的N-連接糖 | 幾乎所有的N-連接糖 | 幾乎所有的N-連接糖 | N-連接高甘露糖 | 從 IgG 重鏈的殼二糖核心結構之間切除N-連接糖 |
酶切 時間 | 10 min | 1-3 h | 1-3 h | 1-3 h | 1 h |
糖組學 | 適合 | 適合 | 適合 | 適合 | 適合 |
蛋白質組學 | 適合 | 適合 | 適合 | 適合 | 適合 |
產(chǎn)品名稱 | 貨號 | 規(guī)格 |
Fast PNGase F, N-糖苷酶 F(快速版) | 20406ES20/50 | 20 T/50 T |
PNGase F (N-糖酰胺酶F或肽N-糖苷酶 F) | 20407ES01/02 | 15000 U /75000 U |
PNGase F, Recombinant, Expressed in Yeast 酵母重組表達N-糖苷酶 F | 20415ES01/02 | 15 kU/75 kU |
Endo H糖苷內切酶H | 20414ES92/97 | 10000 U /50000 U |
Endo S糖苷內切酶S | 20413ES80/90 | 1000 U/ 5 x 1000 U |
產(chǎn)品名稱 | 貨號 | 規(guī)格 |
IdeS Protease(免疫球蛋白G降解酶) | 20412ES84/90 | 2000 U/5000 U |
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