通過培養(yǎng)基分析輔助判斷Car-T細(xì)胞代謝機(jī)制
一、 摘要:
隨著Car-T細(xì)胞治療的發(fā)展,測試不同的Car-T細(xì)胞,并將代謝特征與表現(xiàn)良好且符合預(yù)期的Car-T細(xì)胞表型聯(lián)系起來,使CAR構(gòu)建和制造過程優(yōu)化。
Vasoactive intestinal peptide(VIP)是一種新興的T細(xì)胞功能的檢查通路。
VIP在T細(xì)胞和腫瘤細(xì)胞中均有表達(dá),并在TCR激活過程中大量表達(dá)。在原代人類T細(xì)胞的擴(kuò)增過程中,VIP/VIPR軸的增強(qiáng)了分化程度較低的T細(xì)胞表型、抗腫瘤細(xì)胞毒性和體內(nèi)持久性。
通過工程改造Car-T細(xì)胞分泌新的、有效的VIPR拮抗肽,這些細(xì)胞可以克服對富含VIP的腫瘤微環(huán)境的免疫抑制(圖1)。拮抗T細(xì)胞中的VIP/VIPR軸可增強(qiáng)T細(xì)胞介導(dǎo)的抗腫瘤能力。
在項目的這一部分,我們研究通過培養(yǎng)基氨基酸分析來表征增強(qiáng)型Car-T細(xì)胞制造過程-將代謝特性與期望的、低分化和非耗竭型Car-T細(xì)胞族相關(guān)聯(lián)。
二、 實驗方法
為了研究VIPR拮抗劑是否影響代謝通路,我們使用快速培養(yǎng)基氨基酸維生素分析儀Rebel(908 Devices)進(jìn)行了反應(yīng)液分析,以確定CAR和CAR/VIPRa T細(xì)胞之間的氨基酸使用差異。培養(yǎng)基分析提供了在細(xì)胞胞外環(huán)境中化合物的消耗和積累的數(shù)據(jù)。
新鮮培養(yǎng)基和反應(yīng)液分析顯示了,丙氨酸、谷氨酸和絲氨酸等氨基酸消耗的差異。這促使我們進(jìn)一步研究這些Car-T細(xì)胞內(nèi)代謝通路利用和代謝物改變的差異。利用LC/MS代謝組學(xué)和細(xì)胞生物能學(xué)來闡明CAR和CAR/VIPRa T細(xì)胞代謝狀態(tài)之間的差異。
完整的研究包括以下描述步驟:
● 體內(nèi)-Car-T細(xì)胞功能和效力,以及壽命
ⅰ、熒光標(biāo)記物腫瘤成像
● 顯微鏡法視覺評估細(xì)胞(數(shù)字形式、形狀、表達(dá)生物標(biāo)記)
ⅰ、評估T細(xì)胞的肽分泌
● RNA測序
● 海馬線粒體應(yīng)激測試代謝呼吸狀態(tài)和應(yīng)激
● 抗原刺激
ⅰ、試驗激活(如抗原刺激細(xì)胞因子和激活試驗)
ⅱ、細(xì)胞毒性
ⅲ、增殖
● 流式細(xì)胞儀-具有特異性標(biāo)記物的細(xì)胞數(shù)量和比例
● Rebel-新鮮培養(yǎng)基和反應(yīng)液的氨基酸分析
● 蛋白質(zhì)結(jié)合分析-效力和活性測定,與抗原、抗體和底物等
三、 快速培養(yǎng)基氨基酸維生素分析儀Rebel:隨時為您的生物過程調(diào)整提供參數(shù)指引
● 氨基酸、維生素和生物胺的快速分析
● 最小所需樣品:低至10µL
● 簡單樣品準(zhǔn)備:離心或過濾后稀釋
● 集成式自動分析儀:自動進(jìn)樣器、分離、檢測、分析和報告顯示
● 分析運行時間:~10分鐘每個樣品
● 試劑盒耗材:200次分析
四、 結(jié)果
圖3. A:用新鮮培養(yǎng)基(RPMI+10%胎牛血清)分析了細(xì)胞培養(yǎng)基中氨基酸的起始濃度。值得注意的是高濃度的精氨酸,而缺少丙氨酸。
圖3.B和3.C:來自不同供體(3.B-樣品29和3)(3.C-樣品51)的反應(yīng)液分析,顯示在培養(yǎng)終點非常相似的AA濃度水平。值得注意的是,反應(yīng)液中丙氨酸的產(chǎn)生/分泌和精氨酸的顯著消耗,以及應(yīng)激細(xì)胞和對照細(xì)胞樣本之間的差異。
圖3.D對含VIP受體拮抗肽結(jié)構(gòu)的氨基酸的進(jìn)一步分析顯示,培養(yǎng)終點的丙氨酸、谷氨酸和絲氨酸等氨基酸水平存在差異。
圖4. A采用LCMS分析來研究細(xì)胞內(nèi)代謝,通過測定細(xì)胞內(nèi)代謝物的豐度來確定不同代謝通路(糖酵解、TCA、PPP、AMP/ATP)的利用。
圖4.B線粒體應(yīng)激實驗通過功能測定抗原刺激和對照細(xì)胞的糖酵解和氧化磷酸化利用。
五、 總結(jié)
我們發(fā)現(xiàn),當(dāng)細(xì)胞受到抗原刺激時,CAR/VIPRa T細(xì)胞的能量明顯增加。相比之下,Car-T細(xì)胞變得能量更少,糖酵解作用更多,這是T細(xì)胞衰竭的已知特征。此外,用多種方法進(jìn)行的代謝評估產(chǎn)生了與此評估相關(guān)的結(jié)果,如耗氧量和反應(yīng)液中的某些氨基酸水平。最后,Car-T細(xì)胞活性、效力和細(xì)胞毒性評估顯示與抗腫瘤活性相關(guān)??傊?,這項工作表明,不同的代謝特征證明CAR/VIPRa T細(xì)胞在抗原刺激時增強(qiáng)對腫瘤的作用。
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