案例1：單鏈寡核苷酸n，n-1雜質(zhì)分離

案例2：DNA片段雜質(zhì)分離分析

根據(jù)樣品的吸附差異，在方法開發(fā)過程中可以不同種類的緩沖液和洗脫鹽類型，因為它們都可以顯著影響峰形和分辨率。

可以選擇不同的pH鹽，例如Tris-HCl 、NaOH緩沖液與NaCl或者NaClO4搭配使用。

一般情況下，目標(biāo)樣品以20 ~ 50 mM的緩沖溶液為弱洗脫流動相，此時通常樣品待測物吸附到色譜柱上，然后通過鹽濃度梯度（NaCl或者高氯酸鈉進(jìn)行洗脫，濃度一般通過梯度增加到0 ~ 0.5 M左右，有的時候可能更高），或pH梯度洗脫。 建議每次運(yùn)行時用含有1m NaCl的緩沖溶液清洗色譜柱，以去除殘留在柱上的雜質(zhì)，這些雜質(zhì)在最終流動相中沒有被洗脫。

高pH條件以及高柱溫可以有效提升分辨率。但是如果樣品的穩(wěn)定性較差，則推薦使偏中性洗脫液，溫度40℃條件下分離

PS修飾的寡核苷酸的保留大大增加，對于PS修飾寡核苷酸的純化，高pH和離子強(qiáng)度有利結(jié)合分子的洗脫，洗脫流動相選擇NaClO4更合適。

一般來說，通過離子交換進(jìn)行生物分子的分離分析，采用的是水相緩沖體系，但對于寡核苷酸的純化，對分離效率要求較高。在流動相中加入有機(jī)改性劑可以改變分離效果，一般不超過30%

不要使用含有氧化劑的溶劑作為流動相。

色譜柱保存在20 mM Tris-HCl buffer (pH 8.1)中。

色譜柱柱溫最高不要超過60℃使用，

色譜柱耐受的pH范圍是2-12。

脂溶性物質(zhì)和弱極性物質(zhì)可能吸附到色譜柱上，導(dǎo)致停留時間、峰形 和壓力的變化。在這些情況下，按照程序洗滌色譜柱：依次使用(1) 0.2 N NaOH水溶液/乙腈（80/20）；(2) 1 M醋酸水溶液；(3)加入非離子表面活性劑的流動相；(4)流動相為6m鹽酸胍，依次沖洗4-5mL。每次沖洗溶劑注入清洗后，檢查 保留時間和峰形是否恢復(fù)。