操作賽默飛熒光定量PCR儀需要按照一系列步驟來配置設(shè)備、設(shè)置實(shí)驗(yàn)程序、運(yùn)行實(shí)驗(yàn)和分析數(shù)據(jù)。以下是詳細(xì)的操作步驟和注意事項(xiàng),幫助您順利完成實(shí)驗(yàn)。
一、準(zhǔn)備工作
在正式操作賽默飛熒光定量PCR儀前,請(qǐng)確保以下準(zhǔn)備工作已完成:
檢查儀器狀態(tài):
檢查反應(yīng)體系:
確保計(jì)算機(jī)和儀器連接正常:
二、創(chuàng)建實(shí)驗(yàn)程序
打開儀器:
進(jìn)入實(shí)驗(yàn)設(shè)置界面:
輸入實(shí)驗(yàn)信息:
設(shè)置反應(yīng)體系:
反應(yīng)體積:根據(jù)實(shí)驗(yàn)需求設(shè)置反應(yīng)體積(常見體積有20 μL、25 μL、50 μL等)。
樣品信息:輸入樣品類型和濃度信息。確保樣品濃度與反應(yīng)體系相匹配。
引物/探針選擇:輸入或選擇所使用的引物和探針信息。確保熒光探針的選擇正確,并且與所用的熒光染料兼容。
三、設(shè)置熱循環(huán)條件
設(shè)置溫度和時(shí)間:
變性溫度:通常設(shè)置在94-98°C之間。
退火溫度:根據(jù)引物的Tm值,通常設(shè)置在50-65°C之間。
擴(kuò)增溫度:一般設(shè)置為72°C(適用于大多數(shù)DNA聚合酶)。
延伸時(shí)間:根據(jù)PCR產(chǎn)物的長度設(shè)定,通常設(shè)置為每千堿基15秒。
設(shè)置循環(huán)次數(shù):
熔解曲線分析(可選):
四、選擇熒光檢測(cè)通道
選擇適當(dāng)?shù)臒晒馊玖?/strong>:
設(shè)置熒光信號(hào)采集時(shí)間點(diǎn):
五、啟動(dòng)實(shí)驗(yàn)
檢查所有設(shè)置:
儀器運(yùn)行:
六、數(shù)據(jù)分析
實(shí)驗(yàn)完成后查看數(shù)據(jù):
數(shù)據(jù)分析選項(xiàng):
Ct值分析:根據(jù)熒光信號(hào)的變化,自動(dòng)計(jì)算各樣本的Ct值,并進(jìn)行基因定量。
標(biāo)準(zhǔn)曲線分析:如果需要定量分析樣本的濃度,可以通過標(biāo)準(zhǔn)曲線法進(jìn)行分析。
熔解曲線分析:對(duì)PCR產(chǎn)物進(jìn)行熔解曲線分析,檢查擴(kuò)增產(chǎn)物的特異性。
導(dǎo)出數(shù)據(jù):
七、實(shí)驗(yàn)結(jié)束后的注意事項(xiàng)
清潔儀器:
保存實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù):
檢查儀器運(yùn)行狀態(tài):
八、常見問題及解決方法
信號(hào)過低或過高:
非特異性擴(kuò)增:
實(shí)驗(yàn)反應(yīng)失敗:
總結(jié)
操作賽默飛熒光定量PCR儀需要按步驟配置實(shí)驗(yàn)程序、設(shè)置反應(yīng)體系、選擇合適的熱循環(huán)條件和熒光探針通道。儀器的智能化設(shè)計(jì)使得操作相對(duì)簡便,但仍然需要細(xì)致地檢查設(shè)置和反應(yīng)體系,確保實(shí)驗(yàn)的順利進(jìn)行。通過合理設(shè)置和分析,您可以得到高質(zhì)量的定量PCR結(jié)果。